MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018623	TAAAAA	2	12	26698	26709	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018623	TTTTAA	2	12	42720	42731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018623	ATTATA	2	12	77752	77763	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018623	TTTCTT	2	12	123031	123042	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018623	AGAAAA	2	12	163053	163064	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018623	AAGCGA	2	12	179499	179510	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018623	ATTTTT	2	12	226693	226704	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018623	CCTTAA	2	12	229182	229193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018623	ATTATA	2	12	239622	239633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018623	ATATAA	2	12	261686	261697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018623	GGGAAA	2	12	267657	267668	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018623	TAAGAA	2	12	277697	277708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018623	GTTATT	2	12	312845	312856	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018623	GTTGCT	2	12	324174	324185	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018623	ATTTTT	2	12	365965	365976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018623	AAAATC	2	12	390961	390972	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_018623	ACTGAT	2	12	457630	457641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_018623	TATTTG	2	12	460072	460083	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018623	AAAAAT	2	12	464573	464584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018623	GTTTTT	2	12	471189	471200	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018623	TATAAT	2	12	483916	483927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018623	AAATAA	2	12	581433	581444	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018623	TTATAA	2	12	647100	647111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018623	TATAAA	2	12	650070	650081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018623	AAGGGA	2	12	692502	692513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018623	ATTAAT	2	12	695192	695203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018623	TAAAAG	2	12	728715	728726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018623	ATTTTA	2	12	741428	741439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018623	TAACCT	2	12	782820	782831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018623	TTGATT	2	12	809744	809755	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018623	CTCCAT	2	12	827202	827213	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018623	GCTATC	2	12	849713	849724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018623	ATTTTA	2	12	940595	940606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018623	ATCTAT	2	12	955861	955872	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_018623	ATAAAA	2	12	972310	972321	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018623	TTTTCT	2	12	1003263	1003274	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018623	AAATAA	2	12	1008493	1008504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018623	TTATCC	2	12	1012257	1012268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018623	AAATTT	2	12	1014388	1014399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018623	CTTTGT	2	12	1025832	1025843	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_018623	AAAAAT	2	12	1046104	1046115	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018623	TAATTT	2	12	1092734	1092745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018623	AAAATA	2	12	1131181	1131192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018623	TACAGA	2	12	1143858	1143869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_018623	GTTAAA	2	12	1156782	1156793	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018623	CCTTCG	2	12	1159571	1159582	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.