MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis E/150 chromosome

Total Repeats: 2751

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017439	GTAT	2	8	173150	173157	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017439	TTA	2	6	173164	173169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017439	A	6	6	173169	173174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017439	ATT	2	6	173261	173266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017439	GGAA	2	8	178338	178345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
506	NC_017439	TGA	2	6	178372	178377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017439	TG	3	6	178449	178454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017439	TTGA	2	8	179531	179538	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017439	ATG	2	6	179550	179555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017439	TGA	3	9	179559	179567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017439	TGA	2	6	179593	179598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017439	TGA	2	6	180619	180624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017439	TTCC	2	8	180749	180756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017439	ACA	2	6	180776	180781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017439	TGT	2	6	180817	180822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017439	AAAC	2	8	180852	180859	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
517	NC_017439	AAAG	2	8	182127	182134	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017439	AAGA	2	8	182145	182152	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017439	T	8	8	182169	182176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017439	AGAAAA	2	12	182187	182198	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017439	A	7	7	182195	182201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017439	TCG	2	6	182236	182241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017439	TGT	2	6	182248	182253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017439	T	6	6	182266	182271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017439	T	7	7	182273	182279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017439	AAAG	2	8	182325	182332	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017439	ACT	2	6	182885	182890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_017439	TAG	2	6	182919	182924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017439	GCA	2	6	182974	182979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_017439	TCGC	2	8	183017	183024	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
531	NC_017439	AGA	2	6	183028	183033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017439	GCA	2	6	183037	183042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_017439	GAA	2	6	183065	183070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017439	AGA	2	6	183104	183109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017439	GA	3	6	183246	183251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017439	GTT	2	6	183257	183262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017439	GAG	2	6	183278	183283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017439	GAA	2	6	183298	183303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017439	TTG	2	6	183309	183314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017439	AGG	2	6	183348	183353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017439	AGA	2	6	183444	183449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017439	TGA	2	6	183466	183471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017439	CAG	3	9	183539	183547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_017439	GTA	2	6	183582	183587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017439	GTTG	2	8	183622	183629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017439	GGA	3	9	183637	183645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017439	TC	3	6	183653	183658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
548	NC_017439	ATT	2	6	183672	183677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017439	A	7	7	183702	183708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017439	T	8	8	183714	183721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017439	ATA	2	6	183764	183769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017439	A	6	6	183769	183774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017439	TAT	2	6	183845	183850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017439	GA	3	6	183885	183890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017439	GTT	2	6	185207	185212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017439	GTT	4	12	185605	185616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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558	NC_017439	T	7	7	185630	185636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017439	T	7	7	185642	185648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017439	T	7	7	185693	185699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017439	A	7	7	185715	185721	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017439	T	6	6	185738	185743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017439	T	7	7	185833	185839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017439	TCT	2	6	185857	185862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_017439	TG	3	6	185867	185872	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017439	GTC	2	6	185958	185963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_017439	TCT	2	6	186047	186052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_017439	CTT	2	6	186063	186068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_017439	AAGC	2	8	186101	186108	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
571	NC_017439	GAA	2	6	186131	186136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017439	AAC	2	6	186208	186213	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_017439	TA	3	6	186285	186290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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575	NC_017439	TAG	2	6	186312	186317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_017439	AAG	2	6	186678	186683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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591	NC_017439	T	8	8	186880	186887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017439	A	6	6	186922	186927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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596	NC_017439	TAG	2	6	187354	187359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017439	GAT	2	6	187392	187397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017439	TTA	2	6	187427	187432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017439	ATC	2	6	187434	187439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017439	CGATA	2	10	187462	187471	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
602	NC_017439	T	6	6	187475	187480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017439	TCC	2	6	187495	187500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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605	NC_017439	AGT	2	6	187519	187524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017439	AAAC	2	8	187544	187551	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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608	NC_017439	AGT	2	6	187678	187683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017439	AGT	2	6	187701	187706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017439	TTG	2	6	187709	187714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017439	TAT	2	6	187789	187794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_017439	T	6	6	187808	187813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017439	GCA	2	6	187861	187866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017439	CTT	2	6	187876	187881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_017439	GGAC	2	8	187903	187910	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
616	NC_017439	AAG	2	6	188013	188018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017439	TTG	2	6	188035	188040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017439	CAT	2	6	188045	188050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_017439	T	7	7	188084	188090	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017439	TAA	2	6	188163	188168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017439	TTG	2	6	188191	188196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017439	CTC	2	6	188266	188271	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
623	NC_017439	CAC	2	6	188312	188317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_017439	TAC	2	6	188393	188398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017439	CAT	2	6	188409	188414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017439	CTC	2	6	188625	188630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_017439	TTA	2	6	188649	188654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017439	AT	3	6	192344	192349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017439	TGT	2	6	192358	192363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017439	AAG	2	6	192906	192911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017439	T	6	6	192956	192961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017439	ATT	2	6	192969	192974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_017439	T	6	6	192985	192990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
634	NC_017439	TATGAA	2	12	194961	194972	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017439	AGA	2	6	195017	195022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017439	AAC	2	6	195024	195029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_017439	ATA	2	6	195044	195049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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