MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis A2497 chromosome

Total Repeats: 2323

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017437	CAATA	2	10	226260	226269	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
502	NC_017437	TAA	2	6	227233	227238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017437	AAAC	2	8	227249	227256	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
504	NC_017437	T	8	8	229724	229731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017437	TCCT	2	8	229874	229881	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017437	AAC	2	6	236365	236370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_017437	AGA	2	6	236392	236397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017437	GAG	2	6	236409	236414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017437	GCT	2	6	236461	236466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_017437	ACC	2	6	236470	236475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
511	NC_017437	A	6	6	236501	236506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017437	ACT	2	6	236565	236570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_017437	CA	3	6	245342	245347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
514	NC_017437	TCT	2	6	245427	245432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017437	AAAT	2	8	245491	245498	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017437	TAAA	2	8	248945	248952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017437	ATA	2	6	248967	248972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017437	TTA	2	6	248988	248993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017437	T	6	6	249945	249950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017437	TACAA	2	10	249974	249983	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
521	NC_017437	ATA	2	6	250006	250011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017437	GA	3	6	252427	252432	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017437	GCG	2	6	252467	252472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017437	ACT	2	6	252487	252492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_017437	TG	3	6	252537	252542	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017437	AATA	2	8	252604	252611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017437	T	6	6	252626	252631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017437	T	7	7	252645	252651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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531	NC_017437	CAA	2	6	253294	253299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_017437	AG	3	6	253339	253344	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017437	A	8	8	253345	253352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017437	AAG	2	6	253363	253368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017437	TCC	2	6	254203	254208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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537	NC_017437	TAT	2	6	254371	254376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017437	ACA	2	6	254412	254417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017437	A	6	6	254461	254466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017437	AAC	2	6	255520	255525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_017437	A	6	6	255534	255539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017437	TAA	2	6	255585	255590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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544	NC_017437	A	7	7	256208	256214	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017437	A	7	7	256649	256655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017437	ATA	2	6	256662	256667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017437	AACCCT	2	12	256708	256719	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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551	NC_017437	AAT	2	6	258368	258373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017437	AG	3	6	258430	258435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017437	A	8	8	258448	258455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017437	TC	3	6	258456	258461	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
555	NC_017437	TTG	2	6	259833	259838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017437	TTG	2	6	259894	259899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017437	ACT	2	6	259925	259930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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559	NC_017437	GTC	2	6	261873	261878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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561	NC_017437	TAG	2	6	265341	265346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017437	TTG	2	6	265818	265823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_017437	TTTCA	2	10	266080	266089	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
564	NC_017437	A	8	8	266174	266181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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566	NC_017437	CTA	2	6	266280	266285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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568	NC_017437	A	6	6	266328	266333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017437	A	6	6	269136	269141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017437	A	7	7	269873	269879	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017437	AGT	2	6	270085	270090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_017437	TC	4	8	287060	287067	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_017437	T	6	6	287188	287193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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605	NC_017437	TC	3	6	288808	288813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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608	NC_017437	TAA	2	6	289259	289264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017437	A	7	7	289263	289269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_017437	CT	3	6	289281	289286	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
611	NC_017437	TTC	2	6	289345	289350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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615	NC_017437	T	7	7	293816	293822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017437	A	6	6	293823	293828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017437	GTT	2	6	293857	293862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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621	NC_017437	ACAA	2	8	299549	299556	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
622	NC_017437	AAC	2	6	299565	299570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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625	NC_017437	CA	3	6	303627	303632	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_017437	ACTA	2	8	303695	303702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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