MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 7605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018019	ATCG	2	8	303256	303263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_018019	TGTTC	2	10	303300	303309	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1003	NC_018019	CAA	2	6	303366	303371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_018019	ATG	2	6	303392	303397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_018019	TGCC	2	8	304481	304488	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_018019	AGCGG	2	10	304500	304509	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1007	NC_018019	CCG	2	6	306161	306166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1008	NC_018019	AGG	2	6	306176	306181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_018019	CCTT	2	8	310818	310825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_018019	GT	3	6	310837	310842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_018019	GCT	2	6	310920	310925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_018019	TTTGCC	2	12	311994	312005	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_018019	GTA	2	6	312016	312021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_018019	TCT	2	6	312121	312126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_018019	CAG	2	6	312147	312152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_018019	TGGGG	2	10	312190	312199	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_018019	CTT	2	6	312269	312274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_018019	GGA	2	6	312275	312280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_018019	GT	4	8	312313	312320	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_018019	CAA	2	6	312425	312430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_018019	CTA	2	6	312619	312624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_018019	TTG	2	6	312689	312694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_018019	GGT	2	6	312695	312700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_018019	AAC	2	6	312738	312743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_018019	GT	3	6	312870	312875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_018019	TTC	2	6	312879	312884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_018019	AAG	2	6	312924	312929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_018019	GTC	2	6	312939	312944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_018019	GTA	2	6	312962	312967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_018019	TTGTG	2	10	313003	313012	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_018019	TG	3	6	313015	313020	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_018019	GCTT	2	8	313021	313028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_018019	ACGGTA	2	12	313064	313075	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1034	NC_018019	GT	3	6	313097	313102	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_018019	CGT	2	6	313108	313113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_018019	ACA	2	6	313130	313135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_018019	GAG	2	6	313138	313143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_018019	CGG	2	6	313521	313526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_018019	AGC	2	6	314605	314610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_018019	GTT	2	6	314620	314625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_018019	AGT	2	6	314657	314662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_018019	ACT	3	9	314687	314695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_018019	CA	3	6	315194	315199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_018019	CCT	2	6	315974	315979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_018019	CA	3	6	315985	315990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_018019	AGG	2	6	315997	316002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_018019	GA	3	6	318762	318767	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_018019	ATG	2	6	318781	318786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_018019	TTAT	2	8	318820	318827	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_018019	CGG	2	6	320211	320216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_018019	AGGA	2	8	320240	320247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_018019	ACC	2	6	320845	320850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_018019	TAC	2	6	321244	321249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_018019	ATG	2	6	321275	321280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_018019	T	6	6	321314	321319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_018019	AGG	2	6	321439	321444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_018019	A	6	6	321538	321543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_018019	TCA	2	6	324175	324180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_018019	AGCG	2	8	324194	324201	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_018019	ATC	2	6	324224	324229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_018019	TGCC	2	8	324278	324285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_018019	GAA	2	6	328993	328998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_018019	GTAT	2	8	330025	330032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_018019	CGA	2	6	330043	330048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_018019	CAG	2	6	330118	330123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_018019	GCT	2	6	333712	333717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_018019	CAT	3	9	333737	333745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_018019	T	6	6	333745	333750	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_018019	G	6	6	333773	333778	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_018019	ACT	2	6	337856	337861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_018019	GTT	2	6	337938	337943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_018019	ATG	2	6	339944	339949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_018019	AGTA	2	8	339956	339963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_018019	TTC	2	6	339965	339970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_018019	CA	3	6	340083	340088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_018019	T	6	6	340090	340095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_018019	AAG	2	6	340125	340130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_018019	TAA	2	6	340335	340340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_018019	TG	3	6	340354	340359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_018019	AAT	2	6	340415	340420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_018019	GAA	2	6	342309	342314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_018019	GCC	3	9	344586	344594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1083	NC_018019	CAGT	2	8	344610	344617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_018019	TA	3	6	346492	346497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_018019	GTT	2	6	346498	346503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_018019	CTTGC	2	10	346544	346553	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1087	NC_018019	TG	3	6	346572	346577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_018019	GTC	2	6	346588	346593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_018019	A	6	6	346713	346718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_018019	TGA	2	6	346719	346724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_018019	GAAT	2	8	346727	346734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_018019	GTC	2	6	347144	347149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_018019	TTG	2	6	347200	347205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_018019	G	6	6	347212	347217	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_018019	GCT	2	6	347251	347256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_018019	GCTT	2	8	347260	347267	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_018019	TG	3	6	347290	347295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_018019	TGG	2	6	347314	347319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_018019	TGGT	2	8	347337	347344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_018019	T	6	6	347437	347442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_018019	CTT	2	6	347501	347506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_018019	GAA	2	6	347523	347528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_018019	CGC	2	6	348494	348499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_018019	TTG	2	6	348547	348552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_018019	AGTG	2	8	348609	348616	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_018019	TCCT	2	8	350840	350847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_018019	GCCG	2	8	350921	350928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1108	NC_018019	GGT	2	6	350958	350963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_018019	CCA	2	6	351091	351096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_018019	AGG	2	6	351105	351110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_018019	AC	3	6	351111	351116	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1112	NC_018019	GCT	2	6	352326	352331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_018019	T	6	6	352373	352378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_018019	ATG	2	6	352404	352409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_018019	GGATTT	2	12	352469	352480	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_018019	TGC	2	6	352481	352486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_018019	AT	3	6	352549	352554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_018019	ATG	2	6	352557	352562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_018019	TGC	2	6	352615	352620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_018019	CAC	2	6	352631	352636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_018019	TGC	2	6	352663	352668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_018019	GCA	2	6	352679	352684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_018019	TGG	2	6	352692	352697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_018019	G	6	6	352727	352732	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_018019	TGG	3	9	352805	352813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_018019	CGT	2	6	352900	352905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_018019	GGA	2	6	352950	352955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_018019	TCC	2	6	355769	355774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1129	NC_018019	GGC	2	6	355783	355788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_018019	AGCA	2	8	355791	355798	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1131	NC_018019	AGGGG	2	10	355859	355868	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_018019	CGC	2	6	355924	355929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1133	NC_018019	AGG	2	6	355930	355935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1135	NC_018019	CTG	2	6	356069	356074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1405	NC_018019	CCT	2	6	426245	426250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1406	NC_018019	TTG	2	6	426259	426264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1407	NC_018019	GTT	2	6	426508	426513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1408	NC_018019	TGG	2	6	426548	426553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1410	NC_018019	CGA	2	6	426662	426667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1412	NC_018019	TAT	2	6	426723	426728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1414	NC_018019	GAT	2	6	426786	426791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1426	NC_018019	CGG	2	6	440480	440485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1427	NC_018019	CGA	2	6	440594	440599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1432	NC_018019	GA	3	6	444502	444507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_018019	TAT	2	6	444618	444623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_018019	GAT	2	6	444659	444664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1443	NC_018019	CGAT	2	8	444889	444896	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1444	NC_018019	TTG	2	6	445070	445075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_018019	GCG	2	6	445083	445088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1487	NC_018019	GAT	2	6	453704	453709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1500	NC_018019	TGCCT	2	10	460601	460610	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

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