MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	ATTTAA	2	12	33596	33607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018624	TTTTAA	2	12	42719	42730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018624	ATTATA	2	12	77741	77752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018624	TTTCTT	2	12	123014	123025	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018624	TTCCGT	2	12	148003	148014	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_018624	AGAAAA	2	12	163038	163049	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018624	TTTTTA	2	12	210450	210461	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018624	TAAAGA	2	12	226806	226817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018624	ATTATA	2	12	239674	239685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018624	TTGAAT	2	12	243987	243998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018624	ATATAA	2	12	261738	261749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018624	GGGAAA	2	12	267703	267714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018624	TAAGAA	2	12	277621	277632	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018624	TAAAAT	2	12	291808	291819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018624	TGAAAA	2	12	337198	337209	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018624	ATTTTT	2	12	371583	371594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018624	AAAATC	2	12	396591	396602	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018624	AAAAAT	2	12	470564	470575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018624	TATAAT	2	12	490015	490026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018624	TTAATT	2	12	507710	507721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018624	AAATAA	2	12	587531	587542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018624	CTTTTG	2	12	656455	656466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_018624	AAATAC	2	12	662011	662022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018624	CAATCT	2	12	662597	662608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018624	AAGGGA	2	12	703694	703705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018624	ATTAAT	2	12	706384	706395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018624	TAAAAG	2	12	739932	739943	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018624	ATTTTA	2	12	752624	752635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018624	TAACCT	2	12	794003	794014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018624	CTATGT	2	12	814284	814295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_018624	TTGATT	2	12	820959	820970	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018624	ATTTTA	2	12	951433	951444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018624	ATCTAT	2	12	966723	966734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_018624	ATAAAA	2	12	983171	983182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018624	TTTTCT	2	12	1014127	1014138	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_018624	AAATAA	2	12	1019346	1019357	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018624	TCGCTT	2	12	1022164	1022175	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018624	TTATCC	2	12	1023068	1023079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018624	AAATTT	2	12	1025217	1025228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018624	CTTTGT	2	12	1036659	1036670	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018624	AAAAAT	2	12	1056933	1056944	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018624	TTTTAA	2	12	1059859	1059870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018624	TAATTT	2	12	1103561	1103572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018624	AAAATA	2	12	1142059	1142070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018624	TACAGA	2	12	1154737	1154748	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_018624	GTTAAA	2	12	1167663	1167674	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018624	CCTTCG	2	12	1170451	1170462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.