MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis F/SW4

Total Repeats: 2976

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017951	TCG	2	6	182750	182755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_017951	TGT	2	6	182762	182767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017951	T	6	6	182780	182785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017951	T	7	7	182787	182793	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017951	AAAG	2	8	182839	182846	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017951	GATG	2	8	182871	182878	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017951	TCT	2	6	182888	182893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_017951	AGG	2	6	182942	182947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017951	GGA	2	6	182976	182981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017951	TTGAG	2	10	183022	183031	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017951	GAATG	2	10	183047	183056	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017951	CT	3	6	183097	183102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_017951	TGA	2	6	183111	183116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017951	GA	4	8	183139	183146	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017951	AAC	2	6	183194	183199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
516	NC_017951	AAC	2	6	183203	183208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_017951	TGA	2	6	183213	183218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017951	TGC	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017951	CCAG	2	8	183269	183276	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
520	NC_017951	TTG	2	6	183278	183283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017951	GAC	2	6	183287	183292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017951	GAT	2	6	183317	183322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017951	GA	3	6	183343	183348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017951	GCG	2	6	183351	183356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017951	ACT	2	6	183399	183404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_017951	TAG	2	6	183433	183438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017951	GCA	2	6	183488	183493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017951	TCGC	2	8	183531	183538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
529	NC_017951	AGA	2	6	183542	183547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017951	GCA	2	6	183551	183556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017951	GAA	2	6	183579	183584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017951	AGA	2	6	183618	183623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017951	GA	3	6	183657	183662	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017951	GTT	2	6	183674	183679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017951	GTT	2	6	183709	183714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017951	CTT	2	6	183717	183722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_017951	GA	3	6	183760	183765	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017951	GTT	2	6	183771	183776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017951	GAG	2	6	183792	183797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017951	GAA	2	6	183812	183817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017951	TTG	2	6	183823	183828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017951	AGG	2	6	183862	183867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017951	AGA	2	6	183958	183963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017951	TGA	2	6	183980	183985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017951	CAG	3	9	184053	184061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_017951	GTA	2	6	184096	184101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017951	GTTG	2	8	184136	184143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017951	GGA	3	9	184151	184159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017951	TC	3	6	184167	184172	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
550	NC_017951	ATT	2	6	184186	184191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017951	A	7	7	184216	184222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017951	T	8	8	184228	184235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017951	ATA	2	6	184278	184283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017951	A	6	6	184283	184288	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017951	TAT	2	6	184359	184364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017951	GA	3	6	184399	184404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017951	GTT	2	6	185721	185726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017951	GTT	4	12	186119	186130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017951	T	6	6	186136	186141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017951	T	7	7	186144	186150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017951	T	6	6	186156	186161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017951	T	7	7	186206	186212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017951	A	7	7	186228	186234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017951	T	6	6	186251	186256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017951	ATC	2	6	187946	187951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_017951	CGATA	2	10	187974	187983	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
567	NC_017951	T	6	6	187987	187992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017951	TAT	2	6	188301	188306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017951	T	6	6	188320	188325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017951	GCA	2	6	188373	188378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_017951	CTT	2	6	188388	188393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_017951	GGAC	2	8	188415	188422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
573	NC_017951	AAG	2	6	188525	188530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017951	TTG	2	6	188547	188552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017951	CAT	2	6	188557	188562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_017951	T	7	7	188596	188602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017951	TAA	2	6	188675	188680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017951	TTG	2	6	188703	188708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017951	AAG	2	6	192504	192509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017951	TC	3	6	192514	192519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017951	GAG	2	6	192596	192601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017951	TCT	2	6	192611	192616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_017951	TATGC	2	10	192669	192678	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
584	NC_017951	GAA	2	6	192772	192777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017951	AAGAA	2	10	192835	192844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017951	AAT	2	6	192845	192850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017951	AT	3	6	192856	192861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017951	TGT	2	6	192870	192875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
589	NC_017951	ATGC	2	8	193230	193237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
590	NC_017951	GTT	2	6	193238	193243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017951	GCA	2	6	193291	193296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017951	CTTT	2	8	193371	193378	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017951	AAG	2	6	193418	193423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017951	T	6	6	193468	193473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017951	ATT	2	6	193481	193486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017951	T	6	6	193497	193502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017951	TATGAA	2	12	195473	195484	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017951	AAC	2	6	195536	195541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_017951	ATA	2	6	195556	195561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017951	T	7	7	195581	195587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017951	TGA	2	6	195691	195696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017951	CTC	2	6	196463	196468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_017951	GGA	2	6	196521	196526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017951	TTC	2	6	196571	196576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017951	TTGCCT	2	12	196591	196602	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017951	GTTC	2	8	196674	196681	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
608	NC_017951	TC	3	6	196701	196706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
609	NC_017951	CTA	2	6	196785	196790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017951	ATTT	2	8	196818	196825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017951	AACT	2	8	196829	196836	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
612	NC_017951	GAC	2	6	196845	196850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017951	T	8	8	196894	196901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017951	TTTG	2	8	196938	196945	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017951	AACA	2	8	197066	197073	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
616	NC_017951	ATC	2	6	197129	197134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_017951	AGAAA	2	10	197140	197149	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017951	AGA	2	6	197216	197221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_017951	A	7	7	197273	197279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017951	A	7	7	197304	197310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017951	AG	3	6	197326	197331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017951	AAT	2	6	197336	197341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017951	T	8	8	197356	197363	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017951	T	6	6	197402	197407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017951	TAC	2	6	197446	197451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017951	ATT	2	6	197455	197460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017951	A	8	8	200250	200257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017951	CTT	2	6	200289	200294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_017951	A	8	8	200299	200306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017951	TC	3	6	200317	200322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
631	NC_017951	CTT	2	6	200326	200331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_017951	A	6	6	202095	202100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017951	AG	3	6	202149	202154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017951	CT	3	6	202161	202166	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
635	NC_017951	TGC	2	6	202203	202208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_017951	AGG	2	6	202224	202229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017951	ACGA	2	8	202936	202943	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
638	NC_017951	CTAAG	2	10	203102	203111	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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640	NC_017951	GAAA	2	8	203222	203229	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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