MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis Cp162 chromosome

Total Repeats: 7605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_018019	TG	3	6	2262669	2262674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_018019	TGA	2	6	2262751	2262756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_018019	ACC	2	6	2262892	2262897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7504	NC_018019	TTA	2	6	2262957	2262962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_018019	CTA	2	6	2263037	2263042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7506	NC_018019	AGA	2	6	2263047	2263052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_018019	TGA	2	6	2263057	2263062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_018019	GCG	2	6	2263179	2263184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7509	NC_018019	GGT	2	6	2263195	2263200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7510	NC_018019	AT	3	6	2263279	2263284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7511	NC_018019	CAA	2	6	2263308	2263313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7512	NC_018019	CAA	2	6	2263401	2263406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7513	NC_018019	GTTG	2	8	2263546	2263553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7514	NC_018019	GC	3	6	2263559	2263564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7515	NC_018019	CAA	2	6	2263593	2263598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7516	NC_018019	CAG	2	6	2263654	2263659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7517	NC_018019	AGTG	2	8	2263660	2263667	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7518	NC_018019	GC	3	6	2263750	2263755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7519	NC_018019	GCG	2	6	2263780	2263785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7520	NC_018019	CAGG	2	8	2263895	2263902	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7521	NC_018019	GAA	2	6	2264732	2264737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7522	NC_018019	A	6	6	2264736	2264741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7523	NC_018019	TCA	2	6	2267246	2267251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7524	NC_018019	ATT	2	6	2267266	2267271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7525	NC_018019	TGG	3	9	2267297	2267305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7526	NC_018019	CTAT	2	8	2267333	2267340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7527	NC_018019	TCAA	2	8	2267594	2267601	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7528	NC_018019	TGT	2	6	2270234	2270239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7529	NC_018019	CTC	2	6	2270312	2270317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7530	NC_018019	CTT	2	6	2271278	2271283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_018019	GGA	2	6	2271963	2271968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_018019	TCC	2	6	2272745	2272750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7533	NC_018019	AGA	2	6	2272780	2272785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7534	NC_018019	A	6	6	2272826	2272831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_018019	CATA	2	8	2273458	2273465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7536	NC_018019	CCTT	2	8	2273473	2273480	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7537	NC_018019	CA	3	6	2275170	2275175	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7538	NC_018019	CAC	2	6	2275245	2275250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7539	NC_018019	TCC	2	6	2275264	2275269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7540	NC_018019	TATT	2	8	2275297	2275304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7541	NC_018019	A	6	6	2275363	2275368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7542	NC_018019	TTC	2	6	2275375	2275380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7543	NC_018019	CTTTT	2	10	2275438	2275447	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
7544	NC_018019	AAG	2	6	2275449	2275454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_018019	ACA	2	6	2279469	2279474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_018019	GGC	2	6	2279552	2279557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7547	NC_018019	AGAAA	2	10	2279564	2279573	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7548	NC_018019	TAC	2	6	2283063	2283068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7549	NC_018019	TGG	2	6	2283078	2283083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7550	NC_018019	CAC	2	6	2283106	2283111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7551	NC_018019	TTTTCT	2	12	2283114	2283125	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7552	NC_018019	CTA	2	6	2283221	2283226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_018019	TTC	2	6	2283279	2283284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7554	NC_018019	ACA	2	6	2284252	2284257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7555	NC_018019	AC	3	6	2285253	2285258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7556	NC_018019	GT	3	6	2285693	2285698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7557	NC_018019	TGG	2	6	2286885	2286890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7558	NC_018019	ACC	2	6	2286906	2286911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7559	NC_018019	T	7	7	2286913	2286919	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7560	NC_018019	AAG	2	6	2287615	2287620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7561	NC_018019	GC	3	6	2288640	2288645	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7562	NC_018019	ACC	2	6	2288662	2288667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7563	NC_018019	CG	3	6	2289633	2289638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7564	NC_018019	GTC	2	6	2289678	2289683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7565	NC_018019	T	6	6	2289738	2289743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7566	NC_018019	CAG	2	6	2290373	2290378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7567	NC_018019	GGA	2	6	2290407	2290412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7568	NC_018019	GTT	2	6	2290442	2290447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7569	NC_018019	CCA	2	6	2290583	2290588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7570	NC_018019	GCC	2	6	2290607	2290612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7571	NC_018019	TG	3	6	2290617	2290622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_018019	GAA	2	6	2290639	2290644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7573	NC_018019	TGG	2	6	2291621	2291626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7574	NC_018019	CG	3	6	2291717	2291722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7575	NC_018019	CAC	2	6	2291748	2291753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7576	NC_018019	AT	3	6	2291831	2291836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7577	NC_018019	CAG	2	6	2291863	2291868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7578	NC_018019	CAG	2	6	2291883	2291888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7579	NC_018019	ATT	3	9	2291905	2291913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7580	NC_018019	GA	3	6	2291947	2291952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7581	NC_018019	CTC	2	6	2291955	2291960	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7582	NC_018019	CCT	2	6	2292179	2292184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7583	NC_018019	ACG	2	6	2292230	2292235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7584	NC_018019	TCG	2	6	2292281	2292286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7585	NC_018019	CTG	2	6	2292290	2292295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7586	NC_018019	GAAG	2	8	2292308	2292315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_018019	CGT	2	6	2292319	2292324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7588	NC_018019	AAG	2	6	2292336	2292341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_018019	CTC	2	6	2292497	2292502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7590	NC_018019	TG	3	6	2292507	2292512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_018019	GAT	2	6	2292602	2292607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_018019	CAC	2	6	2292625	2292630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7593	NC_018019	CA	3	6	2292679	2292684	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7594	NC_018019	ATG	2	6	2292693	2292698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7595	NC_018019	GCG	2	6	2292729	2292734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7596	NC_018019	CAA	2	6	2292739	2292744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_018019	CTAG	2	8	2292816	2292823	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7598	NC_018019	CAA	2	6	2292847	2292852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_018019	GCT	2	6	2292884	2292889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7600	NC_018019	TC	3	6	2292914	2292919	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7601	NC_018019	CA	3	6	2293046	2293051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7602	NC_018019	AAC	2	6	2293273	2293278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7603	NC_018019	TTG	2	6	2293341	2293346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7604	NC_018019	ATT	2	6	2293350	2293355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7605	NC_018019	GTT	3	9	2293428	2293436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.