MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW5

Total Repeats: 2957

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017953	TCG	2	6	182754	182759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017953	TGT	2	6	182766	182771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017953	T	6	6	182784	182789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017953	T	7	7	182791	182797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017953	AAAG	2	8	182843	182850	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017953	GATG	2	8	182875	182882	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017953	TCT	2	6	182892	182897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017953	AGG	2	6	182946	182951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017953	GGA	2	6	182980	182985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017953	TTGAG	2	10	183026	183035	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017953	GAATG	2	10	183051	183060	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017953	CT	3	6	183101	183106	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017953	TGA	2	6	183115	183120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017953	GA	4	8	183143	183150	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017953	AAC	2	6	183198	183203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017953	TGA	2	6	183217	183222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017953	GTA	2	6	183228	183233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017953	TGC	2	6	183253	183258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017953	CCAG	2	8	183273	183280	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
520	NC_017953	TTG	2	6	183282	183287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017953	GAC	2	6	183291	183296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017953	GAT	2	6	183321	183326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017953	GA	3	6	183347	183352	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017953	GCG	2	6	183355	183360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017953	ACT	2	6	183403	183408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017953	TAG	2	6	183437	183442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017953	GCA	2	6	183492	183497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017953	TCGC	2	8	183535	183542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017953	AGA	2	6	183546	183551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017953	GCA	2	6	183555	183560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017953	GAA	2	6	183583	183588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017953	AGA	2	6	183622	183627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017953	GA	3	6	183661	183666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017953	GTT	2	6	183678	183683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017953	GTT	2	6	183713	183718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017953	CTT	2	6	183721	183726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017953	GA	3	6	183764	183769	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017953	GTT	2	6	183775	183780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017953	GAG	2	6	183796	183801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017953	GAA	2	6	183816	183821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017953	TTG	2	6	183827	183832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017953	AGG	2	6	183866	183871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017953	AGA	2	6	183962	183967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017953	TGA	2	6	183984	183989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017953	CAG	3	9	184057	184065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017953	GTA	2	6	184100	184105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017953	GTTG	2	8	184140	184147	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017953	GGA	3	9	184155	184163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017953	TC	3	6	184171	184176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017953	ATT	2	6	184190	184195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017953	A	7	7	184220	184226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017953	T	8	8	184232	184239	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017953	ATA	2	6	184282	184287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017953	A	6	6	184287	184292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017953	TAT	2	6	184363	184368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017953	GA	3	6	184403	184408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017953	GTT	2	6	185725	185730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017953	GTT	4	12	186123	186134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017953	T	6	6	186140	186145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017953	T	7	7	186148	186154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017953	T	6	6	186160	186165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017953	T	7	7	186210	186216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017953	A	7	7	186232	186238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017953	T	6	6	186255	186260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017953	ATC	2	6	187950	187955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017953	CGATA	2	10	187978	187987	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
567	NC_017953	T	6	6	187991	187996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017953	TAT	2	6	188305	188310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017953	T	6	6	188324	188329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017953	GCA	2	6	188377	188382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017953	CTT	2	6	188392	188397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017953	GGAC	2	8	188419	188426	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_017953	AAG	2	6	188529	188534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017953	TTG	2	6	188551	188556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017953	CAT	2	6	188561	188566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017953	T	7	7	188600	188606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017953	TAA	2	6	188679	188684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017953	TTG	2	6	188707	188712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017953	AAG	2	6	192508	192513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017953	TC	3	6	192518	192523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017953	GAG	2	6	192600	192605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017953	TCT	2	6	192615	192620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017953	TATGC	2	10	192673	192682	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_017953	GAA	2	6	192776	192781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017953	AAGAA	2	10	192839	192848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017953	AAT	2	6	192849	192854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017953	AT	3	6	192860	192865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017953	TGT	2	6	192874	192879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017953	ATGC	2	8	193234	193241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017953	GTT	2	6	193242	193247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017953	GCA	2	6	193295	193300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017953	CTTT	2	8	193375	193382	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017953	AAG	2	6	193422	193427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017953	T	6	6	193472	193477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017953	ATT	2	6	193485	193490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017953	T	6	6	193501	193506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017953	TATGAA	2	12	195477	195488	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017953	AGA	2	6	195533	195538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017953	AAC	2	6	195540	195545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017953	ATA	2	6	195560	195565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017953	T	7	7	195585	195591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017953	TGA	2	6	195695	195700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017953	CTC	2	6	196467	196472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017953	GGA	2	6	196525	196530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017953	TTC	2	6	196575	196580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017953	TTGCCT	2	12	196595	196606	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017953	GTTC	2	8	196678	196685	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_017953	TC	3	6	196705	196710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017953	CTA	2	6	196789	196794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017953	ATTT	2	8	196822	196829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017953	AACT	2	8	196833	196840	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017953	GAC	2	6	196849	196854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017953	T	8	8	196898	196905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017953	TTTG	2	8	196942	196949	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017953	AACA	2	8	197070	197077	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_017953	ATC	2	6	197133	197138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017953	AGAAA	2	10	197144	197153	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017953	AGA	2	6	197220	197225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017953	A	7	7	197277	197283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017953	A	7	7	197308	197314	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017953	AG	3	6	197330	197335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017953	AAT	2	6	197340	197345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017953	T	8	8	197360	197367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017953	T	6	6	197406	197411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017953	TAC	2	6	197450	197455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017953	ATT	2	6	197459	197464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017953	A	8	8	200254	200261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017953	CTT	2	6	200293	200298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017953	A	8	8	200303	200310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017953	TC	3	6	200321	200326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_017953	CTT	2	6	200330	200335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017953	A	6	6	202099	202104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017953	AG	3	6	202153	202158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017953	CT	3	6	202165	202170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017953	TGC	2	6	202207	202212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017953	AGG	2	6	202228	202233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017953	ACGA	2	8	202940	202947	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_017953	CTAAG	2	10	203106	203115	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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