MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-QVLC chromosome

Total Repeats: 4292

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018618	T	6	6	2995	3000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018618	TGT	2	6	3004	3009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018618	TATT	2	8	3023	3030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018618	TCT	2	6	3062	3067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018618	GTT	2	6	3073	3078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018618	T	8	8	3104	3111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018618	T	6	6	3115	3120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018618	T	9	9	3122	3130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018618	T	7	7	3150	3156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018618	TTA	3	9	3161	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018618	GTT	2	6	3170	3175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018618	T	7	7	3191	3197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018618	TTATT	2	10	3203	3212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018618	TGTTT	2	10	3222	3231	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018618	TTTTG	2	10	3247	3256	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018618	TGTA	2	8	3267	3274	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018618	TGT	2	6	3282	3287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018618	AGTA	2	8	3294	3301	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018618	AGT	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018618	ATA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018618	ATG	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018618	T	6	6	3367	3372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018618	TGT	2	6	3400	3405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018618	ATT	2	6	3412	3417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018618	TAAT	2	8	3422	3429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018618	A	8	8	3430	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018618	AT	4	8	3447	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018618	GTTT	2	8	3496	3503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018618	GGTT	2	8	3517	3524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018618	TATT	2	8	3536	3543	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018618	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018618	TTTA	2	8	3583	3590	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018618	TAT	2	6	3645	3650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018618	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018618	TAAAA	2	10	3710	3719	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018618	GTT	2	6	3727	3732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018618	CTGTTG	4	24	3743	3766	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_018618	A	7	7	3786	3792	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018618	TAT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018618	TTA	3	9	3823	3831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018618	T	6	6	3848	3853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018618	GTT	2	6	3862	3867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018618	TAAAG	2	10	3880	3889	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018618	GTA	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018618	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018618	TAT	2	6	3927	3932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018618	T	7	7	3939	3945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018618	TAA	3	9	3952	3960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018618	AAC	2	6	3964	3969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018618	CAA	2	6	3983	3988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_018618	ACAAA	2	10	3989	3998	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_018618	TAA	2	6	4025	4030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018618	ACA	2	6	4031	4036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_018618	AAC	2	6	4067	4072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_018618	TAA	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018618	ACA	2	6	4094	4099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_018618	TAC	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_018618	AACA	2	8	4151	4158	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_018618	TA	3	6	4165	4170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018618	AAC	2	6	4191	4196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018618	A	7	7	4216	4222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018618	ACAA	2	8	4257	4264	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018618	A	9	9	4266	4274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018618	A	8	8	4301	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018618	AATTA	2	10	4315	4324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018618	TCCAT	3	15	15854	15868	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
67	NC_018618	TCTAT	4	20	15869	15888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_018618	T	9	9	18678	18686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018618	ATTG	2	8	18689	18696	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018618	T	6	6	18697	18702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018618	TTAG	2	8	18704	18711	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018618	TGTA	2	8	18724	18731	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018618	GAT	2	6	18733	18738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018618	TTG	2	6	18741	18746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018618	T	6	6	18807	18812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018618	TGT	2	6	18908	18913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018618	TG	3	6	18999	19004	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018618	A	8	8	19056	19063	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018618	TTTA	2	8	19576	19583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018618	TA	3	6	19602	19607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018618	ACC	2	6	19637	19642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_018618	TTTCT	2	10	19649	19658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_018618	TAC	2	6	19730	19735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_018618	T	7	7	19757	19763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018618	TAA	2	6	19784	19789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018618	AAAC	2	8	19803	19810	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018618	CAA	2	6	19853	19858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018618	TC	3	6	19866	19871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018618	TTTA	2	8	19874	19881	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018618	CAA	2	6	19910	19915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_018618	TATT	2	8	19928	19935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018618	AAC	2	6	19936	19941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_018618	T	8	8	19988	19995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018618	TTG	2	6	19998	20003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018618	T	7	7	20026	20032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018618	ATT	2	6	20051	20056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018618	TAT	2	6	20069	20074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018618	CT	3	6	20097	20102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018618	CTT	2	6	20127	20132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018618	T	8	8	20134	20141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018618	TTA	2	6	20151	20156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018618	TGT	2	6	20220	20225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018618	T	10	10	20240	20249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018618	TAT	2	6	20254	20259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018618	TTA	2	6	20295	20300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018618	TTTA	2	8	20369	20376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018618	AT	3	6	20379	20384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018618	TAT	2	6	20400	20405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018618	TGTAGT	2	12	20420	20431	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018618	T	10	10	20518	20527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018618	T	8	8	20559	20566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018618	TTA	2	6	20571	20576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018618	TCT	2	6	20580	20585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_018618	TGT	2	6	20595	20600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018618	TGTTT	2	10	20622	20631	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018618	A	7	7	20643	20649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018618	TTA	2	6	20680	20685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018618	TGC	2	6	20713	20718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018618	ATT	2	6	20791	20796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018618	AGA	2	6	20818	20823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018618	GTTA	2	8	20837	20844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018618	TGT	2	6	20854	20859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018618	GTT	3	9	20910	20918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018618	T	8	8	20926	20933	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018618	T	6	6	20942	20947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018618	T	7	7	20957	20963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018618	GTT	2	6	20964	20969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018618	T	6	6	20979	20984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018618	TGTT	2	8	20989	20996	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018618	TTTTG	2	10	21064	21073	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018618	TTTA	2	8	21081	21088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018618	TGT	3	9	21094	21102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018618	T	7	7	21142	21148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018618	TAT	3	9	21164	21172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018618	T	6	6	21172	21177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018618	TGT	2	6	21194	21199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018618	TGT	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018618	TAT	2	6	21245	21250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018618	TGT	2	6	21282	21287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018618	ATTAT	2	10	21291	21300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018618	TGT	2	6	21328	21333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018618	TAA	2	6	21339	21344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018618	TTGA	2	8	21382	21389	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018618	TTTTA	2	10	21416	21425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018618	TGTA	2	8	21430	21437	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018618	TAT	2	6	21442	21447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018618	TGTAA	2	10	21464	21473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018618	CTTTT	2	10	21491	21500	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_018618	ACA	3	9	21501	21509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_018618	ATT	2	6	21538	21543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018618	TATT	3	12	21540	21551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018618	T	6	6	21561	21566	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_018618	ATTA	2	8	21605	21612	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018618	TAG	2	6	21632	21637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_018618	TAG	2	6	21639	21644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_018618	GTT	2	6	21648	21653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_018618	T	7	7	21679	21685	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_018618	TGT	2	6	21695	21700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_018618	TA	3	6	21764	21769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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