MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018624	CAA	2	6	428211	428216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_018624	AGG	2	6	428239	428244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018624	A	6	6	428274	428279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018624	T	6	6	428345	428350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018624	T	6	6	428633	428638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018624	TTA	2	6	428640	428645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018624	TAT	2	6	429872	429877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018624	T	8	8	429877	429884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018624	AAT	2	6	429901	429906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018624	ATT	2	6	429926	429931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018624	GA	3	6	429960	429965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018624	TGT	2	6	429967	429972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018624	ATT	2	6	435488	435493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018624	ATA	2	6	435495	435500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018624	TTG	2	6	436023	436028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018624	GTC	2	6	436038	436043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_018624	ACGA	2	8	436079	436086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_018624	GAT	2	6	436183	436188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018624	TTTC	2	8	436244	436251	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_018624	TAT	2	6	436282	436287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018624	TCAT	2	8	436298	436305	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1022	NC_018624	GAG	2	6	438175	438180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018624	ATT	2	6	438197	438202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018624	T	8	8	438248	438255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018624	TTTA	2	8	438284	438291	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018624	T	7	7	440613	440619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018624	A	7	7	440620	440626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018624	GA	3	6	440694	440699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018624	T	6	6	440742	440747	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018624	TCT	2	6	440762	440767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_018624	CAA	2	6	440801	440806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_018624	TTA	2	6	440825	440830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018624	AGC	2	6	445171	445176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_018624	AAG	2	6	445180	445185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018624	TC	3	6	445227	445232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_018624	ATTTT	2	10	446708	446717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018624	GCT	2	6	446768	446773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_018624	TTA	2	6	446777	446782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018624	A	7	7	446805	446811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018624	ATA	2	6	447041	447046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018624	TAC	2	6	447075	447080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_018624	ATC	2	6	447141	447146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018624	AAC	2	6	447185	447190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018624	AG	3	6	447211	447216	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018624	TGAG	2	8	447264	447271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018624	CT	3	6	447282	447287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1047	NC_018624	AAT	2	6	447768	447773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018624	ATTA	2	8	448393	448400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018624	TA	3	6	448399	448404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018624	TTTA	2	8	448432	448439	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018624	CT	3	6	449682	449687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_018624	TTA	2	6	449696	449701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018624	TAT	2	6	449703	449708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018624	A	6	6	449718	449723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018624	A	6	6	449740	449745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018624	ATT	2	6	449756	449761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018624	AAG	2	6	449777	449782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018624	TTGA	2	8	449805	449812	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018624	TAA	2	6	454467	454472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1061	NC_018624	TTC	2	6	454510	454515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_018624	ATA	2	6	455364	455369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018624	T	6	6	455514	455519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018624	TGA	2	6	455576	455581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018624	GTG	2	6	455590	455595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_018624	A	8	8	455604	455611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018624	GCTTC	2	10	455622	455631	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1068	NC_018624	AGA	2	6	455680	455685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018624	AAG	2	6	459643	459648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018624	T	6	6	460207	460212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018624	TAAA	2	8	460263	460270	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018624	TCCT	2	8	460293	460300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_018624	CAT	2	6	460327	460332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_018624	T	7	7	460376	460382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018624	ATT	2	6	460410	460415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_018624	GTA	2	6	460530	460535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1078	NC_018624	T	6	6	460619	460624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_018624	TG	3	6	460638	460643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018624	AG	3	6	460787	460792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018624	T	6	6	462849	462854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018624	TAA	2	6	462870	462875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018624	TTA	2	6	462894	462899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018624	AAAT	2	8	462900	462907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018624	TTA	2	6	462915	462920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018624	T	6	6	462924	462929	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_018624	GTAA	2	8	462952	462959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018624	AAG	2	6	463612	463617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_018624	ATAGA	2	10	463618	463627	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018624	T	7	7	463638	463644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018624	CT	4	8	463668	463675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1094	NC_018624	CAAT	2	8	465744	465751	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_018624	TAT	2	6	465974	465979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1098	NC_018624	TAA	2	6	466050	466055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018624	TAA	2	6	468854	468859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018624	AATT	2	8	468861	468868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018624	TAA	2	6	468876	468881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018624	ATT	2	6	468894	468899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018624	ATT	3	9	468901	468909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018624	CTT	2	6	469979	469984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_018624	AG	3	6	470496	470501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018624	ATGTA	2	10	470505	470514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018624	T	7	7	470523	470529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018624	A	8	8	470539	470546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018624	T	7	7	470556	470562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_018624	AAAAAT	2	12	470564	470575	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018624	GCT	2	6	477058	477063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_018624	AG	3	6	477066	477071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018624	TCA	2	6	477128	477133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_018624	TAAAT	2	10	477146	477155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018624	AACTT	2	10	477159	477168	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1116	NC_018624	T	6	6	477180	477185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018624	AGT	2	6	478357	478362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018624	TA	3	6	478380	478385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018624	TAAAT	2	10	478432	478441	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018624	GAT	2	6	478461	478466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_018624	T	7	7	478512	478518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018624	TAT	2	6	478543	478548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_018624	T	7	7	479492	479498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018624	AAG	2	6	479571	479576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018624	A	6	6	479614	479619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018624	ATA	2	6	479716	479721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018624	CAA	2	6	479722	479727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018624	GCT	2	6	479760	479765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_018624	AC	3	6	479838	479843	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1132	NC_018624	T	7	7	481309	481315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018624	TTA	2	6	481327	481332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018624	AG	3	6	481363	481368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018624	T	8	8	481369	481376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018624	TA	3	6	481443	481448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_018624	T	6	6	481470	481475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_018624	AGA	2	6	481914	481919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1421	NC_018624	GGA	2	6	609666	609671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_018624	GGT	2	6	611229	611234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_018624	GCA	2	6	611265	611270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_018624	T	7	7	621383	621389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_018624	ATTA	2	8	622596	622603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1455	NC_018624	T	6	6	622765	622770	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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