MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018623	ATT	2	6	614254	614259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_018623	T	11	11	614282	614292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_018623	T	6	6	614337	614342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_018623	TAA	2	6	614351	614356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_018623	ATT	2	6	614363	614368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_018623	TAA	2	6	614380	614385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_018623	GA	5	10	615214	615223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_018623	A	7	7	615240	615246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_018623	AAG	3	9	615250	615258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_018623	CT	3	6	615259	615264	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1511	NC_018623	T	6	6	615268	615273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_018623	ATTA	2	8	616486	616493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_018623	A	6	6	616552	616557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_018623	TA	3	6	616620	616625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_018623	CT	3	6	616646	616651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_018623	T	6	6	616653	616658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_018623	TATCC	2	10	616737	616746	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1518	NC_018623	ATAA	2	8	616763	616770	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_018623	AAG	2	6	616788	616793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_018623	CTT	2	6	616794	616799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1521	NC_018623	TTAA	2	8	620017	620024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_018623	CTT	2	6	620086	620091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_018623	GGC	2	6	620276	620281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_018623	AATA	2	8	620709	620716	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_018623	AGA	2	6	621276	621281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_018623	CGT	2	6	621284	621289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1527	NC_018623	AAC	2	6	621542	621547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1528	NC_018623	AC	3	6	621595	621600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_018623	ACA	2	6	622012	622017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_018623	CT	3	6	622039	622044	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1531	NC_018623	AAG	2	6	622073	622078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_018623	TATC	2	8	623297	623304	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1533	NC_018623	TTAC	2	8	623326	623333	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_018623	A	7	7	623344	623350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_018623	TA	3	6	623386	623391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_018623	AT	3	6	623406	623411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_018623	AGT	2	6	623422	623427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_018623	ACG	2	6	623446	623451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_018623	CT	3	6	623488	623493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1540	NC_018623	CTT	2	6	623502	623507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_018623	CTG	2	6	623533	623538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_018623	CTT	2	6	623583	623588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_018623	TTGT	2	8	624324	624331	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_018623	GAAA	2	8	624388	624395	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_018623	GTTT	2	8	624423	624430	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_018623	T	6	6	624466	624471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_018623	AGCT	2	8	624499	624506	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1548	NC_018623	TTC	2	6	624524	624529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_018623	AGGGG	2	10	624532	624541	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_018623	TCT	2	6	624548	624553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_018623	GTT	2	6	624598	624603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_018623	TCTT	2	8	624606	624613	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_018623	TTAC	2	8	624655	624662	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1554	NC_018623	TAC	2	6	624693	624698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_018623	A	6	6	624704	624709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_018623	AAT	2	6	625712	625717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_018623	AAC	2	6	625721	625726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_018623	CT	3	6	625731	625736	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_018623	AGA	2	6	625742	625747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_018623	ACC	2	6	625833	625838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1561	NC_018623	ATA	2	6	626641	626646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_018623	T	6	6	626650	626655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_018623	AAT	2	6	626675	626680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_018623	ATA	2	6	626839	626844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_018623	TAT	2	6	626875	626880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_018623	ATTA	2	8	626900	626907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_018623	TAAT	2	8	626916	626923	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_018623	CAA	2	6	629514	629519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_018623	A	6	6	629527	629532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_018623	TAA	2	6	629536	629541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_018623	TAA	2	6	629572	629577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_018623	AGA	2	6	639338	639343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_018623	TA	4	8	639352	639359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_018623	CCA	2	6	639374	639379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_018623	TCT	2	6	639395	639400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_018623	TTA	2	6	639401	639406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_018623	ATTA	2	8	639567	639574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_018623	AT	3	6	639582	639587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_018623	TAAT	2	8	639590	639597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_018623	TTA	2	6	639616	639621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_018623	TAT	2	6	640396	640401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_018623	ATT	2	6	640433	640438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_018623	T	6	6	640466	640471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_018623	TGA	2	6	640583	640588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_018623	AACT	3	12	640661	640672	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1586	NC_018623	GT	3	6	640735	640740	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_018623	ACT	2	6	640837	640842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_018623	TCT	2	6	640905	640910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_018623	TAA	2	6	640912	640917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_018623	AAC	2	6	640945	640950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_018623	TTC	2	6	640969	640974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_018623	AAAT	2	8	640975	640982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_018623	TAA	2	6	641028	641033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_018623	TCC	2	6	641052	641057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1595	NC_018623	TAAT	2	8	641149	641156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_018623	CTTC	2	8	641223	641230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1597	NC_018623	T	6	6	641272	641277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_018623	AAAAC	2	10	641282	641291	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1599	NC_018623	TTTA	2	8	641303	641310	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_018623	TAA	2	6	641339	641344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_018623	A	7	7	641359	641365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_018623	AT	3	6	641376	641381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_018623	ATC	2	6	641795	641800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_018623	CTA	2	6	641802	641807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1605	NC_018623	TAG	2	6	641810	641815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_018623	AGA	2	6	642008	642013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_018623	AT	3	6	642089	642094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_018623	AGT	2	6	643579	643584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_018623	TTG	2	6	643617	643622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_018623	CAG	2	6	643645	643650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_018623	AGAT	2	8	643687	643694	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_018623	ATC	2	6	643736	643741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_018623	GCAA	2	8	643775	643782	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_018623	GAA	2	6	644176	644181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_018623	GAA	2	6	644254	644259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_018623	TGTA	2	8	644263	644270	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_018623	AAT	2	6	644405	644410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_018623	T	7	7	644436	644442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_018623	A	6	6	644444	644449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_018623	A	7	7	644454	644460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_018623	CAG	2	6	644518	644523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_018623	GTT	2	6	644525	644530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_018623	GAT	2	6	644550	644555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_018623	A	7	7	644567	644573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_018623	TA	3	6	644578	644583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_018623	ATTAA	2	10	645100	645109	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_018623	A	7	7	645152	645158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_018623	A	7	7	645166	645172	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_018623	TTAGA	2	10	645181	645190	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_018623	T	6	6	645245	645250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_018623	TA	3	6	645256	645261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_018623	T	7	7	645265	645271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_018623	CAAA	2	8	645276	645283	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1634	NC_018623	GTT	2	6	645291	645296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_018623	TTG	2	6	646148	646153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_018623	GTTTT	2	10	646175	646184	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_018623	TCT	2	6	646202	646207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1639	NC_018623	TCA	2	6	646260	646265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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