MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci CP3 chromosome

Total Repeats: 2893

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018625	TAG	2	6	205249	205254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018625	TTTA	2	8	205658	205665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018625	ATA	2	6	206168	206173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018625	AAC	2	6	210247	210252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_018625	AT	3	6	210359	210364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_018625	ATT	2	6	210368	210373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018625	ATT	2	6	210405	210410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018625	A	6	6	210434	210439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018625	T	6	6	210447	210452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018625	TTTTTA	2	12	210480	210491	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018625	GAA	2	6	210531	210536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018625	GTC	2	6	211071	211076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_018625	T	6	6	211160	211165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018625	GTTT	2	8	211869	211876	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018625	T	6	6	211888	211893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018625	TTG	2	6	212989	212994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018625	ATC	2	6	213069	213074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_018625	TGC	2	6	213185	213190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_018625	AGC	2	6	213198	213203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_018625	CAT	2	6	213239	213244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_018625	AT	3	6	213243	213248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018625	AAAG	2	8	213264	213271	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018625	TAC	2	6	213290	213295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_018625	GGT	2	6	213344	213349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018625	TCT	2	6	213468	213473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_018625	CATA	2	8	213541	213548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_018625	CCT	2	6	213600	213605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_018625	ATGT	2	8	213657	213664	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018625	ACA	2	6	213669	213674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018625	GCC	2	6	213699	213704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_018625	AAG	2	6	213709	213714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018625	A	7	7	213743	213749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018625	AAG	2	6	215283	215288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018625	TGA	2	6	215320	215325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018625	TAA	2	6	215357	215362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018625	T	6	6	215390	215395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018625	AT	3	6	215435	215440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018625	GA	3	6	215495	215500	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018625	GT	3	6	215535	215540	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018625	CT	3	6	215572	215577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_018625	T	8	8	215600	215607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018625	T	6	6	215665	215670	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018625	T	6	6	215711	215716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018625	A	6	6	215762	215767	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018625	AG	3	6	215801	215806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018625	TC	3	6	215860	215865	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_018625	ATA	2	6	222911	222916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018625	AG	3	6	222919	222924	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018625	AAGA	2	8	222926	222933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018625	AGA	2	6	225889	225894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018625	ATAAA	2	10	225895	225904	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018625	A	6	6	225916	225921	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018625	T	8	8	225971	225978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018625	G	6	6	226036	226041	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
555	NC_018625	CTT	2	6	226362	226367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018625	CACG	2	8	226676	226683	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018625	AAT	2	6	226706	226711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018625	AACA	2	8	226744	226751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
559	NC_018625	ATTTT	2	10	226752	226761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018625	TTA	2	6	226762	226767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018625	A	8	8	226800	226807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018625	TAA	2	6	226825	226830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018625	TAAAGA	2	12	226837	226848	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018625	TAA	2	6	226861	226866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018625	A	6	6	226905	226910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018625	A	6	6	228291	228296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018625	T	7	7	228297	228303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018625	AAG	2	6	228330	228335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018625	TAT	2	6	228346	228351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018625	T	6	6	229234	229239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018625	ATA	2	6	229254	229259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018625	CCT	2	6	229728	229733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_018625	ATA	2	6	229756	229761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018625	T	8	8	229803	229810	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018625	A	6	6	232234	232239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018625	ATTA	2	8	232248	232255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018625	TA	4	8	232254	232261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018625	T	6	6	232265	232270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018625	T	6	6	232301	232306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018625	GAT	2	6	232318	232323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018625	GCG	2	6	232332	232337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_018625	GAT	2	6	232375	232380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_018625	T	6	6	235971	235976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018625	AG	3	6	236999	237004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018625	AT	3	6	237069	237074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018625	CTA	2	6	237178	237183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_018625	CTTG	2	8	238173	238180	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
588	NC_018625	GAAT	2	8	238224	238231	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018625	GAA	3	9	238238	238246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
590	NC_018625	T	6	6	238261	238266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018625	AAG	2	6	238270	238275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018625	T	7	7	238285	238291	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018625	AAG	2	6	238324	238329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018625	ACC	2	6	238343	238348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_018625	AATT	2	8	238363	238370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018625	GAT	2	6	238404	238409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018625	AGA	2	6	238574	238579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018625	ATTATA	2	12	239706	239717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018625	A	6	6	239741	239746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018625	CTT	2	6	239778	239783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_018625	TAT	2	6	239805	239810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018625	ATAA	2	8	239846	239853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018625	GA	3	6	239888	239893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018625	A	6	6	239923	239928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018625	GCA	2	6	239941	239946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_018625	GCA	2	6	239951	239956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018625	T	6	6	240167	240172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018625	TCA	2	6	240174	240179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_018625	GAA	2	6	240203	240208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018625	GTTT	2	8	240896	240903	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018625	TAG	2	6	240964	240969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018625	A	7	7	241056	241062	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018625	AG	3	6	241098	241103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018625	TAT	2	6	241114	241119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018625	TCAT	2	8	241126	241133	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_018625	ATA	2	6	241141	241146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018625	TGT	2	6	242662	242667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018625	TTGAAT	2	12	244020	244031	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018625	AGGA	2	8	244056	244063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018625	AG	3	6	244064	244069	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018625	T	7	7	244078	244084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018625	AAG	2	6	247854	247859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018625	AAT	2	6	250167	250172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018625	T	6	6	250225	250230	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018625	GAA	2	6	252284	252289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018625	AAT	2	6	252317	252322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018625	T	8	8	252333	252340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018625	TTG	2	6	253032	253037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018625	TGA	2	6	253085	253090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018625	T	6	6	253116	253121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018625	T	7	7	253165	253171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018625	T	6	6	253187	253192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018625	A	7	7	253195	253201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018625	TAT	2	6	255844	255849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_018625	TTG	2	6	255874	255879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_018625	TTTAA	2	10	255886	255895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018625	AAGAT	2	10	255960	255969	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018625	TGA	2	6	257107	257112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018625	T	6	6	261585	261590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018625	GT	3	6	261608	261613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_018625	A	6	6	261751	261756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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