MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 1313

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018624	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018624	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018624	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018624	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018624	TAT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018624	ATT	3	9	3072	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018624	TGT	2	6	3085	3090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018624	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018624	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018624	GAA	2	6	6880	6885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018624	AAT	2	6	16849	16854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018624	TTA	2	6	16929	16934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018624	AAT	2	6	17007	17012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018624	TCC	2	6	18547	18552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018624	GTT	2	6	20322	20327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018624	TCC	2	6	20328	20333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018624	TTA	2	6	20338	20343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018624	TCT	2	6	20386	20391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018624	AAT	2	6	20399	20404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018624	TAA	2	6	21722	21727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018624	TAA	2	6	21786	21791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018624	AGA	2	6	23901	23906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018624	GAA	2	6	29419	29424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018624	AGG	2	6	31744	31749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018624	AGA	2	6	31967	31972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018624	CTT	2	6	31982	31987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018624	AAT	2	6	32407	32412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018624	TTA	2	6	33428	33433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018624	AAG	2	6	33449	33454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018624	TGT	3	9	33528	33536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018624	AAG	2	6	33573	33578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018624	TGG	2	6	34230	34235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018624	TTC	2	6	37589	37594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_018624	TTC	2	6	37630	37635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018624	TGC	2	6	37678	37683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018624	AGA	2	6	37868	37873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018624	TAT	2	6	38103	38108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018624	GAA	2	6	39479	39484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018624	TTA	2	6	42385	42390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018624	GAA	2	6	42407	42412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018624	AGT	2	6	42696	42701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018624	CAA	2	6	42771	42776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018624	GTT	2	6	43448	43453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018624	GAC	2	6	44140	44145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018624	ACG	2	6	44175	44180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_018624	GTC	2	6	44216	44221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018624	GAA	2	6	49511	49516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018624	GAT	2	6	52230	52235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018624	TCG	2	6	52297	52302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018624	TTG	2	6	52312	52317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018624	GTC	2	6	52416	52421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018624	AAG	2	6	52516	52521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018624	AAT	2	6	54532	54537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018624	TGG	2	6	57863	57868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018624	GGT	2	6	58093	58098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018624	GGC	2	6	59433	59438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018624	GAG	2	6	59492	59497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018624	ATT	2	6	59541	59546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018624	TTA	2	6	59568	59573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018624	TAA	2	6	59642	59647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018624	AGA	2	6	59718	59723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018624	CTA	2	6	59957	59962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018624	CAA	2	6	63281	63286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_018624	TTG	2	6	64362	64367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018624	GAA	2	6	64389	64394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018624	TCC	2	6	64474	64479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018624	AAT	2	6	64620	64625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018624	TGT	2	6	66136	66141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018624	ATT	2	6	66161	66166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018624	TTC	2	6	71001	71006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_018624	ATA	2	6	71222	71227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018624	TTA	3	9	74074	74082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018624	ATC	2	6	76071	76076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_018624	TCA	2	6	77396	77401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_018624	TTC	2	6	77473	77478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018624	TAT	2	6	77505	77510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018624	TAT	2	6	77764	77769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018624	AGA	2	6	80477	80482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018624	AAT	2	6	80573	80578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018624	GTA	2	6	83301	83306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018624	TCC	2	6	83328	83333	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018624	TTA	2	6	83407	83412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018624	AAT	2	6	83414	83419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018624	AGT	2	6	83427	83432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018624	GTT	2	6	87364	87369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018624	AGA	2	6	93497	93502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018624	AAG	2	6	93534	93539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018624	TAA	2	6	93541	93546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018624	AAT	2	6	93620	93625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018624	TTG	2	6	93658	93663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018624	GGT	2	6	93667	93672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018624	GTT	2	6	93937	93942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018624	AAG	2	6	98649	98654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018624	TCT	2	6	98921	98926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018624	GCT	2	6	99195	99200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018624	ACA	2	6	99251	99256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_018624	ATG	2	6	99353	99358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018624	ATA	2	6	99406	99411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018624	GTT	2	6	99439	99444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018624	ACT	2	6	99511	99516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_018624	ATC	2	6	99533	99538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018624	TAG	2	6	99567	99572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018624	TTC	2	6	99672	99677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018624	ACT	2	6	101710	101715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018624	CAA	2	6	101760	101765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_018624	TCT	2	6	108293	108298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018624	AAC	2	6	108413	108418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018624	AGA	2	6	109112	109117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018624	GAA	2	6	110163	110168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018624	ATT	2	6	112354	112359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018624	TAC	2	6	118314	118319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_018624	GAG	2	6	119135	119140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018624	ACT	2	6	120736	120741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018624	TCT	2	6	122620	122625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018624	AAT	2	6	122746	122751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018624	ATT	2	6	122766	122771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018624	TGG	2	6	122779	122784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018624	GCG	2	6	123104	123109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018624	TTC	3	9	123167	123175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018624	TCC	2	6	125268	125273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_018624	TAC	2	6	125280	125285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_018624	TGT	2	6	125287	125292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018624	AAT	2	6	125743	125748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018624	ATT	2	6	128286	128291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018624	TTA	2	6	128321	128326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018624	TGT	2	6	128517	128522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018624	ACA	2	6	128589	128594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_018624	TAC	2	6	128605	128610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_018624	CTT	2	6	130340	130345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018624	ATT	2	6	130447	130452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018624	AGG	2	6	130467	130472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018624	TAA	2	6	130626	130631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018624	TAA	2	6	130760	130765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018624	ATT	2	6	130776	130781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018624	TAA	2	6	130794	130799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018624	TTC	2	6	130871	130876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_018624	TGT	2	6	131425	131430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018624	CAA	2	6	131463	131468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_018624	TAT	2	6	131470	131475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018624	TAT	2	6	133279	133284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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