MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 4331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018507	TGT	2	6	339169	339174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_018507	AATAG	2	10	339175	339184	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_018507	TAA	2	6	339206	339211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_018507	AAC	2	6	339215	339220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_018507	AAC	2	6	339230	339235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_018507	AAG	2	6	339247	339252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_018507	CAG	2	6	339288	339293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_018507	ATAA	2	8	339294	339301	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_018507	ATA	2	6	339305	339310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_018507	A	7	7	339343	339349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_018507	TTG	2	6	339397	339402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_018507	TA	3	6	340030	340035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_018507	CTATT	2	10	340635	340644	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4014	NC_018507	T	13	13	340649	340661	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_018507	TCT	2	6	340679	340684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_018507	GGT	2	6	340736	340741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_018507	T	6	6	340762	340767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_018507	T	7	7	340778	340784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_018507	T	9	9	340786	340794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_018507	GGT	2	6	340912	340917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_018507	GGC	2	6	340964	340969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_018507	A	6	6	341047	341052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_018507	TGA	2	6	341055	341060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_018507	ATTA	2	8	341066	341073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_018507	TAC	2	6	341128	341133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_018507	ATTA	2	8	341153	341160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_018507	TGAATT	2	12	341183	341194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_018507	AGCTA	2	10	341199	341208	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4029	NC_018507	ATA	2	6	341240	341245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_018507	GA	3	6	341266	341271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_018507	TTTA	2	8	341301	341308	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_018507	TTA	2	6	341352	341357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_018507	TCAAA	2	10	341364	341373	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4034	NC_018507	TA	3	6	341386	341391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_018507	T	7	7	341415	341421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_018507	TAAT	2	8	341448	341455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_018507	AGAAA	2	10	341467	341476	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_018507	TG	4	8	341478	341485	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_018507	TA	3	6	341487	341492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_018507	TA	3	6	341510	341515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_018507	AGAA	2	8	341518	341525	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_018507	A	6	6	341524	341529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_018507	TA	3	6	342473	342478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_018507	T	6	6	342485	342490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_018507	T	6	6	342495	342500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_018507	T	7	7	342503	342509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_018507	TTA	2	6	342554	342559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_018507	TGT	2	6	342576	342581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_018507	TG	3	6	342594	342599	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_018507	GTT	2	6	342603	342608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_018507	ATT	2	6	342695	342700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_018507	TAT	2	6	342715	342720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_018507	ATC	2	6	342750	342755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_018507	TTG	2	6	342772	342777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_018507	GT	3	6	342783	342788	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_018507	T	8	8	342798	342805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_018507	T	6	6	343479	343484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_018507	T	11	11	343495	343505	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_018507	TGT	2	6	343518	343523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_018507	TATT	2	8	343530	343537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_018507	TTGT	2	8	343538	343545	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_018507	T	6	6	343551	343556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_018507	TAAT	2	8	343571	343578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_018507	T	7	7	343621	343627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_018507	T	6	6	343629	343634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_018507	TGTT	2	8	343721	343728	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_018507	GTT	2	6	343765	343770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_018507	TTG	2	6	343810	343815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_018507	GTTTA	2	10	343887	343896	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4070	NC_018507	T	6	6	343989	343994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_018507	GTT	2	6	344049	344054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_018507	TGT	2	6	344059	344064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_018507	TTG	2	6	344065	344070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_018507	GTT	2	6	344102	344107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_018507	TAT	2	6	344126	344131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_018507	T	6	6	344156	344161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_018507	T	7	7	344163	344169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_018507	T	7	7	344171	344177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_018507	TGT	2	6	344196	344201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_018507	TAA	2	6	344209	344214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_018507	TTTA	2	8	344223	344230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_018507	GGTT	2	8	344308	344315	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_018507	TAG	2	6	344437	344442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_018507	TAG	2	6	344444	344449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_018507	TAG	2	6	344451	344456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_018507	TAG	2	6	344458	344463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_018507	AGG	2	6	344498	344503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_018507	T	6	6	344504	344509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_018507	ATT	2	6	344516	344521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4090	NC_018507	GTT	2	6	344558	344563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_018507	GTT	2	6	344577	344582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_018507	GTT	2	6	344586	344591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_018507	GTT	2	6	344593	344598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_018507	TGT	2	6	344651	344656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_018507	TTTA	2	8	344667	344674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_018507	TTGT	2	8	344694	344701	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_018507	ATT	2	6	344707	344712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_018507	TTA	2	6	344794	344799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_018507	GTT	2	6	344803	344808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_018507	TGTT	2	8	344811	344818	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_018507	T	6	6	344829	344834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_018507	ATTA	2	8	344835	344842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_018507	GAT	2	6	344864	344869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_018507	GTT	2	6	344871	344876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_018507	TCTTGT	2	12	344889	344900	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4106	NC_018507	TTG	4	12	344938	344949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_018507	TTA	2	6	344967	344972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_018507	GT	3	6	344981	344986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_018507	ATT	2	6	344997	345002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_018507	TTTG	2	8	345035	345042	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_018507	TTA	2	6	345043	345048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_018507	TAG	2	6	345091	345096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_018507	GTGTA	2	10	345119	345128	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_018507	GT	3	6	345139	345144	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_018507	TA	4	8	345227	345234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_018507	TAAAA	2	10	345240	345249	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_018507	TGTA	2	8	345259	345266	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_018507	TA	3	6	345265	345270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_018507	A	6	6	345293	345298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_018507	AT	3	6	345306	345311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_018507	TGT	2	6	345351	345356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_018507	TAG	2	6	345376	345381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_018507	ATGAA	2	10	345382	345391	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_018507	GT	3	6	345413	345418	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_018507	AGTA	2	8	345440	345447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_018507	A	6	6	345482	345487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_018507	AAT	2	6	345516	345521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_018507	TTG	2	6	345524	345529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_018507	TTA	2	6	345552	345557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4130	NC_018507	TGAT	2	8	345575	345582	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_018507	ATT	2	6	345583	345588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_018507	TTG	2	6	345589	345594	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_018507	TG	3	6	345593	345598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_018507	A	8	8	345622	345629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4135	NC_018507	TAA	2	6	345659	345664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_018507	TAAAA	2	10	345679	345688	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4137	NC_018507	TA	3	6	345700	345705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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