MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Carsonella ruddii CS isolate Thao2000 chromosome

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018415	A	7	7	8152	8158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018415	T	9	9	8229	8237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018415	A	9	9	10565	10573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018415	T	6	6	13064	13069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018415	T	6	6	13074	13079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018415	A	8	8	13107	13114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018415	T	6	6	13127	13132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018415	A	8	8	13141	13148	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018415	A	9	9	13174	13182	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018415	A	9	9	13188	13196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018415	T	10	10	29054	29063	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018415	A	6	6	35600	35605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018415	T	13	13	39014	39026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018415	A	21	21	39062	39082	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018415	A	8	8	39089	39096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018415	T	7	7	46322	46328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018415	A	6	6	46340	46345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018415	T	14	14	46409	46422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018415	A	6	6	46425	46430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018415	A	9	9	51964	51972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018415	T	9	9	51975	51983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018415	T	8	8	52007	52014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018415	A	7	7	52255	52261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018415	A	8	8	52301	52308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018415	T	9	9	52365	52373	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018415	T	11	11	52380	52390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018415	A	8	8	52404	52411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018415	T	6	6	52412	52417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018415	T	6	6	52431	52436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018415	A	7	7	56835	56841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018415	A	7	7	60696	60702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018415	T	8	8	60800	60807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018415	T	6	6	60849	60854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018415	T	10	10	60861	60870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018415	A	11	11	61694	61704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018415	T	9	9	63533	63541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018415	T	10	10	64491	64500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018415	T	7	7	64506	64512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018415	A	7	7	64516	64522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018415	A	6	6	64584	64589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018415	A	7	7	68541	68547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018415	T	7	7	70503	70509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018415	T	7	7	70511	70517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018415	T	9	9	70536	70544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018415	T	12	12	70548	70559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018415	A	10	10	70562	70571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018415	T	6	6	70612	70617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018415	A	7	7	70647	70653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018415	T	6	6	70669	70674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018415	A	7	7	70698	70704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018415	A	6	6	70719	70724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018415	A	7	7	70840	70846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018415	A	7	7	72825	72831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018415	A	6	6	72893	72898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018415	A	9	9	72974	72982	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018415	T	6	6	73012	73017	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018415	A	9	9	87694	87702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018415	T	9	9	88216	88224	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018415	A	6	6	88278	88283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018415	A	8	8	88338	88345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018415	A	6	6	88396	88401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018415	T	8	8	88409	88416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018415	T	28	28	88488	88515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018415	A	9	9	88532	88540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_018415	T	9	9	88543	88551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018415	A	13	13	88555	88567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018415	T	10	10	88571	88580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018415	T	8	8	88583	88590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018415	T	10	10	88604	88613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018415	T	7	7	88626	88632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018415	T	6	6	88647	88652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018415	T	8	8	88667	88674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018415	A	9	9	93735	93743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018415	T	10	10	93744	93753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018415	T	7	7	98746	98752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018415	A	7	7	98759	98765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018415	A	8	8	98777	98784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018415	T	9	9	98785	98793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018415	T	18	18	98807	98824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018415	A	8	8	101326	101333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018415	A	7	7	102291	102297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018415	T	9	9	102382	102390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018415	T	9	9	102393	102401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018415	T	7	7	103830	103836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_018415	A	8	8	109337	109344	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018415	A	8	8	109355	109362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018415	T	7	7	109366	109372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018415	T	8	8	110170	110177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_018415	T	6	6	110835	110840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018415	T	8	8	110843	110850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018415	A	7	7	110932	110938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018415	A	7	7	110973	110979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018415	T	7	7	110986	110992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018415	T	6	6	111237	111242	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018415	T	10	10	111987	111996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_018415	A	8	8	112001	112008	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018415	A	7	7	112051	112057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018415	T	7	7	112061	112067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018415	T	8	8	112161	112168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018415	A	7	7	112171	112177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018415	T	8	8	112321	112328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_018415	A	7	7	112329	112335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018415	A	7	7	112604	112610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018415	T	6	6	112709	112714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_018415	T	7	7	112719	112725	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018415	T	6	6	113032	113037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018415	A	6	6	113415	113420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018415	T	7	7	113426	113432	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018415	A	10	10	113872	113881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018415	T	7	7	113891	113897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018415	T	7	7	113908	113914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018415	T	9	9	119311	119319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018415	A	9	9	119347	119355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018415	A	6	6	149577	149582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018415	A	6	6	149586	149591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018415	T	8	8	149746	149753	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018415	T	9	9	149758	149766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018415	A	8	8	149767	149774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018415	T	8	8	149781	149788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018415	T	14	14	161469	161482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018415	A	6	6	161483	161488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_018415	A	7	7	161490	161496	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.