MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018620	AG	3	6	17697	17702	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	TC	3	6	31845	31850	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018620	TC	3	6	37735	37740	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018620	TA	3	6	52209	52214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018620	AG	4	8	56041	56048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018620	TG	3	6	59854	59859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018620	TG	3	6	63268	63273	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018620	AT	3	6	93983	93988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018620	GA	3	6	97039	97044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018620	GA	3	6	98948	98953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018620	AG	3	6	101759	101764	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018620	AG	3	6	112333	112338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018620	AT	3	6	123179	123184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	TA	4	8	124025	124032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018620	TA	4	8	125293	125300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018620	TG	4	8	128396	128403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018620	AC	3	6	128530	128535	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_018620	AT	3	6	130207	130212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	TA	3	6	130490	130495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018620	CT	3	6	130586	130591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018620	CT	3	6	130717	130722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018620	AT	3	6	131606	131611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018620	GA	3	6	134329	134334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018620	CT	3	6	147107	147112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_018620	GT	3	6	148729	148734	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018620	GT	3	6	148753	148758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018620	AG	3	6	157984	157989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018620	GT	3	6	159299	159304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018620	TA	3	6	173066	173071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018620	AG	3	6	173110	173115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018620	AG	3	6	179373	179378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018620	CT	3	6	193614	193619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018620	CA	3	6	195405	195410	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018620	CA	3	6	198467	198472	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018620	AT	3	6	210250	210255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018620	AT	3	6	213134	213139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018620	AT	3	6	215326	215331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018620	GA	3	6	215387	215392	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	GT	3	6	215427	215432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018620	CT	3	6	215464	215469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_018620	AG	3	6	215691	215696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018620	TC	3	6	215750	215755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_018620	GC	3	6	217307	217312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_018620	AG	3	6	222811	222816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018620	TA	4	8	232146	232153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018620	AG	3	6	236891	236896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018620	AT	3	6	236961	236966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018620	CT	3	6	238502	238507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_018620	AT	3	6	239778	239783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018620	GA	3	6	240031	240036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018620	AG	3	6	240984	240989	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018620	AG	3	6	243950	243955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018620	GT	3	6	261493	261498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018620	TC	3	6	266603	266608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_018620	AT	4	8	266641	266648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018620	TG	3	6	267891	267896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018620	GT	3	6	277516	277521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018620	TC	3	6	281640	281645	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018620	TA	3	6	281689	281694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018620	TC	3	6	301169	301174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_018620	AC	3	6	310256	310261	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018620	AG	3	6	313230	313235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018620	GA	3	6	313280	313285	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018620	AG	3	6	322842	322847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018620	TA	3	6	327081	327086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018620	AG	3	6	327228	327233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018620	AT	3	6	339689	339694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018620	GT	3	6	342102	342107	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018620	TG	3	6	343627	343632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018620	TA	3	6	344136	344141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018620	CT	3	6	345049	345054	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_018620	TA	3	6	345121	345126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	TA	3	6	346532	346537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018620	TA	3	6	350699	350704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018620	CT	4	8	353316	353323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_018620	AT	3	6	361998	362003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018620	TA	3	6	364639	364644	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018620	AG	3	6	365645	365650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018620	AT	3	6	369038	369043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018620	CT	3	6	370612	370617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_018620	TA	3	6	381156	381161	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018620	AT	3	6	381373	381378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018620	AC	3	6	385213	385218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018620	TA	3	6	395756	395761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018620	CT	3	6	407827	407832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018620	TC	3	6	415817	415822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_018620	AT	3	6	419699	419704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018620	GA	3	6	424030	424035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018620	GA	3	6	434762	434767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018620	TC	3	6	439295	439300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_018620	AG	3	6	441279	441284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018620	CT	3	6	441350	441355	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018620	TA	3	6	442467	442472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018620	CT	3	6	443750	443755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018620	TG	3	6	454706	454711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018620	AG	3	6	454855	454860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018620	CT	4	8	457736	457743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018620	AG	3	6	464565	464570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018620	AG	3	6	471136	471141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018620	TA	3	6	472450	472455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018620	AC	3	6	473909	473914	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018620	AG	3	6	475362	475367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018620	TA	3	6	475442	475447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018620	CT	3	6	481858	481863	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018620	AG	4	8	483846	483853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018620	TC	3	6	485419	485424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_018620	TA	3	6	488181	488186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018620	AT	3	6	493525	493530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018620	GA	3	6	498702	498707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018620	TC	3	6	500154	500159	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018620	AT	3	6	507890	507895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018620	AT	3	6	507928	507933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018620	AG	3	6	514613	514618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018620	GT	3	6	523627	523632	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018620	GA	3	6	530794	530799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018620	CT	4	8	539890	539897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_018620	AT	3	6	550954	550959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018620	GT	3	6	558911	558916	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018620	GA	3	6	584163	584168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018620	TG	3	6	584269	584274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018620	AC	3	6	584415	584420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_018620	AG	3	6	584639	584644	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018620	AC	3	6	595098	595103	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_018620	GT	3	6	595118	595123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018620	AG	3	6	595229	595234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018620	TC	3	6	595412	595417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018620	AT	3	6	598068	598073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018620	TA	4	8	598212	598219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018620	GA	5	10	615343	615352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018620	CT	3	6	615388	615393	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_018620	CT	3	6	616771	616776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018620	AC	3	6	621745	621750	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018620	TA	3	6	623539	623544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018620	AT	3	6	623559	623564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018620	CT	3	6	625884	625889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018620	AG	3	6	638678	638683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018620	TA	4	8	638997	639004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018620	TC	3	6	641918	641923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_018620	CT	3	6	644701	644706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018620	TA	3	6	644809	644814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018620	TC	3	6	646399	646404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018620	CA	3	6	647743	647748	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_018620	AT	3	6	658975	658980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018620	CT	3	6	659179	659184	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_018620	CT	3	6	671317	671322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018620	GC	3	6	678147	678152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018620	AT	3	6	682742	682747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018620	TG	3	6	686833	686838	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_018620	CT	3	6	687366	687371	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_018620	AG	3	6	687475	687480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018620	GA	4	8	687797	687804	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.