MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Chlamydia trachomatis D-EC chromosome

Total Repeats: 2734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017434	ATCC	2	8	610902	610909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1503	NC_017434	CT	3	6	610939	610944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1504	NC_017434	TCT	2	6	610964	610969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_017434	GAC	2	6	611001	611006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_017434	TAC	2	6	611009	611014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_017434	ATG	2	6	611026	611031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_017434	A	6	6	611061	611066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_017434	AC	3	6	611134	611139	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1510	NC_017434	CTC	2	6	616275	616280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1511	NC_017434	A	6	6	616372	616377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_017434	CT	3	6	616386	616391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_017434	AG	3	6	616428	616433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_017434	A	6	6	616441	616446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_017434	GGAA	2	8	616456	616463	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_017434	A	7	7	616468	616474	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_017434	TATT	2	8	617368	617375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_017434	TAA	2	6	617377	617382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_017434	AAAT	2	8	617400	617407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_017434	T	7	7	617407	617413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017434	CTT	2	6	618479	618484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_017434	T	6	6	619984	619989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_017434	CAG	2	6	620027	620032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_017434	CT	3	6	621352	621357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1525	NC_017434	T	7	7	621380	621386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_017434	T	6	6	621391	621396	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_017434	GTT	2	6	621410	621415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_017434	T	6	6	621426	621431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_017434	TTCT	2	8	621441	621448	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1531	NC_017434	CT	3	6	621993	621998	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1532	NC_017434	TCT	2	6	623051	623056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_017434	GAT	2	6	623102	623107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_017434	T	6	6	623135	623140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_017434	TAAG	2	8	624420	624427	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1539	NC_017434	T	6	6	628202	628207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_017434	CCT	2	6	628208	628213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1541	NC_017434	T	6	6	628827	628832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_017434	CT	3	6	628912	628917	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_017434	TTTCC	2	10	628918	628927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1544	NC_017434	ATC	2	6	628966	628971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1547	NC_017434	AT	3	6	633304	633309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_017434	A	8	8	633312	633319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_017434	T	6	6	633343	633348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_017434	A	6	6	633410	633415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_017434	CCTG	2	8	633501	633508	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_017434	A	8	8	636325	636332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_017434	CTCC	2	8	636336	636343	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1554	NC_017434	A	6	6	636344	636349	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_017434	TTC	2	6	636357	636362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1558	NC_017434	ATTAA	2	10	636869	636878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_017434	A	6	6	636923	636928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1562	NC_017434	A	6	6	645473	645478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_017434	A	8	8	645505	645512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_017434	T	7	7	645545	645551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_017434	A	6	6	645555	645560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_017434	A	7	7	645562	645568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_017434	GA	3	6	648438	648443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_017434	GA	3	6	648450	648455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1571	NC_017434	A	8	8	648505	648512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_017434	AC	3	6	648526	648531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_017434	GCT	2	6	648532	648537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1575	NC_017434	TTA	2	6	648576	648581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_017434	ATTA	2	8	648607	648614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1580	NC_017434	TCGTC	2	10	649767	649776	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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1588	NC_017434	A	7	7	653778	653784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_017434	A	6	6	653794	653799	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1593	NC_017434	A	6	6	656017	656022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1599	NC_017434	ATC	2	6	658440	658445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1602	NC_017434	AAC	2	6	659668	659673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_017434	CTA	2	6	661732	661737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_017434	GGA	2	6	661790	661795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1606	NC_017434	C	6	6	663175	663180	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1607	NC_017434	CTC	2	6	663230	663235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1608	NC_017434	A	7	7	663241	663247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_017434	T	6	6	665248	665253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_017434	CTT	2	6	665262	665267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_017434	AAG	2	6	665280	665285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_017434	T	6	6	665287	665292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_017434	TCT	2	6	665299	665304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1619	NC_017434	CT	3	6	670107	670112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1623	NC_017434	A	6	6	673345	673350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_017434	TC	4	8	673352	673359	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1625	NC_017434	AGA	2	6	673366	673371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_017434	GAT	2	6	673383	673388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1628	NC_017434	AAGA	2	8	673495	673502	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_017434	CA	3	6	673532	673537	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_017434	AC	3	6	673550	673555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_017434	GAAT	2	8	673567	673574	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_017434	CAT	2	6	673576	673581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1634	NC_017434	CCT	2	6	673636	673641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1635	NC_017434	CTC	2	6	673684	673689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_017434	CAT	2	6	673693	673698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1638	NC_017434	GAAG	2	8	674605	674612	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1639	NC_017434	CT	3	6	676740	676745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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