MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Cardinium endosymbiont cEper1 of Encarsia pergandiella

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018605	TTGGC	2	10	5092	5101	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_018605	AGTTA	2	10	6353	6362	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018605	TAAAA	2	10	14342	14351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018605	TATTT	2	10	32827	32836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018605	TAATC	2	10	43607	43616	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_018605	CCTAG	2	10	52463	52472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_018605	TAAAA	2	10	55463	55472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018605	AAATC	2	10	71619	71628	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018605	ATAGA	2	10	72519	72528	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018605	AGACA	2	10	81887	81896	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_018605	TACAC	2	10	100881	100890	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_018605	ATTTT	2	10	101020	101029	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018605	ATTTT	2	10	102078	102087	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018605	ATAAA	2	10	112508	112517	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018605	TAAAT	2	10	115329	115338	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018605	AAAAT	2	10	131893	131902	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018605	ATAGT	2	10	148616	148625	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018605	TAATT	2	10	156827	156836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018605	ACCAT	2	10	157723	157732	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_018605	CTTTC	2	10	170419	170428	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018605	TAAAA	2	10	175803	175812	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018605	ATTTT	2	10	175836	175845	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018605	AAACC	2	10	185499	185508	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_018605	TAATA	2	10	186254	186263	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018605	TTGGA	2	10	189286	189295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018605	TTTTC	2	10	221353	221362	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_018605	TATAT	2	10	243359	243368	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018605	ATCAC	2	10	247590	247599	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_018605	CTACA	2	10	252905	252914	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_018605	GCACA	2	10	268568	268577	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_018605	ATTAT	2	10	268721	268730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018605	TACGG	2	10	270038	270047	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_018605	TTTTC	2	10	270404	270413	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_018605	TTTTC	2	10	271478	271487	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_018605	CTCAA	2	10	292899	292908	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_018605	TATAG	2	10	294488	294497	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018605	CTTCT	2	10	298410	298419	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_018605	ATTTT	2	10	300424	300433	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018605	ATTTA	2	10	300687	300696	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018605	ATTAT	2	10	303961	303970	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018605	GTATT	2	10	305185	305194	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018605	TATAA	2	10	305245	305254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018605	TATTC	2	10	305468	305477	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_018605	TCAAT	2	10	306665	306674	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_018605	AAGTC	2	10	313866	313875	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_018605	TATTT	2	10	327595	327604	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018605	CATAT	2	10	330963	330972	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_018605	CTTTT	2	10	331004	331013	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_018605	TCATC	2	10	331858	331867	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_018605	AGTGC	2	10	335760	335769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_018605	TAAAT	2	10	338781	338790	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018605	ATATA	2	10	341822	341831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018605	AATGG	2	10	350863	350872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018605	TCATA	2	10	353894	353903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018605	AGATA	2	10	374364	374373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018605	TTAAA	2	10	385988	385997	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018605	TTAAG	2	10	394497	394506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018605	CATTA	2	10	409173	409182	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018605	TAAAA	2	10	421406	421415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018605	GAACC	2	10	422328	422337	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018605	ACAAA	2	10	428567	428576	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018605	TTATA	2	10	432836	432845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018605	GTAAA	2	10	436345	436354	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018605	TTAAT	2	10	446205	446214	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018605	GTAAA	2	10	447233	447242	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018605	GTTTT	2	10	453755	453764	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018605	TGGTA	2	10	467973	467982	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018605	CAATA	2	10	469924	469933	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_018605	TTGAT	2	10	473858	473867	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018605	TGTTT	2	10	485823	485832	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018605	GATAC	2	10	497471	497480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_018605	TTTGA	2	10	500552	500561	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018605	TATAT	2	10	511824	511833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018605	AATAT	2	10	512495	512504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018605	TTAAA	2	10	512611	512620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018605	CTATT	2	10	513313	513322	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018605	TAATA	2	10	517700	517709	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018605	CTTTT	2	10	517729	517738	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_018605	ATTTA	2	10	522381	522390	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018605	AGACT	2	10	529986	529995	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_018605	TCTAT	2	10	533731	533740	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_018605	AATTT	2	10	538309	538318	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018605	TTCAG	2	10	545541	545550	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_018605	CGTTA	2	10	551065	551074	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_018605	TATAT	2	10	551075	551084	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018605	TAAAA	2	10	551155	551164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018605	ACCCA	2	10	553293	553302	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
88	NC_018605	ACTAT	2	10	556073	556082	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_018605	AGATA	2	10	562270	562279	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018605	ATAAA	2	10	569411	569420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018605	TATAA	2	10	573873	573882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018605	AATTT	2	10	575402	575411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018605	AAGAA	2	10	576833	576842	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018605	ATAGC	2	10	577037	577046	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018605	TACCA	2	10	599969	599978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_018605	TAAAA	2	10	602719	602728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018605	ATGGA	2	10	605750	605759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018605	AGTAT	2	10	605995	606004	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018605	AAAGT	2	10	637885	637894	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018605	ATGGT	2	10	645130	645139	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018605	TTGTT	2	10	656543	656552	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018605	AAATT	2	10	661388	661397	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018605	CTTTC	2	10	664455	664464	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_018605	ACTAC	2	10	668163	668172	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_018605	TATTT	2	10	668254	668263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018605	TAAAT	2	10	684626	684635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018605	TGATA	2	10	686505	686514	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018605	TTGTT	2	10	697327	697336	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018605	ATTAT	2	10	699116	699125	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018605	GCTAC	2	10	702421	702430	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_018605	ATTAC	2	10	712602	712611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018605	ATAGT	2	10	723920	723929	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018605	GAATT	2	10	724070	724079	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018605	CTGCT	2	10	724293	724302	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_018605	GATAT	2	10	727259	727268	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018605	ATTAT	2	10	734861	734870	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018605	TACCG	2	10	735353	735362	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_018605	AAAAT	2	10	735379	735388	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018605	TAAAG	2	10	736176	736185	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018605	GATTT	2	10	736477	736486	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018605	AAATA	2	10	740292	740301	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018605	TGTCT	2	10	751225	751234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018605	ACCAT	2	10	754126	754135	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
124	NC_018605	CTATA	2	10	767016	767025	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_018605	AAAAC	2	10	769084	769093	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_018605	TGATT	2	10	774176	774185	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018605	TATAC	2	10	775820	775829	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018605	ATCAA	2	10	777037	777046	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_018605	ATTGG	2	10	782191	782200	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018605	TATGG	2	10	787444	787453	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018605	TTTTA	2	10	793748	793757	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018605	TATAT	2	10	799225	799234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018605	GATGG	2	10	808100	808109	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018605	AAATC	2	10	818578	818587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_018605	GCGTA	2	10	821941	821950	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_018605	AACTA	2	10	822096	822105	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_018605	AGGTT	2	10	823115	823124	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018605	TTTAG	2	10	826918	826927	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018605	TTATT	2	10	844038	844047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018605	TTTGT	2	10	846100	846109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018605	GCTTA	2	10	849902	849911	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_018605	AATAA	2	10	856600	856609	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018605	ATATT	2	10	879869	879878	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_018605	GTACA	2	10	881680	881689	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_018605	ATATT	2	10	886354	886363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018605	CAATA	2	10	886379	886388	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_018605	AAATA	2	10	886418	886427	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.