MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Mycoplasma haemolamae str. Purdue chromosome

Total Repeats: 449

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018219	TTAA	2	8	19	26	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018219	AGAA	2	8	122	129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018219	TTCC	2	8	181	188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_018219	TAAT	2	8	1328	1335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018219	AATT	2	8	1384	1391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018219	ATTA	2	8	7688	7695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018219	AATT	2	8	12560	12567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018219	GAAG	2	8	16212	16219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018219	GCCC	3	12	19131	19142	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_018219	AAGA	2	8	19158	19165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018219	CATG	3	12	19498	19509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_018219	TTAT	2	8	22550	22557	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018219	ATCT	2	8	27638	27645	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018219	AAAT	2	8	27794	27801	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018219	CTCC	2	8	28677	28684	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_018219	GACG	2	8	29419	29426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018219	GTAA	2	8	32011	32018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018219	ATAG	2	8	32161	32168	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018219	TCCC	2	8	32317	32324	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_018219	CTAT	2	8	34521	34528	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_018219	CTCG	2	8	38656	38663	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_018219	AGCG	2	8	38686	38693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_018219	TTCT	2	8	44993	45000	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018219	AGTC	2	8	45119	45126	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_018219	AGTC	2	8	45139	45146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_018219	GATA	2	8	46024	46031	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018219	AGTT	2	8	58809	58816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018219	AATT	2	8	65043	65050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018219	AGGG	2	8	67373	67380	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018219	AGTT	2	8	68912	68919	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018219	TAAT	2	8	73098	73105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018219	GGGC	2	8	73129	73136	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
33	NC_018219	GCTT	2	8	73793	73800	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_018219	TTAG	2	8	74196	74203	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018219	AAAG	2	8	74265	74272	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018219	AGAT	2	8	75581	75588	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_018219	AAAC	2	8	76954	76961	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_018219	AAGA	2	8	77058	77065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018219	AAAT	2	8	78048	78055	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018219	TTTA	2	8	78086	78093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_018219	TGAC	2	8	79886	79893	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_018219	GATT	2	8	81096	81103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018219	TAAA	2	8	81906	81913	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018219	AAAT	2	8	81914	81921	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018219	GATT	2	8	81956	81963	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018219	GTTA	2	8	82916	82923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018219	TAGA	2	8	82952	82959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018219	AATT	2	8	83119	83126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018219	CTAA	2	8	83144	83151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018219	TTTA	2	8	83163	83170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018219	ATTT	2	8	84562	84569	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018219	TTAG	2	8	84719	84726	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018219	GGGA	2	8	85318	85325	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018219	GTTA	2	8	85607	85614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018219	TTCT	2	8	85731	85738	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_018219	ACAA	2	8	86739	86746	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_018219	AAAC	2	8	86768	86775	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_018219	AATT	2	8	88183	88190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018219	AAAC	2	8	88221	88228	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018219	AAGA	2	8	88325	88332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018219	AAGA	2	8	89370	89377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018219	CTAA	2	8	89811	89818	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_018219	TTAA	2	8	92735	92742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018219	GGGC	2	8	92983	92990	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
65	NC_018219	GAAG	2	8	101634	101641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018219	AGGG	2	8	102046	102053	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018219	TAGG	2	8	104977	104984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018219	AGAA	2	8	105064	105071	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018219	AGAA	2	8	114824	114831	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018219	CTTC	2	8	115145	115152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_018219	TCTT	2	8	116049	116056	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_018219	TATT	2	8	116987	116994	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018219	AGGT	2	8	122378	122385	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018219	TCAG	2	8	129531	129538	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018219	AAAT	2	8	133169	133176	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018219	TTCT	2	8	133285	133292	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018219	TAAA	2	8	143792	143799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018219	AAGA	2	8	147799	147806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018219	GGAA	2	8	148624	148631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_018219	ATAG	2	8	151813	151820	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018219	TTAG	2	8	156417	156424	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018219	TTGA	2	8	156897	156904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018219	CTAA	2	8	159915	159922	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018219	ATCA	3	12	160325	160336	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018219	GTTT	2	8	164204	164211	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018219	ATAG	2	8	164254	164261	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018219	TGAA	2	8	164353	164360	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018219	GATC	2	8	164887	164894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_018219	ATTA	2	8	165485	165492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018219	TTAA	2	8	165652	165659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018219	ATTT	2	8	165720	165727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018219	TTAA	3	12	175206	175217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018219	TAAG	2	8	176421	176428	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018219	ATAA	2	8	185616	185623	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018219	CTGA	2	8	199127	199134	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018219	ATCT	2	8	199215	199222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_018219	TAAC	2	8	205285	205292	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018219	AAAG	2	8	206991	206998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_018219	TTAA	2	8	206999	207006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018219	TTCA	2	8	207095	207102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_018219	AGCT	2	8	207560	207567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_018219	AATG	2	8	215675	215682	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018219	TAAT	2	8	219098	219105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018219	CTTG	2	8	219180	219187	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018219	CTTA	2	8	219278	219285	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_018219	ACTC	2	8	219443	219450	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_018219	TTGT	2	8	219536	219543	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018219	AGAA	2	8	219738	219745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_018219	GAAA	2	8	220185	220192	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018219	GGAC	2	8	220296	220303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_018219	ATTG	2	8	223775	223782	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_018219	CCTG	2	8	224307	224314	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_018219	AGAT	2	8	228440	228447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018219	TTTA	2	8	236463	236470	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018219	ATTC	2	8	237672	237679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_018219	ATCA	2	8	243931	243938	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_018219	CAAA	3	12	244856	244867	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018219	AGAA	2	8	244868	244875	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_018219	TTAT	2	8	249860	249867	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_018219	TAGT	2	8	249871	249878	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_018219	TCTG	2	8	252408	252415	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018219	GCAA	2	8	252425	252432	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018219	TCTG	2	8	252501	252508	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_018219	GTTA	2	8	252541	252548	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018219	AAGC	2	8	253230	253237	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018219	AACT	2	8	254781	254788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_018219	ATTG	2	8	265801	265808	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_018219	GACT	2	8	270627	270634	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_018219	AAGA	2	8	273107	273114	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018219	ACTA	2	8	275559	275566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_018219	TGAC	2	8	275684	275691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018219	AATT	2	8	276025	276032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_018219	TTAG	2	8	277229	277236	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_018219	TAGA	2	8	277304	277311	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_018219	TACA	2	8	277404	277411	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_018219	AATA	2	8	280165	280172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018219	ACTA	2	8	282935	282942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018219	ATAA	2	8	283644	283651	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_018219	AAGA	2	8	284136	284143	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018219	GTTT	2	8	284547	284554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018219	CTAA	2	8	290892	290899	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018219	GTCA	2	8	290936	290943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_018219	CTTT	2	8	293343	293350	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018219	TGAA	2	8	295732	295739	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018219	AGTT	2	8	296148	296155	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018219	AGGG	2	8	296995	297002	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_018219	ACCA	2	8	297115	297122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018219	TAAC	2	8	297226	297233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018219	TTTA	2	8	299016	299023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_018219	ATTT	2	8	299594	299601	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018219	AACT	2	8	299651	299658	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_018219	TATT	2	8	300662	300669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018219	TTCA	2	8	300676	300683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.