MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 2323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_017437	AG	3	6	917962	917967	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_017437	CAT	2	6	918023	918028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_017437	AG	3	6	918077	918082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_017437	CG	3	6	918587	918592	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2005	NC_017437	T	6	6	918601	918606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_017437	ATG	2	6	918736	918741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2007	NC_017437	AAG	2	6	918771	918776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2008	NC_017437	CTA	2	6	918787	918792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_017437	TTTG	2	8	922014	922021	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2010	NC_017437	A	7	7	922031	922037	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_017437	GCT	2	6	922064	922069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_017437	TCC	2	6	923212	923217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_017437	T	8	8	923247	923254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2014	NC_017437	AGA	2	6	923634	923639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_017437	CAA	2	6	923875	923880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2016	NC_017437	AAAG	2	8	923900	923907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_017437	TAG	2	6	923917	923922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_017437	GTT	2	6	923987	923992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_017437	TCC	2	6	923995	924000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2020	NC_017437	AG	3	6	924068	924073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_017437	TGC	2	6	924113	924118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2023	NC_017437	AGG	3	9	924153	924161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_017437	GTA	2	6	924210	924215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2035	NC_017437	A	7	7	925810	925816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2037	NC_017437	AGA	2	6	925870	925875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2041	NC_017437	GTA	2	6	930772	930777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2045	NC_017437	AGC	2	6	933278	933283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2051	NC_017437	TATT	2	8	937167	937174	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2052	NC_017437	GA	3	6	937225	937230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2053	NC_017437	AG	3	6	937276	937281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_017437	GAG	3	9	937279	937287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2135	NC_017437	TCTT	2	8	976517	976524	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2136	NC_017437	AG	3	6	976630	976635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.