MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci NJ1 chromosome

Total Repeats: 2683

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018626	TC	3	6	215830	215835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_018626	A	6	6	217383	217388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018626	ATA	2	6	222866	222871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018626	AG	3	6	222874	222879	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018626	AAGA	2	8	222881	222888	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018626	AGA	2	6	225844	225849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018626	ATAAA	2	10	225850	225859	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018626	A	6	6	225871	225876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018626	T	8	8	225926	225933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018626	G	6	6	225991	225996	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018626	CTT	2	6	226317	226322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_018626	AAT	2	6	226663	226668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018626	AACA	2	8	226701	226708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_018626	ATTTT	2	10	226709	226718	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018626	TTA	2	6	226719	226724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018626	A	8	8	226757	226764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018626	TAA	2	6	226782	226787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018626	TAAAGA	2	12	226794	226805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018626	TAA	2	6	226818	226823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018626	A	6	6	226862	226867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018626	A	6	6	228248	228253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018626	T	7	7	228254	228260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018626	AAG	2	6	228287	228292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018626	TAT	2	6	228303	228308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018626	T	6	6	229191	229196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018626	ATA	2	6	229211	229216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018626	CCT	2	6	229685	229690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_018626	ATA	2	6	229713	229718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018626	T	8	8	229760	229767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_018626	A	6	6	232191	232196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_018626	ATTA	2	8	232205	232212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018626	TA	4	8	232211	232218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018626	T	6	6	232222	232227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018626	T	6	6	232258	232263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018626	GAT	2	6	232275	232280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018626	GCG	2	6	232289	232294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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539	NC_018626	AT	3	6	237026	237031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018626	CTA	2	6	237135	237140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_018626	CTTG	2	8	238130	238137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
542	NC_018626	GAAT	2	8	238181	238188	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018626	GAA	3	9	238195	238203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018626	T	6	6	238218	238223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018626	AAG	2	6	238227	238232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018626	T	7	7	238242	238248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_018626	AAG	2	6	238281	238286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018626	ACC	2	6	238300	238305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_018626	AATT	2	8	238320	238327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018626	GAT	2	6	238361	238366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018626	TTTC	2	8	238420	238427	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
552	NC_018626	GTT	2	6	238448	238453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018626	A	8	8	238488	238495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018626	AGA	2	6	238530	238535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018626	ATTATA	2	12	239662	239673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018626	A	6	6	239698	239703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018626	TAT	2	6	239762	239767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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559	NC_018626	A	6	6	239880	239885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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561	NC_018626	GCA	2	6	239908	239913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_018626	T	6	6	240125	240130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018626	GTTT	2	8	240853	240860	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018626	TAG	2	6	240921	240926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_018626	AG	3	6	241055	241060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018626	TAT	2	6	241071	241076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018626	TCAT	2	8	241083	241090	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
569	NC_018626	ATA	2	6	241098	241103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_018626	TTGAAT	2	12	243977	243988	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018626	AGGA	2	8	244013	244020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018626	AG	3	6	244021	244026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018626	T	7	7	244035	244041	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018626	AAG	2	6	247811	247816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018626	ACA	2	6	249710	249715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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580	NC_018626	GAA	2	6	252241	252246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018626	AAT	2	6	252274	252279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018626	T	8	8	252290	252297	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018626	TTG	2	6	252989	252994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018626	TGA	2	6	253042	253047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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588	NC_018626	A	7	7	253152	253158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018626	TAT	2	6	255801	255806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_018626	TTTAA	2	10	255843	255852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018626	AAGAT	2	10	255917	255926	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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595	NC_018626	A	6	6	261708	261713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018626	ATATAA	2	12	261729	261740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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598	NC_018626	TGA	2	6	262955	262960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018626	TAAA	2	8	262971	262978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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602	NC_018626	T	8	8	263009	263016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018626	GTT	2	6	266539	266544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_018626	GTTC	2	8	266658	266665	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
606	NC_018626	TAAT	2	8	266761	266768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018626	AATT	2	8	266776	266783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018626	GAAGA	2	10	267599	267608	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018626	T	9	9	267636	267644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018626	GGGAAA	2	12	267685	267696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018626	GAC	2	6	267712	267717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_018626	ATT	2	6	267817	267822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018626	T	7	7	267843	267849	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018626	TAAT	2	8	267854	267861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018626	TTA	2	6	267882	267887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_018626	TG	3	6	267953	267958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018626	TAAA	2	8	267968	267975	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018626	T	9	9	272671	272679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018626	TTA	2	6	272682	272687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018626	TTAA	2	8	274586	274593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018626	TTGT	2	8	274596	274603	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018626	TAAAA	2	10	274615	274624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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627	NC_018626	T	6	6	274836	274841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018626	T	6	6	274849	274854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018626	AGG	2	6	274864	274869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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631	NC_018626	GTT	2	6	274890	274895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018626	GAT	2	6	276280	276285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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634	NC_018626	AAG	2	6	276331	276336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018626	GAA	2	6	276561	276566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018626	T	6	6	276634	276639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018626	AAAT	2	8	276641	276648	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018626	TTA	2	6	276660	276665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018626	TG	3	6	276737	276742	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018626	AAG	2	6	277497	277502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
641	NC_018626	AGA	2	6	277530	277535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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