MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 4872

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018019	AGT	2	6	1906	1911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018019	TTA	2	6	2197	2202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018019	AAC	2	6	2252	2257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_018019	TGC	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018019	GAG	2	6	2381	2386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018019	CTG	2	6	3595	3600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018019	TAA	2	6	5545	5550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018019	TAG	3	9	7674	7682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018019	ATG	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018019	GTT	2	6	8209	8214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018019	ACG	2	6	8241	8246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018019	TTC	2	6	8266	8271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_018019	ATT	2	6	8304	8309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018019	GCT	2	6	8827	8832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_018019	TGC	2	6	12022	12027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_018019	GTT	2	6	12092	12097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018019	AAC	2	6	12252	12257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_018019	AGG	2	6	12298	12303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018019	TGT	2	6	12367	12372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018019	GAA	2	6	13211	13216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018019	CCG	2	6	13221	13226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_018019	GTT	2	6	13237	13242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018019	GGT	2	6	13358	13363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018019	GAC	2	6	13459	13464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_018019	CAA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_018019	CAT	2	6	13497	13502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018019	AGG	2	6	14325	14330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_018019	GAA	2	6	20099	20104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018019	CGA	2	6	20407	20412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018019	GAA	2	6	20908	20913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_018019	AGT	2	6	20925	20930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018019	GAG	2	6	21098	21103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_018019	GAT	2	6	21214	21219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018019	CGG	2	6	21255	21260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_018019	GCC	2	6	21740	21745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_018019	GCT	2	6	21842	21847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018019	GAA	2	6	21850	21855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018019	GCT	2	6	21866	21871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_018019	ATT	2	6	21921	21926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018019	ACC	2	6	21998	22003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_018019	TGC	2	6	22093	22098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_018019	AAC	2	6	22137	22142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018019	GAA	2	6	22184	22189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018019	GGC	2	6	22247	22252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_018019	GAA	2	6	22271	22276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018019	CGA	2	6	22411	22416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_018019	GTT	2	6	22418	22423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018019	TAT	2	6	23188	23193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018019	AGC	2	6	24266	24271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_018019	TTG	2	6	24633	24638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018019	GCG	2	6	28489	28494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_018019	TAT	2	6	29730	29735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018019	GAG	2	6	38525	38530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018019	CCT	2	6	39565	39570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_018019	GCA	2	6	39627	39632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_018019	TAG	2	6	39667	39672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018019	ATT	2	6	39886	39891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018019	CAC	2	6	39896	39901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_018019	CCT	2	6	41912	41917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_018019	TTC	2	6	41918	41923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_018019	ATA	2	6	41943	41948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018019	ACG	2	6	42038	42043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_018019	TGA	2	6	42074	42079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018019	GCC	2	6	42621	42626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_018019	TCT	2	6	42712	42717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018019	CCG	2	6	42800	42805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_018019	TGG	2	6	42835	42840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_018019	CCT	2	6	44452	44457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_018019	ATT	2	6	44496	44501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018019	TGT	2	6	44560	44565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018019	AGC	2	6	46266	46271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_018019	TTG	2	6	46282	46287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018019	GTT	2	6	46304	46309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018019	TTG	2	6	46392	46397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018019	ACT	2	6	46771	46776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_018019	TGG	2	6	46839	46844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_018019	TAT	2	6	46853	46858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018019	AAG	2	6	46916	46921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018019	ACA	2	6	47014	47019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018019	TGA	2	6	47045	47050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018019	TTA	2	6	47089	47094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018019	TTG	2	6	47105	47110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_018019	AAG	2	6	47223	47228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018019	GGC	2	6	47268	47273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_018019	AGA	2	6	47414	47419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_018019	ATG	2	6	47449	47454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018019	AGC	2	6	47503	47508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_018019	TGC	2	6	47525	47530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018019	AAG	2	6	47685	47690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018019	AGG	2	6	47740	47745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018019	TTC	2	6	47781	47786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_018019	GAA	2	6	47871	47876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018019	GAG	2	6	47961	47966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_018019	TTC	2	6	48433	48438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_018019	TCA	2	6	48448	48453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_018019	AGG	2	6	48457	48462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018019	GTG	2	6	48634	48639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018019	CAT	2	6	48644	48649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018019	TCT	2	6	48721	48726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_018019	AAG	2	6	48773	48778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018019	CGA	2	6	48819	48824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018019	TGC	3	9	48869	48877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_018019	GAA	2	6	48933	48938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_018019	ATC	2	6	49076	49081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_018019	TGG	2	6	49255	49260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_018019	TAC	2	6	49359	49364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_018019	CAG	2	6	49393	49398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_018019	CCT	2	6	50054	50059	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_018019	GCT	2	6	51064	51069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_018019	AAC	2	6	51095	51100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_018019	CCA	2	6	53075	53080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_018019	ATC	2	6	53254	53259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018019	TGG	2	6	53680	53685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018019	CGG	2	6	53689	53694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_018019	GCC	2	6	53718	53723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_018019	CGG	2	6	53762	53767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_018019	TGG	2	6	56130	56135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_018019	CAT	2	6	56175	56180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_018019	AGC	2	6	56207	56212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_018019	ACG	2	6	56264	56269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_018019	GCC	2	6	56275	56280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_018019	TGT	2	6	56904	56909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_018019	AAT	2	6	56925	56930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_018019	AAG	2	6	56935	56940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_018019	TCT	2	6	57319	57324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_018019	TCA	2	6	57337	57342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_018019	CGC	2	6	57413	57418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_018019	GAA	2	6	57486	57491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_018019	CAG	2	6	57495	57500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_018019	TGA	2	6	57560	57565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_018019	GGA	2	6	57713	57718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_018019	TGC	2	6	57759	57764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_018019	CGT	2	6	57863	57868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_018019	ACG	2	6	57900	57905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_018019	GTG	2	6	58107	58112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_018019	ACC	2	6	58137	58142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_018019	TCT	2	6	58282	58287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_018019	CAC	2	6	58335	58340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_018019	AGC	2	6	58354	58359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_018019	CGG	3	9	58370	58378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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