MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cronobacter sakazakii ES15 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017933	CAAAAA	2	12	196989	197000	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017933	AATGAT	2	12	256048	256059	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017933	CATTTT	2	12	282863	282874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017933	AAAACC	2	12	301760	301771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017933	CATTTT	2	12	311458	311469	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017933	TAACCA	2	12	419263	419274	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017933	TCCTCT	2	12	461407	461418	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_017933	ACCCCA	2	12	495915	495926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017933	AAGTGA	2	12	542329	542340	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017933	CCGCTA	2	12	577147	577158	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017933	GCTTTA	2	12	578597	578608	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017933	GGATAT	2	12	698802	698813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017933	AGGGGC	2	12	711193	711204	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017933	GGCGCG	2	12	738216	738227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017933	GATCCC	2	12	819588	819599	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017933	CCTTGT	2	12	841307	841318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017933	GCTTAT	2	12	842999	843010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017933	GCGCAT	2	12	853592	853603	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017933	TGAAAA	2	12	1043656	1043667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017933	ACATTT	2	12	1077708	1077719	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017933	CGGTTG	2	12	1105688	1105699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017933	GCTTAC	2	12	1145420	1145431	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017933	ACTTGC	2	12	1174871	1174882	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017933	TTTCTG	2	12	1220250	1220261	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017933	AAAGAA	2	12	1232400	1232411	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017933	TTTTCT	2	12	1240573	1240584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017933	GAAAAT	2	12	1244535	1244546	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017933	CTTTTT	2	12	1295751	1295762	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017933	GAAATA	2	12	1304331	1304342	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017933	CGTTGC	2	12	1308290	1308301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017933	TAAAAT	2	12	1410482	1410493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017933	GCAAGA	2	12	1423657	1423668	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017933	TTTCCC	2	12	1438167	1438178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017933	TCGTTG	2	12	1457875	1457886	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017933	GCTTAC	2	12	1469885	1469896	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017933	TATTGT	2	12	1567693	1567704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017933	CTGAAC	2	12	1604856	1604867	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017933	TTCATT	2	12	1644888	1644899	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017933	ATAACG	2	12	1648596	1648607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017933	AAAGCT	2	12	1650421	1650432	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017933	TTTGAG	2	12	1663466	1663477	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017933	TACTTT	2	12	1677694	1677705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017933	TCAGGT	2	12	1836834	1836845	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017933	TACCCA	2	12	1858484	1858495	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017933	GGATTG	2	12	1917744	1917755	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017933	TTAATT	2	12	1926088	1926099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017933	CAGGCG	2	12	1954086	1954097	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017933	GCCTTA	2	12	1960161	1960172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017933	AAAGAG	2	12	1991179	1991190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017933	GCTTAC	2	12	2001637	2001648	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017933	ATCTAT	2	12	2012371	2012382	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017933	TTTTAT	2	12	2053532	2053543	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017933	TGAATA	2	12	2067133	2067144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017933	CAGGGG	2	12	2086438	2086449	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017933	TTACGC	2	12	2134674	2134685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017933	GCTTTT	2	12	2152618	2152629	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017933	GTTCAG	2	12	2160940	2160951	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017933	GATATA	2	12	2199874	2199885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017933	ATTGAA	2	12	2213128	2213139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017933	TTTCTG	2	12	2223227	2223238	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017933	GCATTG	2	12	2254457	2254468	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017933	ATCACC	2	12	2284871	2284882	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017933	TTGACG	2	12	2344960	2344971	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017933	CGCAAA	2	12	2374266	2374277	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017933	TATCAG	2	12	2397050	2397061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017933	ATCGTT	2	12	2474533	2474544	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017933	CTGCAA	2	12	2600190	2600201	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017933	AATTAC	2	12	2600280	2600291	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017933	AAGCGC	2	12	2609115	2609126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017933	GCTTAC	2	12	2670917	2670928	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017933	GTAAGC	2	12	2670967	2670978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017933	CTGCAT	2	12	2739108	2739119	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017933	CAATTT	2	12	2754191	2754202	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017933	AAGCGC	2	12	2784197	2784208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017933	GCTTAC	2	12	2786149	2786160	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017933	TGCGGC	2	12	2809007	2809018	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017933	CAAAAC	2	12	2813037	2813048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017933	GTAAGC	2	12	2836231	2836242	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017933	GTAAGC	2	12	2836552	2836563	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017933	CTTTCA	2	12	2871652	2871663	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017933	GTAAGC	2	12	2905221	2905232	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017933	TGCGTT	2	12	3002815	3002826	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017933	GCAGCG	2	12	3018406	3018417	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017933	TGGGTG	2	12	3071662	3071673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017933	TTTTTG	2	12	3243884	3243895	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017933	AATTTT	2	12	3294519	3294530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017933	TAGCAT	2	12	3334112	3334123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017933	AACAGC	2	12	3334283	3334294	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017933	ATAGCG	2	12	3343288	3343299	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017933	CACGCC	2	12	3347496	3347507	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017933	AAAAAC	2	12	3349357	3349368	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017933	TTGTGG	2	12	3389636	3389647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017933	TCCGGC	2	12	3407568	3407579	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017933	CCTTTT	2	12	3461107	3461118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017933	AATAAA	2	12	3508986	3508997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017933	AAAAAC	2	12	3545508	3545519	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017933	ATCATT	2	12	3642368	3642379	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017933	CTTCCC	2	12	3651122	3651133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017933	GCGGGT	2	12	3656806	3656817	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017933	AAATGG	2	12	3695387	3695398	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017933	GTAAAA	2	12	3707108	3707119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017933	GAATCT	2	12	3759972	3759983	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017933	TTTATA	2	12	3771782	3771793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017933	GCGCAA	2	12	3812195	3812206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017933	GGTTAA	2	12	3817750	3817761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017933	ATAAAA	2	12	3900874	3900885	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017933	CAAAAG	2	12	3910883	3910894	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017933	CGCGCA	2	12	3932315	3932326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017933	AAGGGA	2	12	4138799	4138810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017933	GGAAAA	2	12	4145431	4145442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017933	CGGTAA	2	12	4166786	4166797	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017933	CTTAAC	2	12	4172163	4172174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017933	CTTATG	2	12	4174975	4174986	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017933	TATCCT	2	12	4207506	4207517	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017933	TCATTT	2	12	4222050	4222061	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.