MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_018623	T	6	6	1005114	1005119	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_018623	AGGTA	2	10	1008252	1008261	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_018623	G	12	12	1008270	1008281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_018623	TGT	2	6	1008302	1008307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_018623	TTC	2	6	1008352	1008357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_018623	CAA	2	6	1008477	1008482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_018623	AAATAA	2	12	1008493	1008504	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_018623	ATTT	2	8	1008547	1008554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_018623	TAAA	2	8	1008564	1008571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_018623	TCT	2	6	1008667	1008672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_018623	AC	3	6	1008703	1008708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_018623	TGA	2	6	1008740	1008745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_018623	TCAG	2	8	1008758	1008765	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2514	NC_018623	ATT	2	6	1008776	1008781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_018623	TCAA	2	8	1008784	1008791	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2516	NC_018623	TAAA	2	8	1008798	1008805	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_018623	A	9	9	1008803	1008811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_018623	A	6	6	1008856	1008861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_018623	CGA	2	6	1008877	1008882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_018623	GT	3	6	1008958	1008963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_018623	GTAAC	2	10	1008995	1009004	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2522	NC_018623	ATTT	2	8	1009062	1009069	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_018623	CAA	2	6	1009070	1009075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_018623	A	6	6	1009074	1009079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_018623	TTA	2	6	1009122	1009127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_018623	AC	3	6	1009159	1009164	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2527	NC_018623	AC	3	6	1009301	1009306	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2528	NC_018623	ACG	2	6	1009396	1009401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_018623	TGG	2	6	1009524	1009529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_018623	CCG	2	6	1009592	1009597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2531	NC_018623	CTC	2	6	1009710	1009715	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2532	NC_018623	AGG	2	6	1009727	1009732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_018623	CTA	2	6	1009969	1009974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_018623	CGG	2	6	1010083	1010088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_018623	C	6	6	1010245	1010250	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2536	NC_018623	CTT	2	6	1010291	1010296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_018623	CG	3	6	1010344	1010349	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2538	NC_018623	ATT	2	6	1010413	1010418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_018623	TCC	2	6	1010448	1010453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2540	NC_018623	AACCT	2	10	1010473	1010482	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2541	NC_018623	CTA	2	6	1010500	1010505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_018623	GGT	2	6	1010584	1010589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_018623	CTG	2	6	1010785	1010790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2544	NC_018623	TAC	2	6	1010793	1010798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_018623	TA	4	8	1010813	1010820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2546	NC_018623	ATT	3	9	1010860	1010868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_018623	TGC	2	6	1010917	1010922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_018623	ATC	2	6	1010952	1010957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2549	NC_018623	CGG	2	6	1010997	1011002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_018623	GA	3	6	1011174	1011179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_018623	TCC	2	6	1011260	1011265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2552	NC_018623	TAACT	2	10	1011400	1011409	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2553	NC_018623	TCA	2	6	1011417	1011422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2554	NC_018623	AAG	2	6	1011455	1011460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_018623	T	6	6	1011661	1011666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_018623	TCT	2	6	1011776	1011781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_018623	TCGC	2	8	1011788	1011795	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2558	NC_018623	ATTT	2	8	1011818	1011825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_018623	CAG	2	6	1011853	1011858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_018623	GAT	2	6	1011899	1011904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_018623	CCA	2	6	1012016	1012021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2562	NC_018623	TAA	2	6	1012030	1012035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_018623	ATT	2	6	1012048	1012053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_018623	AT	3	6	1012084	1012089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_018623	TAT	3	9	1012101	1012109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_018623	ATT	2	6	1012132	1012137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_018623	ACATA	2	10	1012139	1012148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2568	NC_018623	AAC	2	6	1012175	1012180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_018623	A	7	7	1012215	1012221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_018623	TTATCC	2	12	1012257	1012268	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2571	NC_018623	AGG	2	6	1012274	1012279	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2572	NC_018623	TCA	2	6	1012331	1012336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2573	NC_018623	CT	3	6	1012353	1012358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2574	NC_018623	ATG	2	6	1012402	1012407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_018623	GT	3	6	1012417	1012422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_018623	GT	3	6	1012586	1012591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2577	NC_018623	TCC	2	6	1012637	1012642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2578	NC_018623	GAC	2	6	1012750	1012755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2579	NC_018623	GCA	2	6	1012762	1012767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_018623	TTC	2	6	1012837	1012842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2581	NC_018623	CTC	2	6	1012925	1012930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2582	NC_018623	GGC	2	6	1012932	1012937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_018623	TTC	2	6	1013100	1013105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_018623	CTTTC	2	10	1013219	1013228	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2585	NC_018623	GCT	2	6	1013291	1013296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_018623	CTT	2	6	1013316	1013321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_018623	TC	3	6	1013358	1013363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2588	NC_018623	TCA	2	6	1013402	1013407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2589	NC_018623	CA	3	6	1013406	1013411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2590	NC_018623	TC	3	6	1013514	1013519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2591	NC_018623	CAA	2	6	1013562	1013567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2592	NC_018623	CTT	2	6	1013615	1013620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_018623	ACA	2	6	1013734	1013739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_018623	ATT	2	6	1013749	1013754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_018623	CGC	2	6	1013780	1013785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2596	NC_018623	A	6	6	1013820	1013825	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_018623	AAG	2	6	1013905	1013910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_018623	CGA	2	6	1013918	1013923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_018623	ACA	2	6	1014093	1014098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2600	NC_018623	T	6	6	1014126	1014131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_018623	TAT	2	6	1014224	1014229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_018623	T	8	8	1014233	1014240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_018623	TTAA	2	8	1014276	1014283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_018623	CTTCT	2	10	1014316	1014325	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2605	NC_018623	TCCT	2	8	1014352	1014359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2606	NC_018623	AAATTT	2	12	1014388	1014399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_018623	TCG	2	6	1014587	1014592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_018623	ATA	2	6	1014595	1014600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_018623	CGT	2	6	1014690	1014695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2610	NC_018623	CTT	2	6	1014701	1014706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_018623	TCT	2	6	1014709	1014714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_018623	CTA	2	6	1014767	1014772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2613	NC_018623	AG	3	6	1014796	1014801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2614	NC_018623	TC	4	8	1020504	1020511	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_018623	AG	3	6	1020603	1020608	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2616	NC_018623	CTT	2	6	1021048	1021053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2617	NC_018623	AAT	2	6	1021073	1021078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_018623	ACG	2	6	1021087	1021092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_018623	CTT	2	6	1021099	1021104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2620	NC_018623	TTAT	2	8	1021133	1021140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_018623	T	6	6	1021151	1021156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2622	NC_018623	GCT	2	6	1021161	1021166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2623	NC_018623	AGC	2	6	1021185	1021190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2624	NC_018623	ACT	2	6	1021192	1021197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_018623	T	6	6	1021246	1021251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_018623	TTAAA	2	10	1021270	1021279	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_018623	GGC	2	6	1021314	1021319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2628	NC_018623	TAGT	2	8	1021456	1021463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2629	NC_018623	TTA	2	6	1021469	1021474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_018623	AACAA	2	10	1021484	1021493	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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