MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci M56 chromosome

Total Repeats: 2836

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018623	TAAT	2	8	396045	396052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018623	TA	3	6	396053	396058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018623	T	7	7	396070	396076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018623	A	7	7	399022	399028	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018623	AAAG	2	8	399032	399039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018623	ATT	2	6	399088	399093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018623	TAG	2	6	402897	402902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018623	CTT	2	6	405082	405087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_018623	T	6	6	405090	405095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018623	T	6	6	405118	405123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018623	TG	3	6	407234	407239	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018623	A	7	7	407571	407577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018623	T	6	6	407594	407599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018623	T	8	8	407615	407622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018623	A	7	7	407658	407664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018623	AGC	2	6	407743	407748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_018623	TTA	2	6	408040	408045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018623	TAT	2	6	408104	408109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018623	CT	3	6	408123	408128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_018623	ATTA	2	8	412265	412272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018623	GAA	2	6	414881	414886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018623	CAAT	2	8	414916	414923	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1023	NC_018623	A	7	7	414935	414941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018623	CAG	2	6	414942	414947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018623	GAT	2	6	414948	414953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018623	ATTT	2	8	414970	414977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018623	ATA	2	6	415999	416004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018623	TAG	2	6	416034	416039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_018623	ATT	2	6	416066	416071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018623	AATA	2	8	416091	416098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018623	TC	3	6	416114	416119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_018623	CTTT	2	8	419792	419799	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_018623	T	7	7	419831	419837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018623	A	6	6	419845	419850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018623	GTAA	2	8	419873	419880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018623	CGG	2	6	419888	419893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_018623	TTTA	2	8	419926	419933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018623	AT	3	6	419995	420000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018623	AAG	2	6	420039	420044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018623	T	7	7	422225	422231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018623	AAGAG	2	10	422235	422244	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018623	GTC	2	6	422256	422261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018623	CTG	2	6	422286	422291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1045	NC_018623	AAG	2	6	422363	422368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018623	TTA	2	6	422383	422388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018623	AAC	2	6	422487	422492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_018623	A	6	6	422504	422509	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018623	TAT	2	6	422562	422567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018623	CAA	2	6	422579	422584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018623	AGG	2	6	422607	422612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018623	T	6	6	423001	423006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018623	TTA	2	6	423008	423013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018623	TAT	2	6	424240	424245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018623	T	7	7	424245	424251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018623	AAT	2	6	424268	424273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018623	T	6	6	424284	424289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018623	ATT	2	6	424294	424299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018623	GA	3	6	424328	424333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018623	ATT	2	6	429856	429861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018623	ATA	2	6	429863	429868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018623	TTG	2	6	430391	430396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018623	GTC	2	6	430406	430411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_018623	ACGA	2	8	430447	430454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_018623	GAT	2	6	430551	430556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1067	NC_018623	TAT	2	6	430650	430655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018623	TCAT	2	8	430666	430673	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_018623	GAG	2	6	432543	432548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018623	ATT	2	6	432565	432570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_018623	T	8	8	432616	432623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018623	TTTA	2	8	432652	432659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018623	T	7	7	434981	434987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018623	A	6	6	434988	434993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018623	AG	3	6	435051	435056	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_018623	GA	3	6	435061	435066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018623	T	6	6	435109	435114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_018623	TTA	2	6	435192	435197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_018623	AGG	2	6	436992	436997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_018623	ATG	2	6	437783	437788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1092	NC_018623	ATTTT	2	10	441076	441085	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1095	NC_018623	A	7	7	441173	441179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_018623	TGA	2	6	441499	441504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018623	ATC	2	6	441509	441514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_018623	AAC	2	6	441553	441558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_018623	AG	3	6	441579	441584	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018623	TGAG	2	8	441632	441639	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018623	CT	3	6	441650	441655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_018623	AAT	2	6	442136	442141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018623	TTAA	2	8	442183	442190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018623	A	6	6	442750	442755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_018623	TTAA	2	8	442764	442771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018623	TCA	2	6	443980	443985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_018623	CT	3	6	444052	444057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1111	NC_018623	TTA	2	6	444066	444071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018623	TAT	2	6	444073	444078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018623	A	6	6	444088	444093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018623	A	6	6	444110	444115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018623	ATT	2	6	444126	444131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1117	NC_018623	TTGA	2	8	444175	444182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018623	GTA	2	6	449536	449541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1120	NC_018623	TGA	2	6	449946	449951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018623	GTG	2	6	449960	449965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018623	A	8	8	449974	449981	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018623	GCTTC	2	10	449992	450001	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1126	NC_018623	T	6	6	454577	454582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018623	TAAA	2	8	454633	454640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018623	TCCT	2	8	454663	454670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1129	NC_018623	CAT	2	6	454697	454702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018623	T	7	7	454746	454752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018623	ATT	2	6	454780	454785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018623	GTA	2	6	454900	454905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018623	GAA	2	6	454914	454919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018623	T	6	6	454989	454994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018623	TG	3	6	455008	455013	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018623	AG	3	6	455157	455162	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_018623	CTT	2	6	457227	457232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_018623	TAT	2	6	587152	587157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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