MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 440

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018619	GAAT	2	8	6851	6858	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018619	TAAA	2	8	17024	17031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018619	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018619	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018619	TTTC	2	8	31650	31657	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018619	TCTA	2	8	32054	32061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_018619	AATT	2	8	32378	32385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018619	TTAA	2	8	32418	32425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018619	TTAA	2	8	33514	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018619	AGAT	2	8	33557	33564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018619	TCAA	2	8	37779	37786	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018619	GTCG	2	8	44197	44204	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_018619	AAGA	2	8	48052	48059	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018619	ATAA	2	8	49529	49536	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018619	AAAG	2	8	52609	52616	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018619	TTTA	2	8	52619	52626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018619	AAAG	2	8	54787	54794	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018619	GAAG	2	8	56617	56624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018619	GTTT	2	8	59892	59899	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018619	TATG	2	8	59907	59914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018619	CTTT	2	8	64567	64574	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018619	TAAT	2	8	77660	77667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018619	TATT	2	8	77677	77684	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018619	TTAA	2	8	77686	77693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018619	TAAA	2	8	77717	77724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018619	ATTA	2	8	77734	77741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018619	TAAA	2	8	80498	80505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018619	AAAG	2	8	83478	83485	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018619	CAAG	2	8	84835	84842	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018619	TTTA	2	8	87391	87398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018619	ATAA	2	8	87446	87453	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018619	AGTT	2	8	87471	87478	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018619	ATGT	2	8	93626	93633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018619	GTTT	2	8	93738	93745	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018619	ATAC	2	8	99184	99191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018619	AACA	2	8	99355	99362	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018619	TGAT	2	8	99623	99630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018619	TTAA	2	8	107103	107110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018619	AAGG	2	8	108487	108494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018619	CCGC	2	8	111345	111352	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_018619	TTTC	2	8	122701	122708	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018619	ATTT	2	8	122747	122754	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018619	AAAG	2	8	122922	122929	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018619	TAAT	2	8	123091	123098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018619	TTAA	2	8	128506	128513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018619	CTGG	2	8	128657	128664	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_018619	TTTA	2	8	128683	128690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018619	TGAT	2	8	139114	139121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018619	TAGT	2	8	140242	140249	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018619	TTAT	2	8	146082	146089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018619	TTAT	2	8	146117	146124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018619	GTAA	2	8	146138	146145	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018619	ATTT	3	12	147525	147536	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018619	TAAG	2	8	148591	148598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018619	AAAG	2	8	148621	148628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018619	GATG	2	8	159365	159372	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018619	GTAG	2	8	159391	159398	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018619	GGAG	2	8	162852	162859	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018619	AAAT	2	8	164557	164564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018619	ACTT	2	8	164610	164617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018619	TAGT	2	8	170068	170075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018619	TTCC	2	8	170380	170387	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018619	TAAA	2	8	179340	179347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018619	TTTA	2	8	179401	179408	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018619	AACT	2	8	179417	179424	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_018619	CAAA	2	8	184463	184470	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018619	GATT	2	8	187284	187291	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018619	AGAT	2	8	191771	191778	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018619	GTTT	2	8	193704	193711	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018619	TATT	2	8	195430	195437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018619	TAAA	3	12	195461	195472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018619	GTTT	2	8	196511	196518	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018619	CACT	2	8	198159	198166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_018619	GCTT	2	8	198253	198260	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018619	CTTT	2	8	198413	198420	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018619	ATTA	2	8	198430	198437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018619	CTTT	2	8	198588	198595	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018619	AATC	2	8	198596	198603	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_018619	ATTA	2	8	198732	198739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018619	TAAT	2	8	201060	201067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018619	TAAA	2	8	204074	204081	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018619	TTTA	2	8	205643	205650	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018619	GTTT	2	8	211855	211862	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018619	GAAG	2	8	213188	213195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018619	AAAG	2	8	213250	213257	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018619	CATA	2	8	213527	213534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018619	ATGT	2	8	213643	213650	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018619	AAGA	2	8	222910	222917	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018619	AACA	2	8	226728	226735	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018619	ATTA	2	8	232230	232237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018619	CTTG	2	8	238156	238163	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018619	GAAT	2	8	238207	238214	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018619	AATT	2	8	238346	238353	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018619	TTTC	2	8	238446	238453	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018619	ATAA	2	8	239829	239836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018619	GTTT	2	8	240878	240885	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018619	TCAT	2	8	241108	241115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_018619	AGGA	2	8	244038	244045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018619	ACAT	2	8	251418	251425	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018619	TAAA	2	8	263003	263010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018619	GTTC	2	8	266689	266696	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_018619	TAAT	2	8	266793	266800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018619	AATT	2	8	266808	266815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018619	TAAT	2	8	267884	267891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018619	TAAA	2	8	267998	268005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018619	TATT	2	8	268077	268084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018619	GTAT	2	8	271266	271273	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018619	TTGT	2	8	274625	274632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018619	AAAT	2	8	276670	276677	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018619	TACT	2	8	281018	281025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_018619	AATT	2	8	281039	281046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018619	TGTA	2	8	281082	281089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018619	GTTT	2	8	281991	281998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018619	TCGT	2	8	283632	283639	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018619	TATC	2	8	287667	287674	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018619	ATTT	2	8	289642	289649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018619	TAAT	3	12	289689	289700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018619	TAGA	2	8	291524	291531	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018619	TCTA	2	8	291556	291563	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018619	TATT	2	8	291607	291614	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018619	AATG	2	8	299703	299710	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018619	ATTG	2	8	301255	301262	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018619	TTGA	2	8	301326	301333	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018619	GATT	2	8	307606	307613	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018619	GGGA	2	8	310467	310474	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018619	ATGC	2	8	318998	319005	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018619	TTCG	2	8	319119	319126	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_018619	AGGA	2	8	319136	319143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018619	CTGT	2	8	320473	320480	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018619	GCTG	2	8	327167	327174	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_018619	AAAG	2	8	332757	332764	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018619	TTTG	2	8	335992	335999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018619	AGTT	2	8	342196	342203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018619	CAGA	2	8	343040	343047	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_018619	TGAT	2	8	343066	343073	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018619	TATT	2	8	345252	345259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018619	ATAA	2	8	349062	349069	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018619	TCTT	2	8	349827	349834	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_018619	AGAA	2	8	351829	351836	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018619	ATTT	2	8	354374	354381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018619	TAGT	2	8	354429	354436	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018619	ATAC	2	8	356636	356643	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_018619	TTTG	2	8	361927	361934	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018619	TCTT	2	8	362163	362170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_018619	GCTT	2	8	363275	363282	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_018619	TCTT	2	8	370174	370181	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018619	TTAA	2	8	372181	372188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018619	ATCT	2	8	375193	375200	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_018619	AACT	2	8	376038	376045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018619	GTTT	2	8	387023	387030	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.