MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 2733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1004	NC_017436	CT	3	6	429147	429152	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_017436	A	6	6	429157	429162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_017436	T	6	6	429173	429178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_017436	AACT	2	8	430217	430224	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1008	NC_017436	GAT	2	6	430249	430254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017436	A	8	8	430297	430304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017436	A	7	7	430502	430508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017436	AG	3	6	430517	430522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017436	TAAAA	2	10	430549	430558	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017436	CAAA	2	8	430565	430572	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1014	NC_017436	A	7	7	430570	430576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017436	GA	3	6	432212	432217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017436	CTT	2	6	432219	432224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_017436	A	8	8	435309	435316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017436	TCT	2	6	436180	436185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_017436	AC	3	6	436210	436215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1020	NC_017436	AGAAA	2	10	436223	436232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_017436	A	7	7	436251	436257	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_017436	CTCTT	2	10	436262	436271	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1023	NC_017436	GAAGA	2	10	436272	436281	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_017436	ATG	2	6	436291	436296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1114	NC_017436	CAAAA	2	10	485185	485194	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1115	NC_017436	A	8	8	485191	485198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_017436	AC	3	6	485200	485205	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1117	NC_017436	GA	4	8	485245	485252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_017436	CA	3	6	485282	485287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1119	NC_017436	TC	3	6	485323	485328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1120	NC_017436	A	6	6	485331	485336	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1263	NC_017436	CAA	2	6	517166	517171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_017436	A	6	6	517170	517175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_017436	TTA	2	6	517177	517182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1267	NC_017436	T	6	6	517236	517241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_017436	GA	3	6	517249	517254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_017436	GAC	2	6	517278	517283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1271	NC_017436	ATA	2	6	517292	517297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1272	NC_017436	TACC	2	8	519106	519113	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1273	NC_017436	A	8	8	519131	519138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1274	NC_017436	CTCC	2	8	519140	519147	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1275	NC_017436	AGG	2	6	519154	519159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1413	NC_017436	TAAA	2	8	572318	572325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_017436	ATACT	2	10	572342	572351	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1415	NC_017436	TCT	2	6	572363	572368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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