MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-LC chromosome

Total Repeats: 2733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017436	T	7	7	187969	187975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017436	TAA	2	6	188048	188053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017436	TTG	2	6	188076	188081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017436	AAG	2	6	191877	191882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017436	TC	3	6	191887	191892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_017436	AT	3	6	192229	192234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017436	TGT	2	6	192243	192248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017436	ATGC	2	8	192603	192610	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
509	NC_017436	GTT	2	6	192611	192616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017436	GCA	2	6	192664	192669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_017436	CTTT	2	8	192744	192751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
512	NC_017436	AAG	2	6	192791	192796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017436	T	6	6	192841	192846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_017436	ATT	2	6	192854	192859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017436	T	6	6	192870	192875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017436	TATGAA	2	12	194846	194857	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017436	AGA	2	6	194902	194907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017436	AAC	2	6	194909	194914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_017436	ATA	2	6	194929	194934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017436	T	7	7	194954	194960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_017436	TGA	2	6	195064	195069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_017436	CTC	2	6	195838	195843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_017436	CTA	2	6	196160	196165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_017436	ATTT	2	8	196193	196200	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017436	A	7	7	196679	196685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_017436	AG	3	6	196701	196706	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017436	AAT	2	6	196711	196716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017436	T	8	8	196731	196738	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017436	T	6	6	196777	196782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017436	TAC	2	6	196821	196826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_017436	ATT	2	6	196830	196835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017436	ACGA	2	8	202311	202318	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
533	NC_017436	CTAAG	2	10	202477	202486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
534	NC_017436	T	6	6	202585	202590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017436	GAAA	2	8	202597	202604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017436	A	7	7	202602	202608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017436	T	6	6	203375	203380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_017436	CAT	2	6	203404	203409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_017436	CT	3	6	203450	203455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
540	NC_017436	AAT	2	6	203497	203502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017436	TAG	2	6	203533	203538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017436	AAT	2	6	203546	203551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017436	AAG	2	6	203644	203649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017436	GA	4	8	206509	206516	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017436	T	7	7	206539	206545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017436	CT	4	8	206557	206564	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
547	NC_017436	A	6	6	206566	206571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017436	CCTT	2	8	215731	215738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_017436	GAA	2	6	215753	215758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017436	TTG	2	6	215770	215775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017436	A	6	6	215782	215787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017436	A	7	7	217798	217804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017436	TAA	2	6	217805	217810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017436	AG	4	8	217830	217837	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017436	A	6	6	217855	217860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017436	GAA	2	6	217865	217870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017436	TA	3	6	219384	219389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017436	GTC	2	6	219403	219408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_017436	CTAT	2	8	219458	219465	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
560	NC_017436	T	6	6	219474	219479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_017436	ATT	2	6	219576	219581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017436	TCT	2	6	219601	219606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_017436	TCC	2	6	219653	219658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_017436	ATG	2	6	219676	219681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017436	GCAA	2	8	219701	219708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
566	NC_017436	TTTTAC	2	12	220860	220871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
567	NC_017436	A	7	7	220922	220928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017436	TAA	2	6	220976	220981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017436	ATTTC	2	10	221003	221012	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
570	NC_017436	CT	3	6	221024	221029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
571	NC_017436	CTTG	2	8	221385	221392	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
572	NC_017436	T	6	6	221440	221445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017436	TC	3	6	224025	224030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
574	NC_017436	AG	3	6	224056	224061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017436	CAATA	2	10	224126	224135	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
576	NC_017436	TAA	2	6	225099	225104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017436	AAAC	2	8	225115	225122	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
578	NC_017436	T	8	8	227590	227597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017436	TGT	2	6	227659	227664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017436	TCCT	2	8	227740	227747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
581	NC_017436	AAC	2	6	234231	234236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_017436	AGA	2	6	234258	234263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017436	GAG	2	6	234275	234280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017436	GCT	2	6	234327	234332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_017436	ACC	2	6	234336	234341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
586	NC_017436	A	6	6	234367	234372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017436	ACT	2	6	234431	234436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_017436	CA	3	6	243206	243211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
589	NC_017436	AAAT	2	8	243355	243362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017436	AAGA	2	8	243374	243381	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_017436	GT	3	6	243423	243428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017436	T	6	6	243434	243439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_017436	TAAA	2	8	246809	246816	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017436	ATA	2	6	246831	246836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_017436	TTA	2	6	246852	246857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_017436	T	6	6	247809	247814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_017436	TACAA	2	10	247838	247847	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
598	NC_017436	ATA	2	6	247870	247875	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_017436	GA	3	6	250291	250296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
600	NC_017436	ACT	2	6	250351	250356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_017436	TG	3	6	250401	250406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
602	NC_017436	AATA	2	8	250468	250475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_017436	T	6	6	250490	250495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_017436	T	7	7	250509	250515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_017436	A	6	6	250517	250522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_017436	ACA	2	6	250617	250622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017436	CTT	2	6	250624	250629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017436	AAG	2	6	250655	250660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
609	NC_017436	GCA	2	6	250674	250679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017436	TTG	2	6	250694	250699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017436	CAA	2	6	251158	251163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017436	AG	3	6	251203	251208	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_017436	A	8	8	251209	251216	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017436	AAG	2	6	251227	251232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017436	TCC	2	6	252067	252072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_017436	GAAA	2	8	252088	252095	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017436	T	7	7	252109	252115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017436	GCAG	2	8	252137	252144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
619	NC_017436	AGAA	2	8	252170	252177	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017436	AG	3	6	252212	252217	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017436	TAT	2	6	252235	252240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017436	ACA	2	6	252276	252281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017436	A	6	6	252325	252330	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017436	AAC	2	6	253384	253389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_017436	A	6	6	253398	253403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017436	TAA	2	6	253449	253454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017436	TA	3	6	254018	254023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017436	CCAA	2	8	254053	254060	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
629	NC_017436	A	7	7	254077	254083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017436	A	7	7	254518	254524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_017436	ATA	2	6	254531	254536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_017436	AACCCT	2	12	254577	254588	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
633	NC_017436	AAAC	2	8	254651	254658	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
634	NC_017436	ATTTTT	2	12	255372	255383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
635	NC_017436	GAG	2	6	255500	255505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
636	NC_017436	TAT	2	6	256204	256209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
637	NC_017436	ATA	2	6	256213	256218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
638	NC_017436	AAT	2	6	256237	256242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_017436	AG	3	6	256299	256304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
640	NC_017436	A	8	8	256317	256324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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