MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/SW3

Total Repeats: 383

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017952	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017952	GA	3	6	7598	7603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017952	TA	3	6	11848	11853	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017952	AG	3	6	11909	11914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017952	TA	3	6	12459	12464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017952	TA	3	6	13929	13934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017952	TA	4	8	14153	14160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017952	AG	3	6	18105	18110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017952	GA	3	6	18118	18123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017952	CT	3	6	19040	19045	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017952	AG	3	6	21106	21111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017952	GA	3	6	21264	21269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017952	AG	3	6	21781	21786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017952	CT	3	6	21850	21855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_017952	GA	3	6	27102	27107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017952	CT	3	6	27109	27114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017952	TC	3	6	28477	28482	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017952	AG	3	6	28560	28565	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017952	GA	3	6	36974	36979	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017952	AT	3	6	37076	37081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017952	CT	3	6	39343	39348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017952	CT	3	6	40713	40718	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017952	AG	3	6	42839	42844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017952	CT	3	6	42905	42910	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017952	GA	5	10	43180	43189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017952	AG	3	6	43304	43309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017952	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017952	AG	3	6	48632	48637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017952	TG	4	8	51979	51986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017952	GA	3	6	56303	56308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017952	GA	3	6	61451	61456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017952	AG	4	8	65470	65477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017952	TA	3	6	85899	85904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017952	GA	3	6	91252	91257	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017952	CT	3	6	93602	93607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_017952	GA	3	6	94130	94135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017952	TA	3	6	94746	94751	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017952	TC	3	6	100622	100627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017952	AT	3	6	100673	100678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017952	GC	3	6	102779	102784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017952	TA	3	6	107349	107354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017952	TG	3	6	116591	116596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017952	CA	3	6	118509	118514	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017952	AG	4	8	119177	119184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017952	GA	3	6	120999	121004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017952	TA	3	6	123234	123239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017952	GT	3	6	124223	124228	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017952	CT	3	6	128760	128765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017952	TC	3	6	131082	131087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017952	AG	3	6	131159	131164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017952	AG	3	6	131184	131189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017952	TG	3	6	133991	133996	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017952	AG	3	6	138846	138851	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017952	GA	3	6	138909	138914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017952	AT	3	6	143141	143146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017952	AG	3	6	157949	157954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017952	TC	3	6	172412	172417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017952	AG	3	6	172544	172549	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017952	CT	3	6	172562	172567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017952	TG	3	6	179053	179058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017952	CT	3	6	183193	183198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017952	GA	4	8	183235	183242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017952	GA	3	6	183439	183444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017952	TA	3	6	183682	183687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017952	GA	3	6	183795	183800	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017952	GA	3	6	183898	183903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017952	TC	3	6	184305	184310	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017952	GA	3	6	184537	184542	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017952	TC	3	6	192653	192658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017952	AT	3	6	192995	193000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017952	AG	3	6	197772	197777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017952	TC	3	6	200764	200769	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017952	AG	3	6	202596	202601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017952	CT	3	6	204522	204527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_017952	GA	4	8	207583	207590	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017952	CT	4	8	207631	207638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017952	AG	4	8	218867	218874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017952	CA	3	6	218926	218931	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017952	TA	3	6	220421	220426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017952	CT	3	6	222063	222068	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017952	TC	3	6	225064	225069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017952	AG	3	6	225095	225100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017952	TC	3	6	239291	239296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017952	AG	3	6	239317	239322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017952	CA	3	6	244241	244246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017952	GT	3	6	244458	244463	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017952	GA	3	6	251325	251330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017952	TG	3	6	251435	251440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017952	AG	3	6	252237	252242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017952	AG	3	6	252262	252267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017952	AG	3	6	253245	253250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017952	TA	3	6	255051	255056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017952	TC	3	6	257367	257372	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017952	AG	3	6	258845	258850	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017952	TA	3	6	265205	265210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017952	CA	3	6	267012	267017	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017952	TC	3	6	268912	268917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017952	TA	3	6	274465	274470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017952	AT	4	8	285025	285032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017952	CT	3	6	285877	285882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017952	TC	4	8	285968	285975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017952	TC	3	6	287659	287664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017952	TC	3	6	287716	287721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017952	CT	3	6	288189	288194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017952	AT	3	6	300205	300210	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017952	CA	3	6	302534	302539	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017952	AC	3	6	302575	302580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017952	GA	3	6	307265	307270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017952	AG	3	6	316485	316490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017952	CT	3	6	348452	348457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017952	CT	3	6	351524	351529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017952	TC	3	6	355750	355755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017952	CT	3	6	359666	359671	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017952	AC	3	6	362999	363004	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017952	GA	3	6	364911	364916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017952	TC	3	6	364989	364994	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017952	TA	3	6	365191	365196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017952	GC	3	6	366720	366725	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017952	TC	3	6	367024	367029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017952	TA	3	6	367094	367099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017952	AC	3	6	367806	367811	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017952	CT	4	8	367978	367985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017952	CT	3	6	368211	368216	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017952	CA	3	6	368220	368225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017952	GT	3	6	368537	368542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017952	CT	4	8	382307	382314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017952	GA	3	6	387015	387020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017952	CG	3	6	392146	392151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017952	CA	3	6	393196	393201	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017952	TC	3	6	395743	395748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017952	CT	3	6	396233	396238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017952	GA	3	6	396363	396368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017952	GA	3	6	396494	396499	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017952	CT	3	6	410599	410604	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017952	CT	3	6	411586	411591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017952	CT	3	6	412383	412388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017952	CT	3	6	430314	430319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017952	CT	3	6	431337	431342	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017952	AG	3	6	431684	431689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017952	GA	3	6	433379	433384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017952	AC	3	6	437378	437383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017952	CT	3	6	441657	441662	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017952	AC	3	6	441695	441700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017952	CA	3	6	444164	444169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017952	CT	3	6	445564	445569	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017952	CT	3	6	454846	454851	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017952	CT	3	6	457299	457304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017952	AG	3	6	460987	460992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017952	TC	3	6	467525	467530	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017952	AT	3	6	467594	467599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017952	GA	4	8	468968	468975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017952	TA	3	6	469011	469016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017952	GA	3	6	469109	469114	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017952	AC	3	6	486418	486423	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.