MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW4

Total Repeats: 389

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017951	TC	3	6	2270	2275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017951	GA	3	6	7596	7601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017951	AG	3	6	9951	9956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017951	TA	3	6	11849	11854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017951	TA	3	6	13940	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017951	TA	4	8	14164	14171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017951	AG	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017951	GA	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017951	CT	3	6	19051	19056	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017951	AG	3	6	21117	21122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017951	GA	3	6	21275	21280	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017951	AG	3	6	21792	21797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017951	CT	3	6	21861	21866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017951	GA	3	6	27113	27118	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017951	CT	3	6	27120	27125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017951	TC	3	6	28488	28493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017951	AG	3	6	28571	28576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017951	GA	3	6	36985	36990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017951	AT	3	6	37087	37092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017951	CT	3	6	39354	39359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017951	CT	3	6	40725	40730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017951	AG	3	6	42851	42856	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017951	CT	3	6	42917	42922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017951	GA	5	10	43192	43201	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017951	AG	3	6	43316	43321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017951	TC	3	6	44408	44413	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017951	AG	3	6	48644	48649	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017951	TG	4	8	51993	52000	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017951	GA	3	6	56209	56214	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017951	GA	3	6	61357	61362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017951	AG	4	8	65376	65383	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017951	TA	3	6	85805	85810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017951	GA	3	6	91158	91163	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017951	CT	3	6	93508	93513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017951	GA	3	6	94036	94041	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017951	TA	3	6	94652	94657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017951	TC	3	6	100534	100539	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017951	AT	3	6	100585	100590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017951	TA	3	6	107261	107266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017951	TG	3	6	116503	116508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017951	CA	3	6	118421	118426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017951	AG	4	8	119089	119096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017951	GA	3	6	120911	120916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017951	TA	3	6	123146	123151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017951	GT	3	6	124135	124140	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017951	CT	3	6	128671	128676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017951	TC	3	6	130993	130998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017951	AG	3	6	131070	131075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017951	AG	3	6	131095	131100	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017951	TG	3	6	133902	133907	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017951	AG	3	6	138757	138762	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017951	GA	3	6	138820	138825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017951	AT	3	6	143052	143057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017951	AG	3	6	153406	153411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017951	AG	3	6	153833	153838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017951	AG	3	6	157858	157863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017951	TC	3	6	172321	172326	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017951	AG	3	6	172453	172458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017951	CT	3	6	172471	172476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017951	TG	3	6	178962	178967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017951	CT	3	6	181675	181680	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017951	GA	3	6	181754	181759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017951	CA	3	6	182067	182072	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017951	TG	3	6	182466	182471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017951	GA	3	6	182511	182516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017951	CT	3	6	183097	183102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017951	GA	4	8	183139	183146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017951	GA	3	6	183343	183348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017951	GA	3	6	183657	183662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017951	GA	3	6	183760	183765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017951	TC	3	6	184167	184172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017951	GA	3	6	184399	184404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017951	TC	3	6	192514	192519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017951	AT	3	6	192856	192861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017951	TC	3	6	196701	196706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017951	AG	3	6	197326	197331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017951	TC	3	6	200317	200322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017951	AG	3	6	202149	202154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017951	CT	3	6	202161	202166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017951	CT	3	6	204075	204080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017951	GA	4	8	207134	207141	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017951	CT	4	8	207182	207189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_017951	AG	4	8	218418	218425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017951	CA	3	6	218477	218482	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017951	TA	3	6	219972	219977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017951	CT	3	6	221614	221619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017951	TC	3	6	224615	224620	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017951	AG	3	6	224646	224651	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017951	TC	3	6	238842	238847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017951	AG	3	6	238868	238873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017951	CA	3	6	243792	243797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017951	GT	3	6	244009	244014	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017951	GA	3	6	250876	250881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017951	TG	3	6	250986	250991	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017951	AG	3	6	251788	251793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017951	AG	3	6	251813	251818	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017951	AG	3	6	252796	252801	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017951	TA	3	6	254602	254607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017951	TC	3	6	256918	256923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017951	AG	3	6	258396	258401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017951	TA	3	6	264756	264761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017951	CA	3	6	266563	266568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017951	TC	3	6	268463	268468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017951	TA	3	6	274016	274021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017951	AT	4	8	284576	284583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017951	CT	3	6	285428	285433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017951	TC	4	8	285519	285526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017951	TC	3	6	287210	287215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017951	TC	3	6	287267	287272	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017951	CT	3	6	287740	287745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017951	CA	3	6	302083	302088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017951	AC	3	6	302124	302129	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017951	GA	3	6	306814	306819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017951	AG	3	6	316034	316039	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017951	CT	3	6	348012	348017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017951	CT	3	6	351083	351088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017951	TC	3	6	355309	355314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017951	CT	3	6	359225	359230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017951	AC	3	6	362558	362563	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017951	GA	3	6	364468	364473	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017951	TC	3	6	364546	364551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017951	TA	3	6	364748	364753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017951	GC	3	6	366277	366282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017951	TC	3	6	366581	366586	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017951	TA	3	6	366651	366656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017951	AC	3	6	367363	367368	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017951	CT	4	8	367535	367542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017951	CT	3	6	367768	367773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017951	CA	3	6	367777	367782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017951	GT	3	6	368095	368100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017951	CT	4	8	381865	381872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_017951	GA	3	6	386573	386578	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017951	CG	3	6	391704	391709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017951	CA	3	6	392754	392759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017951	TC	3	6	395301	395306	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017951	CT	3	6	395791	395796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017951	GA	3	6	395921	395926	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017951	GA	3	6	396052	396057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017951	CT	3	6	410157	410162	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017951	CT	3	6	411144	411149	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017951	CT	3	6	411941	411946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_017951	CT	3	6	429872	429877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017951	CT	3	6	430895	430900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017951	AG	3	6	431242	431247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017951	GA	3	6	432937	432942	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017951	AC	3	6	436935	436940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017951	CT	3	6	441206	441211	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017951	AC	3	6	441244	441249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017951	CA	3	6	443713	443718	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017951	CT	3	6	445113	445118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017951	CT	3	6	454395	454400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_017951	CT	3	6	456848	456853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017951	AG	3	6	460536	460541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017951	TC	3	6	467074	467079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.