MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WC chromosome

Total Repeats: 2746

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018624	CATA	2	8	213511	213518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
502	NC_018624	CCT	2	6	213570	213575	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
503	NC_018624	ATGT	2	8	213627	213634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018624	ACA	2	6	213639	213644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_018624	GCC	2	6	213669	213674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_018624	AAG	2	6	213679	213684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_018624	A	7	7	213713	213719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018624	TGA	2	6	215290	215295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018624	TAA	2	6	215327	215332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018624	T	6	6	215360	215365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_018624	AT	3	6	215405	215410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_018624	GA	3	6	215465	215470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018624	GT	3	6	215505	215510	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
514	NC_018624	CT	3	6	215542	215547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
515	NC_018624	T	7	7	215570	215576	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018624	T	6	6	215634	215639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018624	T	6	6	215680	215685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018624	A	6	6	215731	215736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018624	AG	3	6	215770	215775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018624	TC	3	6	215829	215834	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
521	NC_018624	ATA	2	6	222880	222885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018624	AG	3	6	222888	222893	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018624	AAGA	2	8	222895	222902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018624	AGA	2	6	225858	225863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018624	ATAAA	2	10	225864	225873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018624	A	6	6	225885	225890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018624	T	8	8	225940	225947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018624	G	6	6	226005	226010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018624	CTT	2	6	226331	226336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018624	TCG	2	6	226566	226571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018624	AAT	2	6	226675	226680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_018624	AACA	2	8	226713	226720	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
533	NC_018624	ATTTT	2	10	226721	226730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_018624	TTA	2	6	226731	226736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018624	A	8	8	226769	226776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018624	TAA	2	6	226794	226799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018624	TAAAGA	2	12	226806	226817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_018624	TAA	2	6	226830	226835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_018624	A	6	6	226874	226879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_018624	A	6	6	228260	228265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_018624	T	7	7	228266	228272	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_018624	AAG	2	6	228299	228304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_018624	TAT	2	6	228315	228320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_018624	T	6	6	229203	229208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018624	ATA	2	6	229223	229228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_018624	CCT	2	6	229697	229702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_018624	ATA	2	6	229725	229730	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018624	T	8	8	229772	229779	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018624	A	6	6	232203	232208	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018624	TA	3	6	232225	232230	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_018624	T	6	6	232234	232239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018624	T	6	6	232270	232275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018624	GAT	2	6	232287	232292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018624	GCG	2	6	232301	232306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018624	GAT	2	6	232344	232349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_018624	T	6	6	235940	235945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_018624	AG	3	6	236968	236973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_018624	AT	3	6	237038	237043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_018624	CTA	2	6	237147	237152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_018624	CTTG	2	8	238142	238149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
561	NC_018624	GAAT	2	8	238193	238200	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018624	GAA	3	9	238207	238215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018624	T	6	6	238230	238235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_018624	AAG	2	6	238239	238244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018624	T	7	7	238254	238260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_018624	AAG	2	6	238293	238298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_018624	ACC	2	6	238312	238317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_018624	AATT	2	8	238332	238339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018624	GAT	2	6	238373	238378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_018624	TTTC	2	8	238432	238439	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
571	NC_018624	GTT	2	6	238460	238465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018624	A	8	8	238500	238507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_018624	AGA	2	6	238542	238547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018624	ATTATA	2	12	239674	239685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_018624	A	6	6	239709	239714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018624	CTT	2	6	239746	239751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_018624	TAT	2	6	239773	239778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018624	ATAA	2	8	239814	239821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_018624	GA	3	6	239856	239861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018624	A	6	6	239891	239896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018624	GCA	2	6	239909	239914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_018624	GCA	2	6	239919	239924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018624	T	6	6	240135	240140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018624	GTTT	2	8	240863	240870	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018624	TAG	2	6	240931	240936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018624	A	7	7	241023	241029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_018624	AG	3	6	241065	241070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
588	NC_018624	TAT	2	6	241081	241086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018624	TCAT	2	8	241093	241100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_018624	ATA	2	6	241108	241113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018624	TGT	2	6	242629	242634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018624	TTGAAT	2	12	243987	243998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
593	NC_018624	AGGA	2	8	244023	244030	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
594	NC_018624	AG	3	6	244031	244036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018624	T	7	7	244045	244051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018624	AAG	2	6	247820	247825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018624	AAT	2	6	250133	250138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018624	T	6	6	250191	250196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018624	CGA	2	6	252177	252182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_018624	GAA	2	6	252250	252255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018624	AAT	2	6	252283	252288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_018624	T	8	8	252299	252306	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_018624	TTG	2	6	252998	253003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018624	TGA	2	6	253051	253056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_018624	T	6	6	253082	253087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018624	T	7	7	253131	253137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_018624	T	6	6	253153	253158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_018624	A	7	7	253161	253167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018624	TAT	2	6	255810	255815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018624	TTG	2	6	255840	255845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018624	TTTAA	2	10	255852	255861	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_018624	AAGAT	2	10	255926	255935	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018624	T	6	6	261550	261555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_018624	GT	3	6	261573	261578	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
615	NC_018624	ATT	2	6	261691	261696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_018624	A	6	6	261717	261722	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_018624	ATATAA	2	12	261738	261749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018624	T	6	6	261766	261771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018624	TAAA	2	8	262990	262997	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_018624	ATT	2	6	263003	263008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_018624	GTT	2	6	263024	263029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_018624	T	8	8	263028	263035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018624	GTT	2	6	266558	266563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018624	T	7	7	266608	266614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018624	GTTC	2	8	266677	266684	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
626	NC_018624	TC	3	6	266683	266688	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
627	NC_018624	A	6	6	266694	266699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018624	AT	4	8	266721	266728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018624	TAAT	2	8	266780	266787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018624	AATT	2	8	266795	266802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_018624	GAAGA	2	10	267618	267627	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018624	T	8	8	267655	267662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018624	GGGAAA	2	12	267703	267714	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_018624	GAC	2	6	267730	267735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_018624	TC	3	6	267825	267830	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
636	NC_018624	ATT	2	6	267835	267840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018624	T	7	7	267861	267867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_018624	TAAT	2	8	267872	267879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_018624	TTA	2	6	267900	267905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_018624	TTC	2	6	267914	267919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
641	NC_018624	GAA	2	6	267933	267938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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