MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 415

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018620	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018620	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018620	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018620	TTTC	2	8	17681	17688	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018620	TGTC	2	8	24055	24062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018620	AGCT	2	8	24168	24175	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018620	ATTT	2	8	26653	26660	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018620	ATTA	2	8	26664	26671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018620	TTTC	2	8	31645	31652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018620	TCTA	2	8	32049	32056	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018620	AATT	2	8	32373	32380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018620	TTAA	2	8	32413	32420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018620	TTAA	2	8	33509	33516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018620	AGAT	2	8	33552	33559	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018620	TCAA	2	8	37774	37781	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_018620	GTCG	2	8	44193	44200	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018620	ATAA	2	8	49526	49533	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018620	AAAG	2	8	52606	52613	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018620	TTTA	2	8	52616	52623	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018620	AAAG	2	8	54782	54789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018620	CTTT	2	8	64530	64537	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_018620	TAAT	2	8	77623	77630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018620	TATT	2	8	77640	77647	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018620	TTAA	2	8	77649	77656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018620	TAAA	2	8	77680	77687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018620	ATTA	2	8	77697	77704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018620	TAAG	2	8	80580	80587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018620	AAAG	2	8	83449	83456	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018620	TTTA	2	8	87362	87369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018620	ATAA	2	8	87418	87425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018620	ATGT	2	8	93600	93607	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018620	ATAC	2	8	99158	99165	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018620	AACA	2	8	99329	99336	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018620	TGAT	2	8	99597	99604	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018620	TTAA	2	8	107078	107085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018620	CCGC	2	8	111321	111328	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_018620	ATTT	2	8	122724	122731	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018620	AAAG	2	8	122899	122906	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018620	TAAT	2	8	123068	123075	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018620	TTAA	2	8	128483	128490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018620	CTGG	2	8	128634	128641	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018620	TTTA	2	8	128660	128667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018620	TAGT	2	8	140219	140226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018620	TTAT	2	8	146060	146067	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018620	TTAT	2	8	146095	146102	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018620	GTAA	2	8	146116	146123	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018620	TAGG	2	8	146930	146937	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018620	TCGT	2	8	148203	148210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018620	AAAG	2	8	148488	148495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018620	AAAG	2	8	148536	148543	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018620	GATG	2	8	159277	159284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018620	AGGT	2	8	159305	159312	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018620	TAAA	2	8	164414	164421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018620	AAAT	2	8	164465	164472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018620	TAGT	2	8	169976	169983	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018620	TTCC	2	8	170288	170295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_018620	AAGA	2	8	173573	173580	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018620	TAAA	2	8	179257	179264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018620	TTTA	2	8	179318	179325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018620	AACT	2	8	179334	179341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018620	GATT	2	8	187202	187209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018620	AGAT	2	8	191689	191696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018620	GTTT	2	8	193622	193629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018620	GCTA	2	8	195100	195107	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018620	GTCT	2	8	195324	195331	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_018620	TAAA	3	12	195362	195373	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018620	GTTT	2	8	196412	196419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018620	TCAC	2	8	198058	198065	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_018620	ATTA	2	8	198330	198337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018620	CTTT	2	8	198457	198464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018620	ATTA	2	8	198635	198642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018620	TAAT	2	8	200966	200973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018620	TAAA	2	8	203979	203986	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018620	TTTA	2	8	205548	205555	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018620	GTTT	2	8	211760	211767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018620	AAAG	2	8	213155	213162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018620	CATA	2	8	213432	213439	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018620	ATGT	2	8	213548	213555	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018620	TTAG	2	8	215201	215208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018620	AAGA	2	8	222818	222825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018620	AACA	2	8	226636	226643	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018620	ATTA	2	8	232140	232147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018620	CTTG	2	8	238065	238072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018620	GAAT	2	8	238115	238122	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018620	TAAT	2	8	239616	239623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018620	ATAA	2	8	239733	239740	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018620	GTTT	2	8	240783	240790	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018620	AGGA	2	8	243942	243949	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018620	TAAA	2	8	262910	262917	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018620	GTTC	2	8	266597	266604	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018620	TAAT	2	8	266700	266707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018620	AATT	2	8	266715	266722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018620	TAAT	2	8	267792	267799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018620	TAAA	2	8	267906	267913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018620	TTGT	2	8	274533	274540	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018620	AAAT	2	8	276578	276585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018620	TACT	2	8	280729	280736	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018620	AATT	2	8	280750	280757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018620	TGTA	2	8	280793	280800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018620	GTTT	2	8	281702	281709	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018620	ATTT	2	8	289356	289363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018620	TAAT	3	12	289403	289414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018620	TAGA	2	8	291239	291246	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018620	TCTA	2	8	291271	291278	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018620	TATT	2	8	291322	291329	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018620	AATG	2	8	299413	299420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018620	GTTT	2	8	299563	299570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018620	ATTG	2	8	300967	300974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018620	TTGA	2	8	301038	301045	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018620	GAAA	2	8	307439	307446	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018620	CTAC	2	8	307507	307514	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018620	GGGA	2	8	310167	310174	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018620	ATGC	2	8	318697	318704	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_018620	GTAG	2	8	319485	319492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018620	GCTG	2	8	321575	321582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018620	CTGT	2	8	322915	322922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018620	TGCA	2	8	327019	327026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018620	AAAG	2	8	327156	327163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018620	GTTA	2	8	336610	336617	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018620	GACG	2	8	338545	338552	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_018620	TATG	2	8	339637	339644	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018620	TATT	2	8	339658	339665	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018620	TGGT	2	8	341984	341991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018620	ATAA	2	8	343461	343468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018620	ATAG	2	8	343588	343595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018620	ATGT	2	8	343873	343880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018620	TCTT	2	8	344089	344096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018620	TATT	2	8	345133	345140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018620	AGAA	2	8	346090	346097	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018620	ATTT	2	8	348635	348642	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018620	TAGT	2	8	348690	348697	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018620	ATAC	2	8	350898	350905	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018620	TTTG	2	8	356190	356197	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018620	TCTT	2	8	356426	356433	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018620	GCTT	2	8	357538	357545	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018620	TTAA	2	8	366446	366453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018620	ATCT	2	8	369459	369466	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018620	AACT	2	8	370303	370310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_018620	TAAT	2	8	383988	383995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018620	AAGA	2	8	384023	384030	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018620	ATTA	2	8	384048	384055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018620	AAAC	2	8	385360	385367	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018620	GTTT	2	8	395707	395714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018620	TTAA	2	8	395729	395736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018620	TAAT	2	8	395748	395755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018620	AAAG	2	8	398736	398743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018620	ATTA	2	8	411969	411976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018620	CAAT	2	8	414620	414627	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018620	ATTT	2	8	414674	414681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018620	AATA	2	8	415794	415801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018620	CTTT	2	8	419495	419502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018620	GTAA	2	8	419576	419583	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.