MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella plasmid pCher

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018606	TTTC	2	8	188	195	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_018606	TTAT	2	8	3435	3442	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018606	AATG	2	8	3484	3491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018606	ACAA	2	8	3592	3599	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_018606	AGAC	2	8	5678	5685	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018606	AAAT	2	8	5947	5954	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018606	GTCT	2	8	7195	7202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_018606	AGAA	2	8	8424	8431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018606	CTAT	2	8	8573	8580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018606	TTCT	2	8	9490	9497	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018606	ATTT	2	8	11700	11707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018606	TATT	2	8	15078	15085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018606	AAAT	2	8	22625	22632	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018606	AGAA	2	8	25452	25459	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018606	TCCC	2	8	28553	28560	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_018606	ATAC	2	8	30795	30802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018606	TAAT	2	8	31193	31200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018606	TTAT	2	8	31243	31250	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018606	TAAA	2	8	31806	31813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018606	ACTT	2	8	31876	31883	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018606	TTAT	2	8	31892	31899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018606	ACTA	2	8	34814	34821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018606	TCGT	2	8	35973	35980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018606	TAGG	2	8	36066	36073	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018606	ATAA	2	8	37278	37285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018606	AGAC	2	8	38858	38865	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018606	ATTT	2	8	40624	40631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018606	TTAG	2	8	40872	40879	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018606	AGAA	2	8	42865	42872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018606	ATTT	2	8	43047	43054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018606	ACCT	2	8	43113	43120	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018606	TACA	2	8	43568	43575	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018606	CAAT	2	8	44790	44797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018606	CTTT	2	8	47208	47215	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018606	CTAT	2	8	47620	47627	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_018606	TAAT	2	8	47850	47857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018606	ATTT	2	8	47975	47982	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018606	TCAT	2	8	48154	48161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018606	TTTA	2	8	48278	48285	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018606	ACTT	2	8	48494	48501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018606	GTAG	2	8	49583	49590	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018606	ATTT	2	8	49708	49715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018606	ATTT	2	8	51089	51096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018606	CTTT	2	8	51170	51177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_018606	TCCA	2	8	51208	51215	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018606	TAAA	2	8	51592	51599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018606	TAAA	2	8	53128	53135	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018606	TTAT	2	8	53149	53156	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018606	TTTG	2	8	53416	53423	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018606	ATTA	2	8	53436	53443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018606	TAAA	2	8	53458	53465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018606	ATTT	2	8	53555	53562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.