MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii PC isolate NHV chromosome

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018418	ATTT	2	8	9011	9018	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018418	TTAC	2	8	24706	24713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_018418	AATT	2	8	30482	30489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018418	AAAT	2	8	30496	30503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018418	ATTA	2	8	30511	30518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018418	TTAA	2	8	37580	37587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018418	ATAA	2	8	37704	37711	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018418	ATGA	2	8	37906	37913	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018418	ATTT	2	8	38436	38443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018418	ATTT	2	8	38469	38476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018418	ATAA	2	8	41906	41913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018418	TGTA	2	8	42675	42682	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018418	ATTT	2	8	42754	42761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018418	ATTT	2	8	48298	48305	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018418	CCGT	2	8	48593	48600	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_018418	TAAA	2	8	53382	53389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018418	GTAG	2	8	53526	53533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018418	AATT	2	8	69878	69885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018418	TTAA	2	8	69901	69908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018418	AAAT	2	8	73454	73461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018418	ATTT	2	8	80913	80920	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018418	AATA	2	8	83913	83920	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018418	AAAT	2	8	83960	83967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018418	AATA	2	8	84242	84249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018418	ATTT	2	8	106056	106063	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018418	AGAT	2	8	106188	106195	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018418	ATTA	2	8	107691	107698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018418	CTTT	2	8	107721	107728	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_018418	TATT	2	8	108132	108139	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018418	CCTA	2	8	108175	108182	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_018418	ATAA	2	8	108200	108207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018418	AAAT	2	8	108632	108639	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018418	CATC	2	8	108729	108736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018418	CCTT	2	8	110034	110041	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_018418	TAAA	2	8	111656	111663	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018418	ATTT	2	8	158877	158884	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.