MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci WS/RT/E30 chromosome

Total Repeats: 2897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018622	TTTA	2	8	416165	416172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018622	AT	3	6	416235	416240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018622	GAA	2	6	416278	416283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018622	T	7	7	418465	418471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018622	AAGA	2	8	418475	418482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018622	GTC	2	6	418495	418500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_018622	CTG	2	6	418525	418530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_018622	AGG	2	6	418534	418539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018622	AAG	2	6	418602	418607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018622	TTA	2	6	418622	418627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018622	AAC	2	6	418726	418731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_018622	A	6	6	418743	418748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_018622	TAT	2	6	418801	418806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018622	CAA	2	6	418818	418823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_018622	AGG	2	6	418846	418851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_018622	T	6	6	419240	419245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018622	TTA	2	6	419247	419252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_018622	TAT	2	6	420480	420485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018622	T	8	8	420485	420492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018622	AAT	2	6	420509	420514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018622	ATT	2	6	420534	420539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018622	GA	3	6	420568	420573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018622	TGT	2	6	420575	420580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018622	ATT	2	6	426096	426101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018622	ATA	2	6	426103	426108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018622	TTG	2	6	426631	426636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018622	GTC	2	6	426646	426651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_018622	ACGA	2	8	426687	426694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_018622	GAT	2	6	426791	426796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018622	TTTC	2	8	426852	426859	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_018622	TAT	2	6	426890	426895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018622	TCAT	2	8	426906	426913	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_018622	GAG	2	6	428783	428788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_018622	ATT	2	6	428805	428810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018622	T	8	8	428856	428863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018622	TTTA	2	8	428892	428899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_018622	AAC	2	6	430875	430880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_018622	T	7	7	431221	431227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_018622	A	7	7	431228	431234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018622	GA	3	6	431302	431307	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018622	T	6	6	431350	431355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018622	TCT	2	6	431370	431375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018622	CAA	2	6	431409	431414	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018622	TTA	2	6	431433	431438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_018622	ATG	2	6	434023	434028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018622	T	6	6	434031	434036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1050	NC_018622	AAG	2	6	435788	435793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018622	TC	3	6	435835	435840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_018622	ATTTT	2	10	437316	437325	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_018622	GCT	2	6	437376	437381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_018622	TTA	2	6	437385	437390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018622	A	7	7	437413	437419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018622	ATA	2	6	437649	437654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018622	TAC	2	6	437683	437688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_018622	ATC	2	6	437749	437754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_018622	AAC	2	6	437793	437798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_018622	AG	3	6	437819	437824	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018622	TGAG	2	8	437872	437879	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1063	NC_018622	CAT	2	6	437930	437935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_018622	TCTT	2	8	437945	437952	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1065	NC_018622	GAT	2	6	437973	437978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1068	NC_018622	TA	3	6	439007	439012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018622	TTTA	2	8	439040	439047	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018622	CT	3	6	440290	440295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_018622	TTA	2	6	440304	440309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018622	TAT	2	6	440311	440316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018622	A	6	6	440326	440331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018622	A	6	6	440348	440353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018622	ATT	2	6	440364	440369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1082	NC_018622	TGA	2	6	446184	446189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_018622	GTG	2	6	446198	446203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018622	A	8	8	446212	446219	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018622	GCTTC	2	10	446230	446239	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1089	NC_018622	CAT	2	6	450935	450940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1092	NC_018622	GTA	2	6	451138	451143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018622	GAA	2	6	451152	451157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018622	T	6	6	451227	451232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018622	TG	3	6	451246	451251	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018622	AG	3	6	451395	451400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_018622	TTA	2	6	453502	453507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018622	AAAT	2	8	453508	453515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018622	TTA	2	6	453523	453528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_018622	T	6	6	453532	453537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018622	GTAA	2	8	453560	453567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_018622	AAG	2	6	454220	454225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018622	ATAGA	2	10	454226	454235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018622	T	7	7	454246	454252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018622	CT	4	8	454276	454283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1109	NC_018622	ATAC	2	8	456036	456043	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1110	NC_018622	CAAT	2	8	456352	456359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_018622	TAT	2	6	456582	456587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018622	AAT	2	6	456590	456595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018622	ATA	2	6	456610	456615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018622	TAA	2	6	456658	456663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018622	TAA	2	6	459463	459468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018622	AATT	2	8	459470	459477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018622	TAA	2	6	459485	459490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018622	ATT	2	6	459503	459508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018622	ATT	3	9	459510	459518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018622	CTT	2	6	460588	460593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_018622	AG	3	6	461105	461110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018622	ATGTA	2	10	461114	461123	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_018622	T	7	7	461132	461138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018622	A	8	8	461148	461155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018622	T	8	8	461165	461172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018622	AAAAAT	2	12	461174	461185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018622	GCT	2	6	467668	467673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_018622	AG	3	6	467676	467681	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018622	TCA	2	6	467738	467743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018622	TAAAT	2	10	467756	467765	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018622	AACTT	2	10	467769	467778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1132	NC_018622	T	6	6	467790	467795	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018622	AGT	2	6	468967	468972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018622	TA	3	6	468990	468995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018622	TAAAT	2	10	469042	469051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018622	GAT	2	6	469071	469076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_018622	T	6	6	469089	469094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1139	NC_018622	TAT	2	6	469152	469157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_018622	T	7	7	592950	592956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_018622	CTAG	2	8	592989	592996	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1422	NC_018622	ACT	2	6	594554	594559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1429	NC_018622	ATA	2	6	596536	596541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_018622	AGTT	2	8	596565	596572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_018622	ATA	2	6	596579	596584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_018622	ATC	2	6	598509	598514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1434	NC_018622	TTC	2	6	599869	599874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1435	NC_018622	T	6	6	599882	599887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_018622	CTT	2	6	599888	599893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1444	NC_018622	GCA	2	6	601802	601807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1451	NC_018622	AGA	2	6	606085	606090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_018622	AAAG	2	8	606121	606128	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_018622	TCT	2	6	606136	606141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1454	NC_018622	AAT	2	6	606161	606166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_018622	TAA	2	6	606185	606190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1456	NC_018622	TAAT	2	8	606198	606205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1457	NC_018622	TATT	2	8	606214	606221	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1458	NC_018622	TTA	2	6	606251	606256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1462	NC_018622	TAA	2	6	611004	611009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1463	NC_018622	ATT	2	6	611016	611021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1464	NC_018622	TAA	2	6	611033	611038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_018622	GA	5	10	611867	611876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1466	NC_018622	A	7	7	611893	611899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1467	NC_018622	AAG	3	9	611903	611911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1468	NC_018622	CT	3	6	611912	611917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1469	NC_018622	T	6	6	611921	611926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1470	NC_018622	ATTA	2	8	613133	613140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1474	NC_018622	TATCC	2	10	613386	613395	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1476	NC_018622	AAG	2	6	613437	613442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1480	NC_018622	TCC	2	6	616381	616386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1481	NC_018622	TTA	2	6	616387	616392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1482	NC_018622	TTAA	2	8	616665	616672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1483	NC_018622	AAC	2	6	618215	618220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1484	NC_018622	AC	3	6	618268	618273	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1486	NC_018622	CAT	2	6	619411	619416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1488	NC_018622	TTAC	2	8	620001	620008	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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