MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	TA	3	6	92	97	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018627	AG	3	6	17696	17701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018627	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018627	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018627	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018627	TG	3	6	63302	63307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018627	GA	3	6	97067	97072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018627	GA	3	6	98976	98981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018627	AG	3	6	101787	101792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018627	TA	3	6	108455	108460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018627	AG	3	6	112360	112365	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018627	AT	3	6	123206	123211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018627	TA	4	8	125320	125327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018627	TG	4	8	128423	128430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018627	AC	3	6	128557	128562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018627	AT	3	6	130234	130239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018627	TA	3	6	130517	130522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018627	CT	3	6	130613	130618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018627	CT	3	6	130744	130749	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018627	AT	3	6	131633	131638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018627	GA	3	6	134356	134361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018627	CA	3	6	147141	147146	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018627	AT	3	6	147206	147211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018627	GT	3	6	148821	148826	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018627	GT	3	6	148845	148850	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018627	AG	3	6	158078	158083	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018627	TA	3	6	173166	173171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018627	AG	3	6	173210	173215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018627	AT	3	6	175404	175409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018627	AG	3	6	179472	179477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018627	CT	3	6	193712	193717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018627	AC	3	6	199236	199241	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018627	AT	3	6	210360	210365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018627	AT	3	6	213244	213249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018627	AT	3	6	215436	215441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018627	GA	3	6	215496	215501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018627	GT	3	6	215536	215541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018627	CT	3	6	215573	215578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018627	AG	3	6	215802	215807	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018627	TC	3	6	215861	215866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018627	AG	3	6	222920	222925	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018627	TA	4	8	232255	232262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018627	AG	3	6	237000	237005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018627	AT	3	6	237070	237075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018627	GA	3	6	239889	239894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018627	AG	3	6	241098	241103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018627	AG	3	6	244064	244069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018627	GT	3	6	261606	261611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018627	TC	3	6	266717	266722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018627	AT	4	8	266755	266762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018627	TC	3	6	267859	267864	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018627	TG	3	6	268005	268010	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018627	TG	3	6	276789	276794	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018627	GT	3	6	277631	277636	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018627	TC	3	6	281935	281940	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018627	TA	3	6	281984	281989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018627	TC	3	6	301473	301478	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018627	AC	3	6	310554	310559	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_018627	AG	3	6	313538	313543	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018627	GA	3	6	313588	313593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018627	AC	3	6	319093	319098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018627	TG	3	6	327153	327158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018627	GA	3	6	327199	327204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018627	AG	3	6	330117	330122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018627	TC	3	6	339591	339596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_018627	TA	3	6	341583	341588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018627	AC	3	6	341633	341638	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_018627	TA	3	6	342584	342589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018627	TG	3	6	344891	344896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018627	GT	3	6	345021	345026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018627	TG	3	6	346548	346553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018627	CT	3	6	348099	348104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018627	TA	3	6	348172	348177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018627	TA	3	6	349583	349588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018627	TA	3	6	353750	353755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018627	CT	4	8	356368	356375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018627	AT	3	6	365050	365055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018627	TA	3	6	367691	367696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018627	AG	3	6	368697	368702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018627	AT	3	6	372090	372095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018627	TG	3	6	372340	372345	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018627	CT	3	6	373667	373672	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_018627	TA	3	6	384211	384216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018627	AC	3	6	388267	388272	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018627	TA	3	6	398808	398813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018627	CT	3	6	410880	410885	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018627	TC	3	6	418870	418875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018627	AT	3	6	422752	422757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018627	GA	3	6	427085	427090	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018627	GA	3	6	437814	437819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018627	TC	3	6	442341	442346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018627	AG	3	6	444310	444315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018627	CT	3	6	444381	444386	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018627	TA	3	6	445498	445503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018627	CT	3	6	446781	446786	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018627	TC	3	6	452411	452416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_018627	TG	3	6	457737	457742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018627	AG	3	6	457886	457891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018627	CT	4	8	460767	460774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_018627	AG	3	6	467596	467601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018627	AG	3	6	474165	474170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018627	TA	3	6	475480	475485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_018627	AG	3	6	478356	478361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018627	TA	3	6	478436	478441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018627	CT	3	6	484852	484857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018627	AG	4	8	486840	486847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018627	TC	3	6	488422	488427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018627	TA	3	6	491184	491189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018627	AT	3	6	496525	496530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018627	GA	3	6	501702	501707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018627	TC	3	6	503154	503159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018627	AT	3	6	510893	510898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018627	AT	3	6	510931	510936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018627	AG	3	6	517616	517621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018627	GT	3	6	526630	526635	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018627	GA	3	6	533796	533801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018627	CT	4	8	542891	542898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_018627	AT	3	6	553958	553963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018627	TG	3	6	558191	558196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018627	GT	3	6	561915	561920	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018627	GA	3	6	587163	587168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018627	TG	3	6	587269	587274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018627	AC	3	6	587415	587420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018627	AG	3	6	587639	587644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018627	AC	3	6	598093	598098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_018627	GT	3	6	598113	598118	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018627	AG	3	6	598224	598229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018627	TC	3	6	598408	598413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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131	NC_018627	TA	4	8	601208	601215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018627	GA	5	10	618295	618304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018627	CT	3	6	618340	618345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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135	NC_018627	AC	3	6	624698	624703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018627	TA	3	6	626492	626497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018627	AT	3	6	626512	626517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_018627	TA	3	6	631581	631586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018627	GA	3	6	642208	642213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018627	TA	3	6	642600	642605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018627	TA	3	6	642610	642615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018627	TA	3	6	642710	642715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018627	AT	3	6	643864	643869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_018627	AT	3	6	652467	652472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018627	TA	3	6	652726	652731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018627	TA	3	6	653401	653406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018627	TC	3	6	655211	655216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.