MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 343

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017434	TC	3	6	225	230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017434	AG	3	6	247	252	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017434	TC	3	6	1670	1675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017434	GA	3	6	6998	7003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017434	TA	3	6	11248	11253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017434	TA	3	6	13339	13344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017434	TA	4	8	13563	13570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017434	AG	3	6	17515	17520	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017434	GA	3	6	17528	17533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017434	AG	3	6	20516	20521	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017434	GA	3	6	20674	20679	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017434	AG	3	6	21191	21196	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017434	CT	3	6	21260	21265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_017434	GA	3	6	26512	26517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017434	CT	3	6	26519	26524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017434	TC	3	6	27887	27892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017434	AG	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017434	GA	3	6	36384	36389	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017434	AT	3	6	36486	36491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017434	CT	3	6	38753	38758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017434	CT	3	6	40124	40129	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017434	AG	3	6	40600	40605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017434	GC	3	6	40649	40654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017434	GA	3	6	40814	40819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017434	TC	3	6	40823	40828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017434	GC	3	6	40888	40893	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017434	GA	3	6	41028	41033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017434	CT	3	6	42316	42321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017434	GA	5	10	42592	42601	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017434	TC	3	6	43808	43813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017434	AG	3	6	48043	48048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017434	TG	4	8	51391	51398	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017434	GA	3	6	55601	55606	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017434	GA	3	6	60679	60684	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017434	AG	4	8	64704	64711	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017434	TA	3	6	69035	69040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017434	CT	3	6	71771	71776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017434	TA	3	6	85132	85137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017434	TG	3	6	87221	87226	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017434	GA	3	6	90485	90490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017434	CT	3	6	92835	92840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017434	GA	3	6	93363	93368	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017434	AT	3	6	99912	99917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017434	TA	3	6	106588	106593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017434	TG	3	6	115830	115835	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017434	AG	4	8	118417	118424	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017434	GA	3	6	120239	120244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017434	TA	3	6	122474	122479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017434	CT	3	6	127996	128001	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_017434	TC	3	6	130318	130323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017434	AG	3	6	130395	130400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017434	AG	3	6	130420	130425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017434	AT	3	6	142376	142381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017434	GA	3	6	151614	151619	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017434	AG	3	6	152731	152736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017434	AG	3	6	157183	157188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017434	TC	3	6	171647	171652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017434	AG	3	6	171779	171784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017434	CT	3	6	171797	171802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017434	TG	3	6	178288	178293	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017434	GA	3	6	183774	183779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017434	TC	3	6	191889	191894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017434	AT	3	6	192231	192236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017434	AG	3	6	196703	196708	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017434	CT	3	6	203452	203457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017434	GA	4	8	206511	206518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017434	CT	4	8	206559	206566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017434	AG	4	8	217832	217839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017434	TA	3	6	219386	219391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017434	CT	3	6	221026	221031	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_017434	TC	3	6	224027	224032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017434	AG	3	6	224058	224063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017434	CA	3	6	243208	243213	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017434	GT	3	6	243425	243430	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017434	GA	3	6	250293	250298	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017434	TG	3	6	250403	250408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017434	AG	3	6	251205	251210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017434	AG	3	6	252214	252219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017434	TA	3	6	254020	254025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017434	AG	3	6	256301	256306	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017434	TC	3	6	256327	256332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017434	AG	3	6	257805	257810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017434	TA	3	6	264168	264173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017434	TC	3	6	267875	267880	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017434	TA	3	6	273428	273433	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017434	AT	4	8	283988	283995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017434	CT	3	6	284840	284845	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017434	TC	4	8	284931	284938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017434	TC	3	6	286622	286627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017434	TC	3	6	286679	286684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017434	CT	3	6	287152	287157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_017434	AT	3	6	299170	299175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017434	CA	3	6	301499	301504	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017434	GA	3	6	306230	306235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017434	TA	3	6	307923	307928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017434	GA	3	6	308131	308136	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017434	TG	3	6	308341	308346	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017434	TG	3	6	308363	308368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017434	AG	3	6	315436	315441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017434	CT	3	6	347387	347392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017434	CT	3	6	350458	350463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017434	TC	3	6	354684	354689	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017434	TC	3	6	358514	358519	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017434	CT	3	6	358600	358605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017434	AC	3	6	361933	361938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017434	GA	3	6	363843	363848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017434	TC	3	6	363921	363926	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017434	TA	3	6	364122	364127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017434	GT	3	6	367382	367387	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017434	CT	4	8	381150	381157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017434	GA	3	6	385857	385862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017434	CA	3	6	392038	392043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017434	TC	3	6	394585	394590	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017434	CT	3	6	395075	395080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017434	GA	3	6	395205	395210	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017434	GA	3	6	395336	395341	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017434	CT	3	6	410419	410424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_017434	CT	3	6	429149	429154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017434	AG	3	6	430519	430524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017434	GA	3	6	432214	432219	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017434	AC	3	6	436212	436217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017434	CT	3	6	440483	440488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017434	AC	3	6	440521	440526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017434	CA	3	6	442990	442995	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017434	CT	3	6	444394	444399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017434	CT	3	6	453676	453681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017434	AG	3	6	459817	459822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017434	TC	3	6	466355	466360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017434	AT	3	6	466424	466429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017434	GA	4	8	467798	467805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017434	TA	3	6	467841	467846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017434	GA	3	6	467939	467944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017434	TC	3	6	479671	479676	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017434	AC	3	6	485202	485207	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017434	GA	4	8	485247	485254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017434	CA	3	6	485284	485289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_017434	TC	3	6	485325	485330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017434	AG	3	6	488690	488695	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017434	GC	3	6	488938	488943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_017434	AC	3	6	489760	489765	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017434	AG	3	6	489922	489927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017434	CT	3	6	489941	489946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017434	GA	3	6	491318	491323	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017434	CT	3	6	493220	493225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_017434	CT	3	6	493738	493743	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017434	TG	3	6	493771	493776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017434	TA	3	6	493884	493889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017434	CT	4	8	499541	499548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017434	CT	3	6	508549	508554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017434	TA	3	6	514352	514357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017434	AG	3	6	516250	516255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017434	TC	3	6	517096	517101	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017434	GA	3	6	517251	517256	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017434	AG	3	6	517287	517292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.