MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci GR9 chromosome

Total Repeats: 2844

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018620	T	6	6	422704	422709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_018620	TTA	2	6	422711	422716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_018620	TAT	2	6	423943	423948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_018620	T	7	7	423948	423954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018620	AAT	2	6	423971	423976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_018620	ATT	2	6	423996	424001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_018620	GA	3	6	424030	424035	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_018620	TGT	2	6	424037	424042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018620	ATT	2	6	429557	429562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_018620	ATA	2	6	429564	429569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018620	TTG	2	6	430092	430097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_018620	GTC	2	6	430107	430112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018620	ACGA	2	8	430148	430155	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_018620	GAT	2	6	430252	430257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_018620	TTTC	2	8	430313	430320	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1016	NC_018620	TAT	2	6	430351	430356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018620	TCAT	2	8	430367	430374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_018620	GAG	2	6	432244	432249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018620	ATT	2	6	432266	432271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018620	T	7	7	432317	432323	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_018620	TTTA	2	8	432352	432359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_018620	AAC	2	6	434335	434340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_018620	T	7	7	434681	434687	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018620	A	7	7	434688	434694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_018620	GA	3	6	434762	434767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018620	T	6	6	434810	434815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_018620	TCT	2	6	434830	434835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_018620	CAA	2	6	434869	434874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018620	TTA	2	6	434893	434898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018620	ATG	2	6	437483	437488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018620	T	6	6	437491	437496	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018620	AGGA	2	8	437519	437526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_018620	TCTT	2	8	437533	437540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1034	NC_018620	AGC	2	6	439239	439244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_018620	AAG	2	6	439248	439253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_018620	TC	3	6	439295	439300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_018620	ATTTT	2	10	440776	440785	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_018620	TTA	2	6	440845	440850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_018620	A	7	7	440873	440879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018620	ATA	2	6	441109	441114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018620	TAC	2	6	441143	441148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018620	ATC	2	6	441209	441214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_018620	AAC	2	6	441253	441258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_018620	AG	3	6	441279	441284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_018620	TGAG	2	8	441332	441339	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1049	NC_018620	ATTA	2	8	442461	442468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018620	TA	3	6	442467	442472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_018620	TTTA	2	8	442500	442507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018620	CT	3	6	443750	443755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_018620	TTA	2	6	443764	443769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_018620	TAT	2	6	443771	443776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018620	A	6	6	443786	443791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018620	A	6	6	443808	443813	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018620	ATT	2	6	443824	443829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018620	AAG	2	6	443845	443850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_018620	TTGA	2	8	443873	443880	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_018620	ATA	2	6	449432	449437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_018620	T	6	6	449582	449587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_018620	TGA	2	6	449644	449649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018620	GTG	2	6	449658	449663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018620	A	8	8	449672	449679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_018620	GCTTC	2	10	449690	449699	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1066	NC_018620	AGA	2	6	449748	449753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_018620	AAG	2	6	453711	453716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_018620	T	6	6	454275	454280	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018620	TAAA	2	8	454331	454338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018620	TCCT	2	8	454361	454368	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_018620	GAA	2	6	454612	454617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018620	T	6	6	454687	454692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018620	TG	3	6	454706	454711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018620	AG	3	6	454855	454860	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_018620	T	6	6	456917	456922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1079	NC_018620	TTA	2	6	456983	456988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1081	NC_018620	GTAA	2	8	457020	457027	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_018620	ATAGA	2	10	457686	457695	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_018620	T	7	7	457706	457712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1089	NC_018620	TAT	2	6	460042	460047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1091	NC_018620	ATA	2	6	460070	460075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018620	TAA	2	6	460118	460123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_018620	TAA	2	6	462923	462928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018620	AATT	2	8	462930	462937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018620	TAA	2	6	462945	462950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_018620	ATT	2	6	462963	462968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_018620	ATT	3	9	462970	462978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1100	NC_018620	ATGTA	2	10	464574	464583	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1102	NC_018620	A	8	8	464608	464615	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018620	T	8	8	464625	464632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1106	NC_018620	AG	3	6	471136	471141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_018620	TCA	2	6	471198	471203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_018620	TAAAT	2	10	471216	471225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018620	AACTT	2	10	471229	471238	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1110	NC_018620	T	6	6	471250	471255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018620	AGT	2	6	472427	472432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_018620	TA	3	6	472450	472455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_018620	TAAAT	2	10	472502	472511	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018620	GAT	2	6	472531	472536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018620	T	6	6	472549	472554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018620	T	7	7	472582	472588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_018620	TAT	2	6	472613	472618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018620	GGA	2	6	473539	473544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018620	T	7	7	473563	473569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_018620	A	6	6	473685	473690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_018620	ATA	2	6	473787	473792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_018620	CAA	2	6	473793	473798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_018620	GCT	2	6	473831	473836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1125	NC_018620	T	7	7	475308	475314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018620	TTA	2	6	475326	475331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_018620	AG	3	6	475362	475367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018620	T	8	8	475368	475375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_018620	TA	3	6	475442	475447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_018620	T	6	6	475469	475474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_018620	TAA	2	6	475785	475790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018620	AGA	2	6	475913	475918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_018620	AAATA	2	10	477822	477831	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_018620	T	7	7	477858	477864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_018620	ATT	2	6	477881	477886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_018620	GAAA	2	8	477887	477894	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_018620	A	6	6	477892	477897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_018620	TTAAA	2	10	478981	478990	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_018620	TAA	2	6	609661	609666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_018620	TAAT	2	8	609674	609681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_018620	TATT	2	8	609690	609697	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1423	NC_018620	TTA	2	6	609727	609732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1424	NC_018620	ATT	2	6	614383	614388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_018620	T	11	11	614411	614421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1426	NC_018620	T	6	6	614466	614471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1427	NC_018620	TAA	2	6	614480	614485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1428	NC_018620	ATT	2	6	614492	614497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_018620	TAA	2	6	614509	614514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1432	NC_018620	AAG	3	9	615379	615387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_018620	T	6	6	615397	615402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_018620	ATTA	2	8	616609	616616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1442	NC_018620	CTT	2	6	616919	616924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1443	NC_018620	TTAA	2	8	620142	620149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_018620	AAC	2	6	621692	621697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1449	NC_018620	TTAC	2	8	623478	623485	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1450	NC_018620	A	8	8	623496	623503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_018620	TA	3	6	623539	623544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_018620	AT	3	6	623559	623564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1453	NC_018620	GAAA	2	8	624540	624547	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1454	NC_018620	T	6	6	624618	624623	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1455	NC_018620	AGCT	2	8	624651	624658	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1456	NC_018620	TTC	2	6	624676	624681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1461	NC_018620	TAC	2	6	624844	624849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1464	NC_018620	AAT	2	6	625865	625870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1465	NC_018620	AAC	2	6	625874	625879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1466	NC_018620	CT	3	6	625884	625889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1471	NC_018620	AAT	2	6	626971	626976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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