MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Candidatus Portiera aleyrodidarum BT-B chromosome

Total Repeats: 4331

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018507	ATAA	2	8	40629	40636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_018507	A	9	9	40642	40650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_018507	A	8	8	40672	40679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_018507	A	6	6	40681	40686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_018507	CAT	2	6	40763	40768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
506	NC_018507	AAAACA	2	12	40769	40780	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
507	NC_018507	AGAA	2	8	40784	40791	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
508	NC_018507	A	9	9	40790	40798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_018507	ATA	2	6	40804	40809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_018507	ACAAA	2	10	40827	40836	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
511	NC_018507	CA	3	6	40873	40878	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
512	NC_018507	TAAA	2	8	40898	40905	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_018507	CATAA	2	10	40910	40919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_018507	ATAA	3	12	40924	40935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_018507	AT	3	6	40950	40955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_018507	GTTAAG	3	18	42090	42107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_018507	GAT	2	6	43106	43111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_018507	ATA	2	6	46965	46970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_018507	TAA	2	6	46971	46976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_018507	A	6	6	47054	47059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_018507	A	8	8	47070	47077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_018507	A	7	7	47079	47085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_018507	TAA	2	6	47091	47096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_018507	A	6	6	47095	47100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_018507	AG	3	6	47113	47118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_018507	AT	3	6	47575	47580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_018507	A	6	6	47583	47588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_018507	A	6	6	47611	47616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_018507	ACT	2	6	48647	48652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_018507	AAC	2	6	48677	48682	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_018507	ACT	2	6	48709	48714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_018507	TTA	3	9	48715	48723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_018507	ACA	3	9	48727	48735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_018507	ATA	2	6	48753	48758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_018507	A	6	6	48763	48768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_018507	TAA	3	9	48783	48791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_018507	AAC	4	12	48821	48832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_018507	ATC	2	6	48856	48861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_018507	AAC	2	6	48879	48884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_018507	ACCTC	2	10	48887	48896	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
541	NC_018507	ACA	2	6	48920	48925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_018507	ACCTC	2	10	48927	48936	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
543	NC_018507	TAAC	2	8	48961	48968	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_018507	A	8	8	48973	48980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_018507	CTT	2	6	49003	49008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_018507	ACA	2	6	49024	49029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_018507	A	6	6	49029	49034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_018507	TAA	2	6	49035	49040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_018507	A	6	6	49050	49055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_018507	AAC	2	6	49075	49080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_018507	ATA	2	6	49083	49088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_018507	TA	3	6	49087	49092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_018507	A	6	6	49092	49097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_018507	CAA	2	6	49116	49121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_018507	CAA	2	6	49123	49128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_018507	CTAC	2	8	49147	49154	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_018507	CTA	2	6	49158	49163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_018507	CTAAC	2	10	49174	49183	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
559	NC_018507	TAA	2	6	49203	49208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_018507	TAA	2	6	49242	49247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_018507	ATTTT	2	10	49275	49284	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_018507	TAAA	2	8	49316	49323	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_018507	ACA	2	6	49334	49339	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_018507	A	6	6	49359	49364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_018507	AAC	2	6	49385	49390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_018507	AAC	2	6	49424	49429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
567	NC_018507	AAAAAG	2	12	49432	49443	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_018507	TAT	2	6	49456	49461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_018507	TAAC	2	8	49469	49476	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
570	NC_018507	A	9	9	49485	49493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_018507	ATAA	3	12	49495	49506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_018507	ACA	2	6	49507	49512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_018507	TAA	2	6	49517	49522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_018507	AAC	2	6	49528	49533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_018507	ATT	2	6	49550	49555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_018507	TAA	2	6	49616	49621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_018507	TAAT	2	8	49646	49653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_018507	ACA	2	6	49657	49662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_018507	A	7	7	49670	49676	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_018507	GAA	2	6	49677	49682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
581	NC_018507	A	6	6	49708	49713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_018507	AAC	2	6	49715	49720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_018507	A	9	9	49732	49740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_018507	A	6	6	49767	49772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_018507	GTA	2	6	49780	49785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_018507	AAC	2	6	49822	49827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_018507	AAC	2	6	49857	49862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_018507	A	6	6	49878	49883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_018507	CAAA	2	8	49905	49912	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_018507	A	7	7	49928	49934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_018507	A	8	8	49964	49971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_018507	ACA	2	6	50003	50008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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594	NC_018507	A	6	6	50087	50092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_018507	GTA	2	6	50093	50098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_018507	A	11	11	50118	50128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_018507	A	9	9	50131	50139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_018507	AAT	2	6	50143	50148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_018507	ATT	2	6	51921	51926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_018507	TTA	2	6	54526	54531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_018507	ATA	2	6	54535	54540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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603	NC_018507	T	6	6	56456	56461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_018507	TAC	3	9	56473	56481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_018507	TAA	2	6	56522	56527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_018507	ACT	2	6	56532	56537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_018507	AAC	2	6	56559	56564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_018507	TAA	2	6	56590	56595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_018507	ATTA	2	8	56642	56649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_018507	TAA	2	6	56721	56726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_018507	ACAA	2	8	56757	56764	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_018507	A	6	6	56812	56817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_018507	AAAAC	2	10	56819	56828	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
614	NC_018507	AACA	3	12	56844	56855	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_018507	AAC	2	6	56889	56894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_018507	TAAC	2	8	56903	56910	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
617	NC_018507	A	8	8	56919	56926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_018507	TA	3	6	56956	56961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_018507	CTA	2	6	56962	56967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_018507	AAC	2	6	56974	56979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
621	NC_018507	ACA	2	6	56980	56985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_018507	A	8	8	56994	57001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_018507	A	6	6	57003	57008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_018507	TAT	2	6	57081	57086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_018507	TTGTT	2	10	59966	59975	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
626	NC_018507	ATA	2	6	60045	60050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_018507	A	7	7	60066	60072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_018507	TAA	3	9	60076	60084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_018507	T	7	7	60090	60096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_018507	AC	4	8	60098	60105	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_018507	AAT	2	6	60107	60112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_018507	TTAAT	2	10	60136	60145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_018507	CTTTC	2	10	60147	60156	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
634	NC_018507	TACA	2	8	60201	60208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
635	NC_018507	TTTTC	2	10	60215	60224	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
636	NC_018507	TAA	2	6	60261	60266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_018507	AAC	2	6	60273	60278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_018507	CTA	2	6	60286	60291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
639	NC_018507	TAC	2	6	60293	60298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_018507	TAA	2	6	60303	60308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
641	NC_018507	TTTTC	2	10	60322	60331	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
642	NC_018507	T	7	7	60336	60342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
643	NC_018507	ACA	2	6	60357	60362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_018507	ATAC	2	8	60376	60383	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
645	NC_018507	ACATA	2	10	60398	60407	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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