MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 290

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018619	TC	3	6	31850	31855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018619	TC	3	6	37740	37745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_018619	TA	3	6	52212	52217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018619	TG	3	6	63304	63309	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018619	GA	3	6	97066	97071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018619	GA	3	6	98974	98979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018619	AG	3	6	101785	101790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018619	TA	3	6	108453	108458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018619	AG	3	6	112357	112362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018619	AT	3	6	118411	118416	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018619	AT	3	6	123202	123207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018619	TA	4	8	124048	124055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018619	TA	4	8	125316	125323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018619	TG	3	6	128419	128424	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018619	AC	3	6	128553	128558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_018619	AT	3	6	130230	130235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018619	TA	3	6	130513	130518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018619	CT	3	6	130609	130614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018619	CT	3	6	130740	130745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018619	GA	3	6	134352	134357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018619	AT	3	6	147201	147206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018619	AG	3	6	158072	158077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018619	AT	3	6	162578	162583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018619	TA	3	6	173158	173163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018619	AG	3	6	173202	173207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018619	AT	3	6	175396	175401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018619	AG	3	6	179456	179461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018619	CT	3	6	193696	193701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018619	AG	3	6	198332	198337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018619	TA	4	8	198353	198360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018619	AT	3	6	210345	210350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018619	AT	3	6	213229	213234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018619	AT	3	6	215421	215426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018619	GA	3	6	215481	215486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018619	GT	3	6	215521	215526	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018619	CT	3	6	215558	215563	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_018619	AG	3	6	215785	215790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018619	TC	3	6	215844	215849	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_018619	AG	3	6	222903	222908	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018619	TA	4	8	232236	232243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018619	AG	3	6	236982	236987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018619	AT	3	6	237052	237057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018619	GA	3	6	239871	239876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018619	AG	3	6	241080	241085	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018619	AG	3	6	244046	244051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018619	TC	3	6	251411	251416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018619	GT	3	6	261586	261591	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018619	TC	3	6	266695	266700	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_018619	AT	4	8	266734	266741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018619	TC	3	6	267838	267843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_018619	TG	3	6	267983	267988	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018619	AT	3	6	271354	271359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018619	TG	3	6	276766	276771	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018619	GT	3	6	277608	277613	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018619	TC	3	6	281929	281934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_018619	TA	3	6	281978	281983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018619	TC	3	6	301457	301462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_018619	AC	3	6	310556	310561	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_018619	AG	3	6	313532	313537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018619	GA	3	6	313582	313587	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018619	AC	3	6	319086	319091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_018619	GT	3	6	325598	325603	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018619	AG	3	6	328196	328201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018619	AG	3	6	328434	328439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018619	TG	3	6	329866	329871	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018619	GA	3	6	329912	329917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018619	TA	3	6	332683	332688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018619	AG	3	6	332829	332834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018619	TC	3	6	342290	342295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_018619	TA	3	6	345284	345289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018619	GT	3	6	347712	347717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018619	TG	3	6	349236	349241	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018619	CT	3	6	350787	350792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018619	TA	3	6	350860	350865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018619	TA	3	6	352271	352276	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018619	TA	3	6	356438	356443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018619	CT	4	8	359054	359061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_018619	AT	3	6	367735	367740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018619	TA	3	6	370374	370379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018619	AG	3	6	371380	371385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018619	AT	3	6	374772	374777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018619	CT	3	6	376347	376352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018619	TA	3	6	386890	386895	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018619	AC	3	6	390947	390952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_018619	TA	3	6	401488	401493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018619	CT	3	6	413555	413560	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018619	TC	3	6	421545	421550	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_018619	AT	3	6	425426	425431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018619	GA	3	6	429758	429763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018619	GA	3	6	440486	440491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018619	TC	3	6	445020	445025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_018619	AG	3	6	447002	447007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018619	CT	3	6	447073	447078	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_018619	TA	3	6	448189	448194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018619	CT	3	6	449471	449476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_018619	TG	3	6	460426	460431	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018619	AG	3	6	460575	460580	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018619	CT	4	8	463455	463462	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_018619	TA	3	6	465227	465232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018619	AG	3	6	470281	470286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018619	AG	3	6	476851	476856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018619	TA	3	6	478165	478170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018619	AC	3	6	479623	479628	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_018619	AG	3	6	481184	481189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018619	TA	3	6	481264	481269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018619	CT	3	6	487678	487683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_018619	AG	4	8	489666	489673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018619	TC	3	6	491238	491243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_018619	TA	3	6	494001	494006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018619	AT	3	6	499344	499349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018619	TC	3	6	501390	501395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_018619	GA	3	6	504522	504527	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018619	TC	3	6	505972	505977	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_018619	AT	3	6	513708	513713	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018619	AT	3	6	513746	513751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018619	AG	3	6	520431	520436	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018619	GT	3	6	529443	529448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_018619	AT	3	6	556767	556772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018619	GT	3	6	564720	564725	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018619	GA	3	6	589965	589970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018619	TG	3	6	590071	590076	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018619	AC	3	6	590217	590222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_018619	AG	3	6	590441	590446	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018619	AC	3	6	600896	600901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_018619	GT	3	6	600916	600921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018619	AG	3	6	601027	601032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018619	TC	3	6	601210	601215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_018619	AT	3	6	603865	603870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018619	TA	4	8	604009	604016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018619	CT	3	6	615535	615540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018619	GA	5	10	621141	621150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018619	CT	3	6	621186	621191	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_018619	CT	3	6	622570	622575	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_018619	AC	3	6	627544	627549	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_018619	TA	3	6	629339	629344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018619	AT	3	6	629359	629364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018619	CT	3	6	631682	631687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_018619	GA	3	6	644997	645002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018619	TC	4	8	645388	645395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_018619	TA	3	6	645396	645401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018619	TA	3	6	645494	645499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018619	AT	3	6	646647	646652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018619	CA	3	6	654163	654168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018619	AT	3	6	655244	655249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018619	TA	3	6	655503	655508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_018619	TA	3	6	656180	656185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018619	TG	3	6	661590	661595	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018619	AG	3	6	661715	661720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018619	TA	3	6	661771	661776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018619	CA	3	6	664481	664486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.