MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 970

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018019	GAAA	2	8	20224	20231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018019	AGCA	2	8	21762	21769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_018019	AAAG	2	8	21772	21779	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018019	CGAT	2	8	21933	21940	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_018019	TCAT	2	8	24373	24380	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_018019	TGAT	2	8	24391	24398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018019	GAAG	2	8	28524	28531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018019	GCTA	2	8	29685	29692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_018019	TACT	2	8	39591	39598	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_018019	AAGA	2	8	39673	39680	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018019	TGCG	2	8	40123	40130	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_018019	GCTG	2	8	42005	42012	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_018019	AATG	2	8	42865	42872	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018019	AAAT	2	8	44509	44516	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_018019	TTGC	2	8	46238	46245	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_018019	ATAC	2	8	47215	47222	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_018019	TGCG	2	8	47327	47334	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_018019	GCAT	2	8	48796	48803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_018019	TTGG	2	8	56219	56226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018019	AGGG	2	8	57645	57652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018019	GCAC	2	8	58752	58759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_018019	CTTT	2	8	60514	60521	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_018019	GTGG	2	8	64449	64456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018019	GATT	2	8	64466	64473	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018019	GCTG	2	8	67606	67613	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_018019	CTTG	2	8	67931	67938	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_018019	TCCA	2	8	68074	68081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_018019	AGTG	2	8	68293	68300	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018019	ATGA	2	8	70909	70916	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018019	TGCC	2	8	73822	73829	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_018019	GGAA	2	8	73855	73862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018019	TAAT	2	8	75603	75610	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018019	ATCT	2	8	76301	76308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_018019	ATCC	2	8	77284	77291	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_018019	GACC	2	8	77340	77347	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_018019	GGGA	2	8	77675	77682	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018019	AAAG	2	8	77894	77901	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018019	TCCT	2	8	77978	77985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_018019	GCGG	2	8	80063	80070	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018019	TGGG	2	8	84698	84705	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018019	CTTT	2	8	84782	84789	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_018019	TCTT	2	8	103737	103744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_018019	GAGG	2	8	112655	112662	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018019	TACC	2	8	116293	116300	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_018019	GAAT	2	8	116320	116327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018019	GGCA	2	8	116330	116337	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_018019	TCCT	2	8	120267	120274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_018019	TCTT	2	8	120471	120478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_018019	TGCG	2	8	121165	121172	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_018019	CCCA	2	8	121993	122000	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_018019	TTGG	2	8	123425	123432	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018019	GCCG	2	8	123861	123868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_018019	GGCA	2	8	123870	123877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_018019	ATTT	2	8	126453	126460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018019	TGTT	2	8	128800	128807	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018019	TGGA	2	8	131412	131419	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018019	CGCC	2	8	137843	137850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_018019	TTCG	2	8	137903	137910	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_018019	TGCG	2	8	139914	139921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_018019	CAAA	2	8	148929	148936	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_018019	TTCC	2	8	154610	154617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_018019	ATGC	2	8	156105	156112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_018019	CGGC	2	8	161962	161969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_018019	TTTG	2	8	163126	163133	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_018019	TGTT	2	8	168110	168117	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_018019	TCCC	2	8	168380	168387	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_018019	CTGA	2	8	168806	168813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_018019	GCTA	2	8	169025	169032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_018019	GCTG	2	8	169798	169805	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_018019	GAGG	2	8	169938	169945	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018019	GGGA	2	8	170200	170207	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018019	AAAT	2	8	170230	170237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018019	GGAC	2	8	170491	170498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_018019	TGAA	2	8	170506	170513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018019	AGTC	2	8	171314	171321	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_018019	ACTT	2	8	171378	171385	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_018019	GTTT	2	8	171747	171754	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018019	CTGG	2	8	172779	172786	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_018019	CCAA	2	8	172962	172969	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_018019	TCTG	2	8	173030	173037	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_018019	ATAG	2	8	173947	173954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018019	CTGG	2	8	174589	174596	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_018019	AGCC	2	8	180283	180290	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_018019	ATCC	2	8	182325	182332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_018019	CAGT	2	8	190903	190910	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_018019	ATGG	2	8	192489	192496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018019	TCAC	2	8	198517	198524	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_018019	CGAA	2	8	201894	201901	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_018019	GTTC	2	8	205940	205947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_018019	ACGT	2	8	205994	206001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_018019	TAGA	2	8	214386	214393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018019	GTCT	2	8	216568	216575	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_018019	GACG	2	8	218226	218233	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_018019	TGCT	2	8	218475	218482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018019	TCCC	2	8	219009	219016	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
97	NC_018019	TTCA	2	8	227350	227357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_018019	TCCT	2	8	229356	229363	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_018019	GATA	2	8	229471	229478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018019	GTAG	2	8	229485	229492	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018019	CCTA	2	8	229514	229521	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_018019	AGCC	2	8	232432	232439	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_018019	TTTA	2	8	234714	234721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018019	ACGT	2	8	240365	240372	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_018019	CGCC	2	8	242558	242565	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_018019	AGTT	2	8	243721	243728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_018019	TAAA	2	8	243855	243862	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_018019	TGCT	2	8	244311	244318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_018019	GTGG	2	8	244344	244351	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_018019	GGGA	2	8	244390	244397	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_018019	ACTC	2	8	251460	251467	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_018019	ATGA	2	8	251932	251939	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_018019	ATTA	2	8	251995	252002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018019	GAAT	2	8	256621	256628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_018019	TATT	2	8	259173	259180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_018019	AAAT	2	8	271769	271776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_018019	CGTG	2	8	271828	271835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_018019	GCGG	2	8	272295	272302	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
119	NC_018019	GTAC	2	8	272361	272368	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_018019	TCCC	2	8	278096	278103	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_018019	ATCA	2	8	284343	284350	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_018019	GCTT	2	8	284386	284393	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_018019	CTCG	2	8	285480	285487	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_018019	AAGG	2	8	285526	285533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018019	CTGA	2	8	296445	296452	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_018019	ATTG	2	8	297733	297740	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_018019	GCTG	2	8	301649	301656	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_018019	AGGT	2	8	301697	301704	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018019	ATAA	2	8	301711	301718	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_018019	TGGA	2	8	301897	301904	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018019	ATCG	2	8	303256	303263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_018019	TGCC	2	8	304481	304488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_018019	CCTT	2	8	310818	310825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_018019	GCTT	2	8	313021	313028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_018019	TTAT	2	8	318820	318827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018019	AGGA	2	8	320240	320247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_018019	AGCG	2	8	324194	324201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_018019	TGCC	2	8	324278	324285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_018019	GTAT	2	8	330025	330032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_018019	AGTA	2	8	339956	339963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_018019	CAGT	2	8	344610	344617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_018019	GAAT	2	8	346727	346734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_018019	GCTT	2	8	347260	347267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_018019	TGGT	2	8	347337	347344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_018019	AGTG	2	8	348609	348616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_018019	TCCT	2	8	350840	350847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_018019	GCCG	2	8	350921	350928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_018019	AGCA	2	8	355791	355798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_018019	GCGG	2	8	366925	366932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_018019	ATTA	2	8	367717	367724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_018019	GTAG	2	8	368251	368258	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_018019	AGAA	2	8	369882	369889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_018019	ATTA	2	8	370018	370025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_018019	AAGA	2	8	373234	373241	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_018019	ATCT	2	8	374683	374690	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_018019	CAAA	2	8	375149	375156	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
157	NC_018019	GACT	2	8	375663	375670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_018019	CCAT	2	8	375973	375980	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_018019	AGCG	2	8	377657	377664	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
160	NC_018019	CGGA	2	8	388741	388748	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
161	NC_018019	GGCT	2	8	389535	389542	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_018019	TCGC	2	8	389683	389690	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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165	NC_018019	TTTA	2	8	390186	390193	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_018019	TGAA	2	8	392557	392564	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_018019	GCTG	2	8	393191	393198	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
169	NC_018019	CATC	2	8	393476	393483	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
170	NC_018019	GATT	2	8	394361	394368	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_018019	CTTA	2	8	439579	439586	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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192	NC_018019	TGCT	2	8	452346	452353	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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194	NC_018019	ATAG	2	8	453104	453111	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
195	NC_018019	TTTA	2	8	453134	453141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_018019	TTAT	2	8	1295215	1295222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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