MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni NCTC 11168-BN148

Total Repeats: 213

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018521	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018521	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018521	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018521	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018521	AAAAT	2	10	23612	23621	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018521	GTTAA	2	10	23639	23648	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018521	TATAT	2	10	38733	38742	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018521	CTTTT	2	10	39020	39029	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_018521	CTTTT	2	10	39190	39199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_018521	GGTAA	2	10	39502	39511	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018521	TCGTG	2	10	40298	40307	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_018521	TCTTT	2	10	41326	41335	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_018521	TAACT	2	10	41340	41349	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_018521	CCGTA	2	10	43185	43194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_018521	AGCTT	2	10	51945	51954	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_018521	AAAAT	2	10	66514	66523	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018521	ATTAC	2	10	66870	66879	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_018521	AAAAT	2	10	67562	67571	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018521	TTTAT	2	10	70233	70242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018521	TCTCT	2	10	76442	76451	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_018521	ATTTT	2	10	83214	83223	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018521	TAAGA	2	10	83630	83639	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018521	TTAAT	2	10	83939	83948	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018521	TATTT	2	10	84007	84016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018521	TATAA	2	10	84024	84033	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018521	TAAAA	2	10	88773	88782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018521	TTGGC	2	10	94134	94143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_018521	AAGAT	2	10	94221	94230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018521	TATTT	2	10	152057	152066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018521	TTATT	2	10	166253	166262	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018521	TATTT	2	10	179275	179284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018521	TAAAA	2	10	189467	189476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018521	AAAAT	2	10	193635	193644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018521	AAGTG	2	10	196515	196524	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018521	AGGAT	2	10	197697	197706	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018521	TAAAA	2	10	199055	199064	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018521	TAGAT	2	10	208738	208747	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018521	AAAAT	2	10	224185	224194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018521	AAATT	2	10	226022	226031	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018521	CTTTT	2	10	226067	226076	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_018521	TAAAT	2	10	228936	228945	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018521	CATAA	2	10	234516	234525	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_018521	ATATT	2	10	245386	245395	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018521	ATTAA	2	10	248663	248672	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018521	TTAAT	2	10	250579	250588	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018521	AAGTA	2	10	267920	267929	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018521	ATAAA	2	10	268941	268950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018521	AATTT	2	10	276894	276903	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018521	TTAAA	3	15	301842	301856	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018521	GAGTA	2	10	308490	308499	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018521	TTTTA	2	10	320765	320774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018521	ATTAA	2	10	336838	336847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018521	ATTAA	2	10	339331	339340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018521	CTTTT	2	10	393901	393910	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_018521	CTTTT	2	10	394071	394080	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_018521	GGTAA	2	10	394383	394392	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018521	TCGTG	2	10	395179	395188	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_018521	TCTTT	2	10	396207	396216	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_018521	TAACT	2	10	396221	396230	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_018521	CCGTA	2	10	398066	398075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_018521	CTTAT	2	10	405176	405185	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_018521	ATTTT	2	10	409703	409712	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018521	TCAAA	2	10	412346	412355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_018521	AAGGT	2	10	413361	413370	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018521	CAAAT	2	10	413853	413862	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_018521	TTGGT	2	10	414058	414067	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018521	ATAGA	2	10	414072	414081	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018521	GATGG	2	10	414339	414348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018521	TAAAT	2	10	431008	431017	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018521	TTGCT	2	10	434370	434379	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_018521	TTATT	2	10	448480	448489	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018521	TTTAT	2	10	457115	457124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018521	GATTT	2	10	457638	457647	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018521	TTTTA	2	10	465182	465191	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018521	TTGTG	2	10	465401	465410	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018521	CTTTT	2	10	465554	465563	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018521	TTTTA	2	10	485652	485661	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018521	TTTAA	2	10	486533	486542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018521	AAATA	2	10	486589	486598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018521	AAAAT	2	10	510090	510099	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018521	GTTTT	2	10	513183	513192	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018521	AAATA	2	10	513492	513501	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018521	CATTC	2	10	514209	514218	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_018521	TTTTA	2	10	522499	522508	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018521	AAAAT	2	10	522533	522542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018521	AATTA	2	10	524993	525002	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018521	TTTGA	2	10	540157	540166	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018521	ATTTG	2	10	541318	541327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018521	TAAAA	2	10	555180	555189	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018521	GATAA	2	10	578331	578340	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018521	TTTAA	2	10	587721	587730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018521	ACAAT	2	10	591470	591479	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_018521	GAAAA	2	10	598774	598783	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018521	TTTGC	2	10	602295	602304	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_018521	AATTA	2	10	616505	616514	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018521	TTTAA	2	10	625489	625498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018521	ATTTT	2	10	627416	627425	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018521	TACTT	2	10	628040	628049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_018521	AGAAA	2	10	628128	628137	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018521	TGGCT	2	10	628681	628690	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_018521	TACAA	2	10	631302	631311	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_018521	TAAAA	3	15	656017	656031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018521	ATAAA	2	10	656840	656849	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018521	ATTTA	2	10	658426	658435	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018521	TTTAA	2	10	665755	665764	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018521	TAAAA	2	10	688827	688836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018521	AAAAT	2	10	688897	688906	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018521	TTTTA	2	10	688985	688994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018521	TTGTA	2	10	694166	694175	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018521	CTTTT	2	10	696195	696204	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_018521	CTTTT	2	10	696365	696374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_018521	GGTAA	2	10	696677	696686	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018521	TCGTG	2	10	697473	697482	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
114	NC_018521	TCTTT	2	10	698501	698510	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_018521	TAACT	2	10	698515	698524	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_018521	CCGTA	2	10	700360	700369	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
117	NC_018521	TTTAT	2	10	702379	702388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018521	TAAAT	2	10	702647	702656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018521	AATTA	2	10	702671	702680	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018521	TTTTA	2	10	702775	702784	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018521	GCAAA	2	10	703467	703476	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_018521	AATCA	2	10	703605	703614	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_018521	AAAGC	2	10	704121	704130	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_018521	ATTTT	2	10	705142	705151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018521	AATAA	2	10	711251	711260	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_018521	ATTTA	2	10	714025	714034	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018521	TTTTC	2	10	744385	744394	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_018521	TTTTA	2	10	810880	810889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018521	ATTCA	2	10	813514	813523	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_018521	AGGTT	2	10	815534	815543	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018521	AAAAT	2	10	823596	823605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018521	AAAAT	2	10	854483	854492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018521	ATTTT	2	10	860147	860156	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018521	AAAAT	2	10	892392	892401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018521	TTAAT	2	10	904370	904379	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018521	ATAAA	2	10	906961	906970	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018521	AATTA	2	10	928957	928966	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_018521	TAAAA	2	10	928999	929008	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018521	TAAAA	2	10	957596	957605	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018521	TTTAT	2	10	963421	963430	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018521	TTAAT	2	10	968520	968529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_018521	CAAAG	2	10	1001470	1001479	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_018521	CAATG	2	10	1001567	1001576	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
144	NC_018521	TATAT	2	10	1045618	1045627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018521	TTTTA	2	10	1051052	1051061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018521	AAATT	2	10	1091784	1091793	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018521	AGTTT	2	10	1109689	1109698	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_018521	ATTTT	2	10	1113881	1113890	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_018521	ATATT	2	10	1236776	1236785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_018521	ATTTT	2	10	1245438	1245447	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018521	TATAT	2	10	1245463	1245472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_018521	TTAAT	2	10	1252224	1252233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_018521	TAAAA	2	10	1269170	1269179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_018521	AGAAA	2	10	1341194	1341203	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_018521	TAAAA	2	10	1414896	1414905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_018521	ATAAA	2	10	1439053	1439062	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_018521	TTATT	2	10	1440807	1440816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_018521	TAAAA	2	10	1442997	1443006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_018521	GTGGA	2	10	1446890	1446899	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
186	NC_018521	TCTTT	2	10	1447632	1447641	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_018521	AAGTT	2	10	1490535	1490544	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_018521	ATTTT	2	10	1490686	1490695	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_018521	AAATT	2	10	1509838	1509847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_018521	TAAAA	2	10	1514570	1514579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_018521	TAAAA	2	10	1540633	1540642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_018521	TATTT	2	10	1540785	1540794	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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208	NC_018521	ATTTT	2	10	1626418	1626427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
209	NC_018521	AAAAT	2	10	1632022	1632031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
210	NC_018521	TAGTA	2	10	1633598	1633607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
211	NC_018521	TCAAA	2	10	1633780	1633789	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
212	NC_018521	ATATT	2	10	1634779	1634788	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_018521	AAAAT	2	10	1641396	1641405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.