MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018624	TAT	2	6	645504	645509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018624	CTT	2	6	645537	645542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_018624	TA	3	6	645616	645621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018624	TAT	2	6	645626	645631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018624	A	6	6	645646	645651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018624	AAC	2	6	645656	645661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_018624	ATTA	2	8	645681	645688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018624	ATT	2	6	645706	645711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018624	TA	3	6	645716	645721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018624	TTA	2	6	645746	645751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_018624	TTG	2	6	646519	646524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018624	GTT	2	6	646579	646584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018624	AAC	2	6	646595	646600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_018624	TGA	2	6	646604	646609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018624	TAA	2	6	646797	646802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_018624	AT	3	6	646869	646874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018624	T	7	7	649406	649412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_018624	CTA	2	6	649462	649467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_018624	A	6	6	649915	649920	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018624	A	7	7	649933	649939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_018624	GAT	2	6	649985	649990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018624	A	8	8	654178	654185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_018624	GGA	2	6	654228	654233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_018624	AAT	2	6	654251	654256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018624	ATT	2	6	654265	654270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018624	ATCAA	2	10	654338	654347	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1527	NC_018624	CA	3	6	654392	654397	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1528	NC_018624	ACA	2	6	654464	654469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1529	NC_018624	GAA	2	6	655324	655329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_018624	GAA	2	6	655406	655411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_018624	TGTA	2	8	655415	655422	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018624	AAAG	2	8	655462	655469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_018624	AT	3	6	655473	655478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_018624	T	6	6	655598	655603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018624	A	7	7	655605	655611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018624	CAG	2	6	655672	655677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_018624	AGA	2	6	655700	655705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018624	A	8	8	655721	655728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_018624	TA	3	6	655732	655737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_018624	A	6	6	656306	656311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_018624	A	7	7	656319	656325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_018624	T	6	6	656398	656403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_018624	TA	3	6	656409	656414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018624	T	7	7	656418	656424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018624	GTT	2	6	656444	656449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018624	CTTTTG	2	12	656455	656466	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1547	NC_018624	TTG	2	6	657301	657306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_018624	TTTTA	2	10	657329	657338	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_018624	C	6	6	657344	657349	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1550	NC_018624	ATT	2	6	657382	657387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_018624	ATTT	2	8	657456	657463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018624	A	6	6	657471	657476	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_018624	ATA	2	6	657484	657489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_018624	A	7	7	657573	657579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_018624	AATG	2	8	658065	658072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018624	GTATT	2	10	658078	658087	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018624	TGA	2	6	658092	658097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_018624	CCT	2	6	658109	658114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1559	NC_018624	TAG	2	6	658126	658131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018624	AAC	2	6	658175	658180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_018624	TC	3	6	658219	658224	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1562	NC_018624	A	7	7	658268	658274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018624	AAC	2	6	658297	658302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_018624	AGA	2	6	658802	658807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018624	T	6	6	658898	658903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018624	TCC	2	6	658935	658940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_018624	TTC	2	6	659691	659696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_018624	TCC	2	6	659767	659772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1569	NC_018624	AGT	2	6	659831	659836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018624	TGA	2	6	660218	660223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018624	GCA	2	6	660253	660258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_018624	CTT	2	6	660263	660268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_018624	ACA	2	6	660357	660362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_018624	ATC	2	6	660371	660376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1578	NC_018624	ATT	2	6	661011	661016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018624	ATAA	2	8	661026	661033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_018624	TTTA	2	8	661047	661054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_018624	ATTCT	2	10	661156	661165	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1582	NC_018624	TCT	2	6	661181	661186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_018624	TCA	2	6	661650	661655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_018624	ACA	2	6	661709	661714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_018624	ATT	2	6	661735	661740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_018624	TAT	2	6	661748	661753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_018624	AAT	2	6	661757	661762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_018624	GTC	2	6	661910	661915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018624	A	6	6	661927	661932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018624	AG	3	6	661944	661949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_018624	TA	3	6	662000	662005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_018624	AAATAC	2	12	662011	662022	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1593	NC_018624	A	6	6	662511	662516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_018624	AAT	2	6	662528	662533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_018624	TTA	2	6	662551	662556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_018624	TAA	2	6	662573	662578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_018624	CAATCT	2	12	662597	662608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_018624	TAG	2	6	662611	662616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_018624	CATT	2	8	662626	662633	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1600	NC_018624	TAT	2	6	663519	663524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018624	TGA	2	6	663527	663532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018624	AAGAG	2	10	663545	663554	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018624	A	6	6	664643	664648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_018624	TCTTA	2	10	664693	664702	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1605	NC_018624	CA	3	6	664710	664715	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1606	NC_018624	AAATA	2	10	664724	664733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018624	A	7	7	664733	664739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018624	CTAAG	2	10	667699	667708	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1610	NC_018624	A	6	6	667738	667743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_018624	TAA	2	6	667757	667762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018624	A	7	7	667795	667801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_018624	ATG	2	6	668741	668746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_018624	TCT	2	6	668827	668832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_018624	TCA	2	6	668845	668850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1617	NC_018624	TTAAT	2	10	669585	669594	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_018624	TAA	2	6	669618	669623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_018624	A	6	6	669632	669637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1622	NC_018624	A	6	6	669694	669699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_018624	TGC	2	6	669718	669723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1627	NC_018624	T	7	7	672599	672605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1630	NC_018624	A	6	6	672661	672666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018624	CACAA	2	10	674127	674136	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1632	NC_018624	T	9	9	674154	674162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018624	ATT	2	6	674181	674186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_018624	T	6	6	674185	674190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018624	A	6	6	675866	675871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1637	NC_018624	TAAAA	2	10	675979	675988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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