MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis 258 chromosome

Total Repeats: 6051

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017945	TTTC	2	8	396837	396844	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1002	NC_017945	ATA	2	6	396868	396873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_017945	CATC	2	8	396917	396924	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_017945	CCG	2	6	396958	396963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_017945	CAG	2	6	396993	396998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_017945	CAC	2	6	397009	397014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1007	NC_017945	ATA	2	6	397080	397085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017945	CGCCCG	2	12	397107	397118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1009	NC_017945	GTG	2	6	397125	397130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017945	T	6	6	397172	397177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017945	TTA	2	6	397188	397193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017945	TGG	2	6	397266	397271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017945	TGT	2	6	397648	397653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017945	GAT	2	6	397667	397672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017945	ACT	2	6	397822	397827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_017945	TGA	2	6	397894	397899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017945	GGAA	2	8	397924	397931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017945	TGA	2	6	397957	397962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017945	TCG	2	6	397971	397976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017945	TAT	2	6	397993	397998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017945	TGC	2	6	398173	398178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017945	CTCCG	2	10	398197	398206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1023	NC_017945	TGGCT	2	10	398421	398430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_017945	CAA	2	6	398449	398454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017945	CTAA	2	8	398561	398568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1026	NC_017945	AGA	2	6	398575	398580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_017945	AGCGC	2	10	398630	398639	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1028	NC_017945	GAG	2	6	398660	398665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_017945	AGC	2	6	398683	398688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_017945	GAA	2	6	398711	398716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_017945	GCT	2	6	398831	398836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_017945	CGG	2	6	398899	398904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_017945	GGC	2	6	398999	399004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017945	GCT	2	6	399013	399018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017945	GCGGA	2	10	399072	399081	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1036	NC_017945	GC	3	6	399089	399094	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1037	NC_017945	GA	4	8	399147	399154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017945	TGGGGG	2	12	400015	400026	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017945	TGG	2	6	400056	400061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017945	GGGTG	2	10	400096	400105	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_017945	TTG	2	6	400111	400116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017945	TAA	2	6	400151	400156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_017945	TCCG	2	8	400573	400580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_017945	AGGAA	2	10	401428	401437	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_017945	CA	3	6	402084	402089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_017945	TCT	2	6	402121	402126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_017945	GTC	2	6	402169	402174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_017945	GAG	2	6	403275	403280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017945	TG	3	6	403864	403869	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017945	AAT	2	6	406305	406310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017945	GGA	2	6	406314	406319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_017945	CGC	2	6	406341	406346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_017945	ATG	2	6	407940	407945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1055	NC_017945	GAA	2	6	414480	414485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017945	AC	3	6	414590	414595	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_017945	GGGA	2	8	414605	414612	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_017945	TGG	2	6	415257	415262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_017945	AGGC	2	8	415290	415297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1060	NC_017945	GAA	2	6	415316	415321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_017945	GTC	2	6	415339	415344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_017945	TCT	2	6	415364	415369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_017945	TG	3	6	415446	415451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017945	GCA	2	6	415474	415479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_017945	CAC	2	6	415494	415499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_017945	GCC	2	6	415502	415507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017945	CTGG	2	8	415534	415541	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1068	NC_017945	AGAC	2	8	415549	415556	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_017945	TCA	2	6	415566	415571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1071	NC_017945	TGG	2	6	416580	416585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_017945	GGC	2	6	416586	416591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_017945	CG	3	6	416630	416635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_017945	ATA	2	6	416731	416736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_017945	TAG	2	6	418475	418480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_017945	CTT	2	6	419957	419962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_017945	ATG	2	6	422125	422130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_017945	AC	3	6	422233	422238	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_017945	TTGA	2	8	422751	422758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_017945	TTCT	2	8	422784	422791	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_017945	GCA	2	6	422829	422834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_017945	TCA	2	6	422846	422851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1086	NC_017945	TGT	2	6	422937	422942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_017945	CAA	2	6	423046	423051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_017945	TGC	2	6	423210	423215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1094	NC_017945	AAG	2	6	425645	425650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1101	NC_017945	CCT	2	6	430090	430095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1102	NC_017945	TTG	2	6	430104	430109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_017945	A	6	6	430269	430274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_017945	GTT	2	6	430354	430359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_017945	TGG	2	6	430394	430399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_017945	AG	3	6	430483	430488	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_017945	CGA	2	6	430508	430513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1109	NC_017945	TAT	2	6	430569	430574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_017945	T	6	6	430578	430583	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_017945	GAT	2	6	430632	430637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1113	NC_017945	ATGC	2	8	432650	432657	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1114	NC_017945	TCG	2	6	435393	435398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_017945	TGG	2	6	435450	435455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017945	CTT	2	6	437403	437408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_017945	CTAA	2	8	439042	439049	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_017945	TTA	2	6	439081	439086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_017945	AGGA	2	8	439165	439172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_017945	A	6	6	440733	440738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017945	GATGT	2	10	443352	443361	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017945	CTTA	2	8	443419	443426	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_017945	CGG	2	6	444320	444325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_017945	CGA	2	6	444434	444439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1127	NC_017945	GGTGG	2	10	447237	447246	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_017945	GA	3	6	448342	448347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_017945	ATTG	2	8	448424	448431	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017945	TAT	2	6	448458	448463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017945	TTC	2	6	448506	448511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1132	NC_017945	G	6	6	448581	448586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017945	CGA	2	6	448598	448603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1135	NC_017945	GTT	2	6	448658	448663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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