MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018626	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018626	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018626	TC	3	6	31851	31856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018626	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018626	TA	3	6	52214	52219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018626	TG	3	6	63276	63281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018626	GA	3	6	97038	97043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018626	GA	3	6	98947	98952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018626	AG	3	6	101758	101763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018626	TA	3	6	108427	108432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018626	AG	3	6	112332	112337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018626	AT	3	6	123178	123183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018626	TA	4	8	124024	124031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018626	TA	4	8	125291	125298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018626	TG	4	8	128394	128401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018626	AC	3	6	128528	128533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_018626	AT	3	6	130205	130210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018626	TA	3	6	130488	130493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018626	CT	3	6	130584	130589	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_018626	CT	3	6	130715	130720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018626	GA	3	6	134327	134332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018626	AG	3	6	158049	158054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018626	TA	3	6	173138	173143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018626	AG	3	6	173182	173187	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018626	AT	3	6	175378	175383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018626	AG	3	6	179438	179443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018626	GA	3	6	185526	185531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018626	CT	3	6	193680	193685	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018626	CA	3	6	195488	195493	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_018626	AT	3	6	210330	210335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018626	AT	3	6	213214	213219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018626	AT	3	6	215406	215411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018626	GA	3	6	215466	215471	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018626	GT	3	6	215506	215511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018626	CT	3	6	215543	215548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018626	AG	3	6	215771	215776	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018626	TC	3	6	215830	215835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_018626	AG	3	6	222874	222879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018626	TA	4	8	232211	232218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018626	AG	3	6	236956	236961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018626	AT	3	6	237026	237031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018626	AG	3	6	241055	241060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018626	AG	3	6	244021	244026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018626	GT	3	6	261564	261569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018626	TG	3	6	267953	267958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018626	TG	3	6	276737	276742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018626	GT	3	6	277579	277584	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018626	TC	3	6	281901	281906	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018626	TA	3	6	281953	281958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018626	GA	3	6	301399	301404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018626	TC	3	6	301429	301434	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_018626	AC	3	6	310498	310503	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018626	GA	3	6	312450	312455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018626	GA	3	6	313484	313489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018626	AC	3	6	318989	318994	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018626	TG	3	6	321713	321718	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018626	GA	3	6	321758	321763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018626	TA	3	6	324529	324534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018626	AG	3	6	324676	324681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018626	TC	3	6	334111	334116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018626	TA	3	6	337105	337110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018626	GT	3	6	339550	339555	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018626	CT	3	6	342593	342598	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018626	TA	3	6	342666	342671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018626	TA	3	6	348247	348252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018626	CT	3	6	350865	350870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_018626	TA	3	6	354354	354359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018626	AT	3	6	359546	359551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018626	TA	3	6	362187	362192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018626	AG	3	6	363193	363198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018626	AT	3	6	366586	366591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018626	CT	3	6	368163	368168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018626	TA	3	6	378707	378712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018626	AC	3	6	382764	382769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_018626	TA	3	6	393308	393313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018626	CT	3	6	405384	405389	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018626	TC	3	6	413374	413379	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_018626	AT	3	6	417256	417261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018626	GA	3	6	421589	421594	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018626	GA	3	6	432320	432325	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018626	TC	3	6	437124	437129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018626	AG	3	6	439753	439758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018626	TA	3	6	440297	440302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018626	CT	3	6	441580	441585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018626	TG	3	6	452536	452541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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87	NC_018626	CT	4	8	455565	455572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018626	TA	3	6	457337	457342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018626	AG	3	6	462409	462414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018626	AG	3	6	468982	468987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018626	AG	3	6	473208	473213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018626	TA	3	6	473288	473293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018626	CT	3	6	479706	479711	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018626	AG	4	8	481694	481701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018626	TC	3	6	483266	483271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018626	TA	3	6	486028	486033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018626	AT	3	6	491372	491377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018626	GT	3	6	494209	494214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018626	GA	3	6	496549	496554	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018626	TC	3	6	498001	498006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018626	AT	3	6	505741	505746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018626	AT	3	6	505779	505784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018626	AG	3	6	512464	512469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018626	GT	3	6	521478	521483	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018626	GA	3	6	528645	528650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018626	CT	4	8	537740	537747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018626	AT	3	6	548805	548810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018626	GT	3	6	556762	556767	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018626	TG	3	6	581997	582002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018626	GA	3	6	582008	582013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018626	TG	3	6	582114	582119	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018626	AC	3	6	582260	582265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018626	AG	3	6	582484	582489	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018626	AC	3	6	592946	592951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_018626	GT	3	6	592966	592971	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018626	AG	3	6	593077	593082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018626	TC	3	6	593261	593266	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018626	AT	3	6	595917	595922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018626	GA	3	6	601595	601600	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018626	GA	5	10	613192	613201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018626	CT	3	6	613237	613242	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_018626	CT	3	6	614622	614627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018626	AC	3	6	619581	619586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018626	TA	3	6	621376	621381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018626	AT	3	6	621395	621400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018626	CT	3	6	623728	623733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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128	NC_018626	TA	3	6	637481	637486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018626	TA	3	6	637580	637585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018626	AT	3	6	638733	638738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018626	AT	3	6	646167	646172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018626	AT	3	6	647347	647352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018626	TA	3	6	647606	647611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018626	TA	3	6	648285	648290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018626	AT	3	6	649353	649358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018626	CT	3	6	650260	650265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018626	AG	3	6	653878	653883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018626	TA	3	6	653936	653941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018626	CA	3	6	656646	656651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018626	AT	3	6	667825	667830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018626	CT	3	6	668029	668034	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_018626	CT	3	6	680167	680172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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148	NC_018626	CT	3	6	696249	696254	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_018626	GA	4	8	696648	696655	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018626	TA	3	6	697078	697083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018626	TA	3	6	698259	698264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018626	AT	3	6	699998	700003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.