MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue chromosome

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018219	AGAAAG	2	12	45980	45991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018219	TTTAAT	2	12	73227	73238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018219	TTTTAA	2	12	89327	89338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018219	ATCAAT	2	12	90017	90028	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_018219	AAGCAT	2	12	116136	116147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_018219	ATAGCT	2	12	129775	129786	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_018219	CCAATA	2	12	133184	133195	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018219	TCTACA	2	12	133354	133365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_018219	GTTCTT	2	12	199200	199211	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_018219	AAGAGT	2	12	253193	253204	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018219	TTTTAA	2	12	277323	277334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018219	TTTTAA	2	12	296716	296727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018219	TACAGG	2	12	296848	296859	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_018219	GACAGT	2	12	305224	305235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_018219	TTTTAA	2	12	308317	308328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018219	AAAGAG	2	12	324540	324551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018219	TTCGGC	2	12	329701	329712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018219	GTTTAA	2	12	345809	345820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018219	CTAAAG	2	12	363902	363913	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_018219	TTCTTT	2	12	368877	368888	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_018219	TCACTG	2	12	376010	376021	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_018219	ATTGAG	2	12	376209	376220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018219	AAAGTC	2	12	381305	381316	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_018219	TATTGA	2	12	393275	393286	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018219	GAGAAT	2	12	415891	415902	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018219	GATTGA	2	12	420560	420571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018219	GAAAGA	2	12	426195	426206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018219	TATCTA	2	12	427881	427892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_018219	AGATCT	2	12	435215	435226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_018219	CTGCTT	2	12	442730	442741	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018219	TCCTCT	2	12	456428	456439	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018219	CAGAGA	2	12	459732	459743	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_018219	ACACCA	2	12	465815	465826	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_018219	GTTTTT	2	12	505510	505521	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018219	GCGCTT	2	12	528124	528135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018219	ATCTTA	2	12	556863	556874	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_018219	CAACAG	2	12	602457	602468	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_018219	ATGATC	2	12	604175	604186	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_018219	ACACTC	2	12	619808	619819	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018219	AAGACC	2	12	619960	619971	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018219	ACCTAA	2	12	632239	632250	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018219	AAGCGA	2	12	654883	654894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_018219	CAGAGA	2	12	659787	659798	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_018219	TTTTAA	2	12	661913	661924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018219	TTTTAA	2	12	662892	662903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018219	TTTTAA	2	12	667869	667880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018219	TATCTT	2	12	678113	678124	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_018219	TCTCCT	2	12	678261	678272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018219	AATATC	2	12	709370	709381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_018219	TAGACG	2	12	727024	727035	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_018219	TCTTTT	2	12	731711	731722	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.