MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017440	GAAGGA	2	12	760	771	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017440	CAAAAA	2	12	6252	6263	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017440	GAAAAG	2	12	56311	56322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017440	AGTTGT	2	12	57659	57670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017440	TCTTGT	2	12	58577	58588	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017440	AAAAAT	2	12	60882	60893	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017440	ATCTAG	2	12	76611	76622	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017440	TTTTAG	2	12	115883	115894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017440	TAAAAA	2	12	120479	120490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017440	AGAAAA	2	12	182534	182545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017440	TATGAA	2	12	195342	195353	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017440	TTTTAC	2	12	221354	221365	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017440	AACCCT	2	12	255071	255082	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017440	ATTTTT	2	12	255875	255886	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017440	AGGAGA	2	12	270977	270988	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017440	ATATTA	2	12	279875	279886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017440	AAAAAG	2	12	324039	324050	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017440	AGAATA	2	12	361511	361522	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017440	TTTTAA	2	12	409667	409678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017440	TAACTA	2	12	503196	503207	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017440	AAGAAA	2	12	503209	503220	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017440	AGAATA	2	12	509184	509195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017440	AACTAA	2	12	514917	514928	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017440	TCCCTC	2	12	548644	548655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017440	AAAAAT	2	12	566616	566627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017440	TAGGGG	2	12	605784	605795	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017440	TCTTTT	2	12	617779	617790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017440	TTATTT	2	12	648988	648999	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017440	TATTTT	2	12	754934	754945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017440	GAGAAA	2	12	802398	802409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017440	TTTTCT	2	12	804856	804867	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017440	ATTTTT	2	12	808635	808646	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017440	TTTTTA	2	12	835073	835084	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017440	TAAGGA	2	12	856037	856048	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017440	CCGGAG	2	12	856955	856966	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017440	CCTCTA	2	12	870101	870112	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017440	TAAGGA	2	12	878083	878094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017440	CCGGAG	2	12	879001	879012	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017440	GACGGC	2	12	921432	921443	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017440	AAACAA	2	12	923120	923131	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017440	TTGTAA	2	12	1014628	1014639	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017440	ATTTTT	2	12	1038607	1038618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017440	TAAAAT	2	12	1042232	1042243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.