MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci MN chromosome

Total Repeats: 1320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018627	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018627	AGA	3	9	74	82	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018627	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018627	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018627	TAT	2	6	3055	3060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018627	ATT	3	9	3070	3078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018627	TGT	2	6	3083	3088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018627	CAA	2	6	5335	5340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018627	TTG	2	6	5346	5351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018627	GAA	2	6	6878	6883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018627	ATA	2	6	13424	13429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018627	AAT	2	6	16849	16854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018627	TTA	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018627	AAT	2	6	17007	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018627	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018627	GTT	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018627	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018627	TTA	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018627	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018627	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018627	TAA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018627	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018627	TTC	2	6	23766	23771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_018627	AGA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018627	TTG	2	6	30765	30770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018627	AGG	2	6	31745	31750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018627	AGA	2	6	31968	31973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018627	CTT	2	6	31983	31988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_018627	AAT	2	6	32408	32413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018627	TTA	2	6	33429	33434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018627	AAG	2	6	33450	33455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018627	TGT	3	9	33523	33531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018627	AAG	2	6	33568	33573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018627	TGG	2	6	34225	34230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018627	TTC	2	6	37584	37589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018627	TTC	2	6	37625	37630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018627	TGC	2	6	37673	37678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018627	AGA	2	6	37863	37868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018627	TAT	2	6	38098	38103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018627	GAA	2	6	39474	39479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018627	TTA	2	6	42380	42385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018627	GAA	2	6	42402	42407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018627	AGT	2	6	42691	42696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018627	CAA	2	6	42766	42771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018627	GTT	2	6	43443	43448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018627	GAC	2	6	44135	44140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018627	ACG	2	6	44170	44175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_018627	GTC	2	6	44211	44216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_018627	GAA	2	6	49506	49511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018627	GAT	2	6	52225	52230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018627	TCG	2	6	52292	52297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018627	TTG	2	6	52307	52312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018627	GTC	2	6	52411	52416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018627	AAG	2	6	52511	52516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018627	AAT	2	6	54527	54532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018627	GTT	2	6	57778	57783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018627	TGG	2	6	57858	57863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018627	GGT	2	6	58087	58092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018627	GGC	2	6	59445	59450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_018627	GAG	2	6	59504	59509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018627	ATT	2	6	59553	59558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018627	TTA	2	6	59580	59585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018627	TAA	2	6	59654	59659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018627	AGA	2	6	59730	59735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018627	CTA	2	6	59969	59974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018627	CAA	2	6	63293	63298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018627	TTG	2	6	64374	64379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018627	GAA	2	6	64401	64406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018627	TCC	2	6	64486	64491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_018627	AAT	2	6	64632	64637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018627	ATA	2	6	71234	71239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018627	TTA	3	9	74086	74094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018627	ATC	2	6	76083	76088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018627	TCA	2	6	77408	77413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018627	TTC	2	6	77485	77490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018627	TAT	2	6	77517	77522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018627	TAT	2	6	77776	77781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018627	AGA	2	6	80492	80497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018627	AAT	2	6	80588	80593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018627	GTA	2	6	83316	83321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018627	TCC	2	6	83343	83348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018627	TTA	2	6	83422	83427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018627	AAT	2	6	83429	83434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018627	AGT	2	6	83442	83447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018627	ATC	2	6	84790	84795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_018627	GTT	2	6	87380	87385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018627	ATA	2	6	93329	93334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018627	AGA	2	6	93361	93366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018627	ATC	2	6	93410	93415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_018627	AGA	2	6	93513	93518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018627	AAG	2	6	93550	93555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018627	TAA	2	6	93557	93562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018627	AAT	2	6	93636	93641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018627	TTG	2	6	93674	93679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018627	GGT	2	6	93683	93688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018627	GTT	2	6	93953	93958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018627	AAG	2	6	98665	98670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018627	TCT	2	6	98937	98942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018627	GCT	2	6	99211	99216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018627	ACA	2	6	99267	99272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018627	ATG	2	6	99369	99374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018627	ATA	2	6	99422	99427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018627	GTT	2	6	99455	99460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018627	ACT	2	6	99527	99532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018627	ATC	2	6	99549	99554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018627	TAG	2	6	99583	99588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018627	TTC	2	6	99688	99693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018627	TTC	2	6	100467	100472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_018627	GTT	2	6	100525	100530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018627	ACT	2	6	101726	101731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018627	CAA	2	6	101776	101781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018627	TCT	2	6	108310	108315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018627	AAC	2	6	108430	108435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018627	TGT	2	6	108564	108569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018627	AGA	2	6	109129	109134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018627	GAA	2	6	110180	110185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018627	ATT	2	6	112371	112376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018627	GAG	2	6	119152	119157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018627	ACT	2	6	120753	120758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018627	TCT	2	6	122637	122642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018627	AGT	2	6	122666	122671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018627	AAT	2	6	122763	122768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018627	ATT	2	6	122783	122788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018627	TGG	2	6	122796	122801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018627	GCG	2	6	123121	123126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018627	TTC	3	9	123184	123192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018627	TCC	2	6	125285	125290	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018627	TAC	2	6	125297	125302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018627	TGT	2	6	125304	125309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018627	AAT	2	6	125760	125765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018627	ATT	2	6	128303	128308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018627	TTA	2	6	128338	128343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018627	TGT	2	6	128534	128539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018627	ACA	2	6	128606	128611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018627	TAC	2	6	128622	128627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_018627	CTT	2	6	130357	130362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018627	ATT	2	6	130464	130469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018627	AGG	2	6	130484	130489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018627	TAA	2	6	130643	130648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018627	TAA	2	6	130777	130782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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