MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis G/11074 chromosome

Total Repeats: 2677

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017440	CAAA	2	8	596806	596813	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1502	NC_017440	GGC	2	6	596814	596819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017440	TA	3	6	596833	596838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017440	CA	3	6	596851	596856	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_017440	GAA	2	6	596951	596956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_017440	A	6	6	597047	597052	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_017440	A	6	6	597094	597099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017440	ACCT	2	8	598005	598012	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_017440	TACA	2	8	598027	598034	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_017440	AG	3	6	598041	598046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_017440	GCA	2	6	598088	598093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_017440	A	7	7	598127	598133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_017440	TAT	2	6	601306	601311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017440	T	12	12	601314	601325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017440	AGCA	2	8	601326	601333	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1516	NC_017440	A	6	6	601343	601348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017440	TAC	2	6	601350	601355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_017440	GA	3	6	603042	603047	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017440	TAG	2	6	603645	603650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017440	AGA	2	6	603660	603665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017440	GGA	2	6	603683	603688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_017440	T	6	6	605626	605631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017440	TTC	2	6	605654	605659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017440	CCT	2	6	605673	605678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_017440	CTAC	2	8	605715	605722	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_017440	TAGGGG	2	12	605784	605795	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017440	TA	3	6	605954	605959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017440	AGA	2	6	605991	605996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017440	CCA	2	6	606008	606013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_017440	TTA	2	6	606041	606046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_017440	TC	3	6	606056	606061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_017440	TCT	2	6	606148	606153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017440	CTT	2	6	606164	606169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_017440	CAA	2	6	606172	606177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_017440	TTGC	2	8	606259	606266	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_017440	CCT	2	6	606289	606294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_017440	CT	3	6	606647	606652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_017440	A	6	6	607149	607154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_017440	TTC	2	6	607900	607905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_017440	T	6	6	607936	607941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_017440	A	10	10	607989	607998	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017440	T	7	7	611108	611114	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_017440	ACC	2	6	611129	611134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_017440	ACT	2	6	611160	611165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_017440	TC	3	6	611183	611188	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1546	NC_017440	TAT	2	6	611189	611194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_017440	AC	3	6	611207	611212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_017440	ATCC	2	8	611227	611234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_017440	CGC	2	6	611241	611246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_017440	CT	3	6	611264	611269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1551	NC_017440	TCT	2	6	611289	611294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017440	GAC	2	6	611326	611331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_017440	TAC	2	6	611334	611339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_017440	ATG	2	6	611351	611356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017440	A	6	6	611386	611391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_017440	AC	3	6	611459	611464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1557	NC_017440	CTC	2	6	616600	616605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1558	NC_017440	A	6	6	616697	616702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017440	CT	3	6	616711	616716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_017440	AG	3	6	616753	616758	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_017440	A	6	6	616766	616771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_017440	GGAA	2	8	616781	616788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017440	A	7	7	616793	616799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017440	TATT	2	8	617693	617700	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017440	TAA	2	6	617702	617707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017440	AAAT	2	8	617725	617732	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017440	T	7	7	617732	617738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017440	TCTTTT	2	12	617779	617790	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1569	NC_017440	T	6	6	617787	617792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_017440	ATG	2	6	617793	617798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_017440	TTA	2	6	617807	617812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_017440	T	6	6	620309	620314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_017440	CAG	2	6	620352	620357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_017440	CT	3	6	621677	621682	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_017440	CAT	2	6	622232	622237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1579	NC_017440	GAAA	2	8	622413	622420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_017440	GAA	2	6	622558	622563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_017440	AGA	2	6	622590	622595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017440	CGA	2	6	622624	622629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017440	CTT	2	6	622688	622693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_017440	AC	4	8	622725	622732	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1589	NC_017440	TC	3	6	622994	622999	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1590	NC_017440	CCG	2	6	623040	623045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1591	NC_017440	A	7	7	623054	623060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_017440	CTTCT	2	10	623062	623071	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1593	NC_017440	CTC	2	6	623080	623085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1594	NC_017440	AAG	2	6	623120	623125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_017440	AGA	2	6	623184	623189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_017440	AAG	2	6	623240	623245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_017440	GAT	2	6	623427	623432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_017440	T	6	6	623460	623465	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_017440	TAAG	2	8	624745	624752	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_017440	A	6	6	624781	624786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_017440	AGA	2	6	624794	624799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_017440	GATT	2	8	624868	624875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1609	NC_017440	CCT	2	6	628532	628537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1610	NC_017440	T	6	6	629151	629156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_017440	CT	3	6	629236	629241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1612	NC_017440	TTTCC	2	10	629242	629251	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1613	NC_017440	CTTC	2	8	629277	629284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_017440	ATC	2	6	629290	629295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1616	NC_017440	GTGA	2	8	631751	631758	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_017440	TCT	2	6	633604	633609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_017440	AT	3	6	633628	633633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_017440	A	9	9	633636	633644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_017440	T	6	6	633668	633673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_017440	A	6	6	633735	633740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_017440	CCTG	2	8	633826	633833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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1624	NC_017440	CTCC	2	8	636661	636668	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1625	NC_017440	A	6	6	636669	636674	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017440	TTC	2	6	636682	636687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_017440	TTG	2	6	636708	636713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_017440	T	7	7	637181	637187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017440	ATTAA	2	10	637194	637203	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_017440	A	6	6	637248	637253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_017440	T	8	8	639560	639567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017440	TTC	2	6	639571	639576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1633	NC_017440	CCT	2	6	639585	639590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1634	NC_017440	CCT	2	6	640775	640780	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1636	NC_017440	A	6	6	645798	645803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_017440	A	8	8	645830	645837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_017440	T	7	7	645870	645876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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