MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 2683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018626	A	6	6	649344	649349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1503	NC_018626	TTA	2	6	649377	649382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018626	TAA	2	6	649388	649393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018626	AAT	2	6	649415	649420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018626	ATA	2	6	649428	649433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018626	A	6	6	649447	649452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018626	AATG	2	8	649934	649941	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018626	TAG	2	6	649995	650000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018626	GAA	2	6	650081	650086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018626	T	6	6	650119	650124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018626	A	6	6	650157	650162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018626	GAA	3	9	650192	650200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018626	TAA	2	6	650201	650206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018626	CT	3	6	650260	650265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1517	NC_018626	T	6	6	650831	650836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1520	NC_018626	AGT	2	6	651764	651769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018626	ATT	2	6	652916	652921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018626	ATT	2	6	652945	652950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018626	ATAA	2	8	652960	652967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018626	TTTA	2	8	652981	652988	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018626	ATTCT	2	10	653090	653099	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1526	NC_018626	TCT	2	6	653115	653120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1530	NC_018626	TAT	2	6	653682	653687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1532	NC_018626	GTC	2	6	653844	653849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1534	NC_018626	AG	3	6	653878	653883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018626	T	8	8	653927	653934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018626	TA	3	6	653936	653941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1544	NC_018626	TAT	2	6	655455	655460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1549	NC_018626	AAATA	2	10	656660	656669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_018626	A	7	7	656669	656675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018626	CTAAG	2	10	659635	659644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1553	NC_018626	A	6	6	659674	659679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018626	TAA	2	6	659693	659698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018626	A	6	6	659731	659736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1564	NC_018626	TCA	2	6	660727	660732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1575	NC_018626	A	6	6	664445	664450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1592	NC_018626	A	8	8	669597	669604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1606	NC_018626	CAT	2	6	673570	673575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1608	NC_018626	GAT	2	6	677567	677572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1614	NC_018626	CTG	2	6	680240	680245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1621	NC_018626	A	7	7	684316	684322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_018626	AGAA	2	8	685369	685376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1625	NC_018626	GC	3	6	686998	687003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_018626	ACT	2	6	687053	687058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_018626	A	6	6	691538	691543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018626	AT	3	6	691593	691598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018626	TAAT	2	8	691622	691629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1631	NC_018626	TCT	2	6	695549	695554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_018626	AAGGGA	2	12	695578	695589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018626	AAG	2	6	695614	695619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_018626	CTT	2	6	695646	695651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_018626	ACA	2	6	695667	695672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_018626	TG	3	6	695684	695689	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_018626	TCA	2	6	695691	695696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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